胸部肿瘤和内镜:肺腺癌组织细胞表达蛋白质组学的激光捕获显微切割联合高效液相色谱和电喷雾离子阱串联质谱研究
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发布日期: 2007-09-07 14:44 文章来源: 丁香园
关键词: 胸部肿瘤和内镜 肺腺癌 激光捕获 显微切割 高效液相色谱 电喷雾离子阱串联质谱 点击次数:

西安交通大学医学院第二附属医院(710004)
南岩东 杨拴盈 田应选 张 潍 周 斌 卜丽娜 霍树芬

    评价应用激光捕获显微切割(LCM)联合高效液相色谱(HPLC)、电喷雾(ESI)-离子阱串联质谱(ITTMS)技术分离、鉴定肺腺癌组织细胞表达蛋白质谱的方法,探讨肿瘤特异性蛋白在肺腺癌发病机制、早期诊断和鉴别诊断方面的价值。应用LCM 技术分离纯化6 例肺腺癌细胞,经细胞裂解、总蛋白提取及胰蛋白酶酶解后,对混合蛋白质的酶解肽段应用HPLC、ESI-ITTMS 获得其氨基酸序列;原始数据经BioworksTM 软件搜索IPI 人类蛋白数据库,鉴定肺腺癌细胞表达蛋白质谱;进一步利用GO 工具对所鉴定的蛋白质分别从细胞组件、分子功能、生物学途径等方面进行分析。应用LCM 技术成功地从肺腺癌组织中分离出感兴趣的细胞,其同质性>95%;通过HPLC、ESI- ITTMS 获得混合蛋白质的酶解肽段总离子流图、一级质谱图及二级质谱图;经数据库查询,鉴定出843 个蛋白质群(2023个蛋白质);分别对这些蛋白质及其酶解肽段的生物学属性(包括氨基酸序列、覆盖率、分子量、等电点等)进行了分析,并应用GO 工具明确所鉴定蛋白质功能。提示LCM 技术能够成功的分离感兴趣的细胞,较好的解决了肺癌组织异质性的问题;HPLC、ESI- ITTMS 可高通量、全景式、大规模地分离、鉴定肿瘤细胞表达蛋白质,从整体的角度研究肿瘤的发病机制。

   作者: 丁香园通讯员


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