新药研究相关数据库简介及检索方法(四)
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发布日期: 2006-08-03 10:29 文章来源: 丁香园
关键词: 新药数据库 检索技巧 ChemPrep数据库 点击次数:

        f) 点击“Show Result”或“Results/Search results”,可以看检索结果,如下图:

        检索结果中,在上方的三个小方框中的PIC 相当于对这篇文献做标记,IDS 是申请原文投递的Form,RAP 也是做标记,用于打印时只打印做标记的文献。

        g) 为把某次检索的结果储存,点击“File/Export Records”,再根椐弹出的画面选择储存的文件名、路径(需要注意的是:选择盘符时要选择V、U 等,分别对应于用户电脑的C、D 等)、文件类型等。储存的文件中不包括反应图。

        为把某次检索的结果打印,点击“File/Print list”,再根据弹出的画面选择打印机、打印范围等。建议保存后再打印,这样速度上会快点,节约时间。

        h) 为把检索提问储存,点击“File/Save Lists”,再根据弹出的画面键入一个以 .lst 为后缀的文件名,并选择储存哪一集合的清单。这一清单可在以后用“File/Restore Lists”调用。调用的 .lst 中包括这一集合的检索提问,调入后形成一个新的集合。如果打开的数据库与原先一样,则结果也一样,下次检索可以直接看结果,如果打开的数据库与原先不同,只能调用提问,再点击“Search”按钮检索,形成一个新集合。“File/Save Lists”储存的内容是提问加结果。如果只要储存提问,点击“Search/Save Text Query”,今后要调用时,点击“Search/Restore Text Query”。

        i) 为把检索结果的反应图储存,点击“Edit/Copy Graphical Abstracts”,再调用Word,利用字处理软件粘贴到Word 文件中。也可粘贴到ISIS/Draw 中。建议在拷贝前,用“View/Zoom”放大后拷贝的效果会更好。

        j) ChemPrep 的文本检索功能还包括浏览功能,一是按期刊名浏览,另一种是按季度浏览。按季度浏览在新文献检索时还是有一定意义的。

        k) ChemPrep 可以限制检索结果只是在某一季度的文献中,它是在前次检索的基础上执行的。点击“Search/Limit”,再从弹出的窗口中点亮所要限定的范围,再点击“Search”按钮检索,即可。

        l ) ChemPrep 可以处理前几次检索结果间的集合逻辑运算, 点击“Search/Combine Search Sets”即可。

        3. ChemPrep 的结构检索功能

        对于化学反应的检索,结构检索是重要特点。

        3.1 结构检索基础操作:如查阅某一化合物的合成,步骤如下:

        a) 点击“Search/Reaction Structure Search”进入结构检索的画结构图画面。

        b) ChemPrep 提供的是PSI 画结构程序,画面左边是工具条,底部是键和原子调用工具。画图主要利用工具条的笔、常用环模板、链长定义;利用键和原子调用工具。

        c) 点击“Search/Preferences”可进行一些反应方面的定义,如“Exact Search”等。如果定义“Exact Search”表示进行确定结构检索,如果希望在显示结果时,命中一个停顿一下,则选择“Prompt after hits”、“Prompt after screen”。有时这样处理会对评价检索结果有好处。

        d) 点击“Search/Start”进行结构检索,完成后弹出一名为“Name Current Search Hitlist”对话框,可以自定义一个命中清单名或利用显示的缺省名,点击OK。

        e) 点击“Search/Return to Main”储存结构提问,可任选一文件名,并注意路径,点击OK,出现结构证实界面,可选择证实与否。

        f) 接着出现“Name Search”对话框,可自定义一个名或用系统显示的缺省名。

        g) 进入ChemPrep 主画面,点击“Results/Search Results”可看到检索结果。

        h) 请注意“View”框中的选择:Article、Reaction、Author-Title。选择Article显示检出文献的文本信息及这篇文献中的主要反应、选择Reaction 显示与提问结构匹配的反应。选择Author-Title 在屏幕上部只显示所有检出文献的作者名和文献标题。

        i) 在选择Reaction 显示时,点击“Search/Reaction Structure Search”可把显示的反应拷贝到Structure Drawing 的Query Mode 画面,用作以后的反应检索的提问。

        j) 有关检出结果的储存处理与文本检索部分相同。

        3.2 某一化合物用作反应产物的检索:

        按照3.1b)操作,画出提问结构,如果提问结构以前已经画过,可以点击“Search/Open Query”调用提问结构。

        a) 点击“Display/Show Reaction”使之为Show Reaction 模式,点击工具条“A→B”按钮,点击“Display/Show Reaction”,使解除show Reaction 模式,点击提问分子任意一点,出现一个对话框,此时可以定义提问分子为反应物还是反应产物。根据要求,我们定义为Products,再点击OK,点击“Display/Show Reaction”使之为Show Reaction 模式,在提问分子下显示了Product。

        b) 点击“Search/Start”进行检索,此时检索结果的命中子结构在反应产物一边。

        c) 下面操作同3.1。


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   作者: Maxis


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