胸部肿瘤和内镜:非小细胞肺癌和正常及良性肺疾病组织的激光捕获显微切割联合SELDI蛋白质芯片研究
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发布日期: 2007-09-07 14:52 文章来源: 丁香园
关键词: 胸部肿瘤和内镜 非小细胞肺癌 激光捕获 显微切割 SELDI 蛋白质芯片 点击次数:

西安交通大学医学院第二附属医院(710004)

杨拴盈 南岩东 田应选 张 潍 周 斌 卜丽娜 霍树芬

浙江大学医学院附属第二医院肿瘤研究所

余捷凯 郑 树

    探讨应用激光捕获显微切割(LCM)联合表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)蛋白质芯片技术检测非小细胞肺癌(NSCLC)和正常及良性肺疾病实质细胞表达蛋白质谱,筛选差异蛋白,构建标志蛋白组合模型的方法,评价标志蛋白在NSCLC 发病机制、早期诊断和鉴别诊断方面的价值。采用LCM 技术分别分离、纯化13 例NSCLC、11 例配对的正常肺组织及6 例良性肺疾病组织实质细胞,SELDI 蛋白质芯片技术筛选差异蛋白,支持向量机(SVM)建立判别模型,留一法验证判别效果。结果表明应用LCM 技术成功的分离出感兴趣的细胞,其同质性在3 组中均>95%;NSCLC和正常肺组织的质谱数据共测到123 个M/Z 峰,98 个M/Z 峰强度在两组间比较差异具有统计学意义(P<0.05),筛选出一个约登指数最高的组合模型,其3 个标志蛋白M/Z 分别为4282000、3201000和4252000,经留一法交叉验证,在测试集上的判别结果为特异性为90.91%,敏感度为100%,阳性预测值为92.86%;NSCLC 和良性肺疾病的质谱数据共测到188 个M/Z 峰,54 个M/Z 峰强度在两组间比较差异具有统计学意义(P<0.05),筛选出一约登指数最高的组合模型,其2 个标志蛋白的M/Z分别为 3204000 和3701000,经留一法交叉验证,在测试集上的判别结果为特异性为100%,敏感度为100%,阳性预测值为100%。提示LCM 技术能够成功的分离感兴趣的细胞,较好的解决了肺癌组织蛋白质组学研究中异质性的问题;SELDI 蛋白质芯片结合SVM 可有效筛选差异蛋白质;建立的标志蛋白组合模型具有灵敏度高、特异度强的特点。

   作者: 丁香园通讯员


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