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名称/参考文献

主要用途

网址

miRBase

Griffiths-Jones et al., 2008

miRNA序列注册，靶点预测，并提供序列信息

http://microrna.sanger.ac.uk

miRGen

Megraw et al., 2006

miRNA基因组信息，靶点预测，miRNA簇预测

http://www.diana.pcbi.upenn.edu/miRGen/v3/miRGen.htmL

TarBase

Sethupathy et al., 2006

收集实验验证的靶点

http://www.diana.pcbi.upenn.edu/tarbase.htmL

Argonaute 2

Shahi et al., 2006

miRNA来源，表达，功能

http://www.ma.uni-heidelberg.de/apps/zmf/argonaute

miRNAMap

Hsu et al.,2006

收集不同物种miRNA，表达及靶点信息

http://mirnamap.mbc.nctu.edu.tw

MicroRNA.org

Betel et al., 2008

靶点预测及miRNA表达

http://www.microrna.org/microrna/home.do

miTools

miRNA预测，靶点预测，miRNA启动子预测

http://wiki.binf.ku.dk/MicroRNA/miTools

SmiRNAdb

Landgraf et al., 2007

miRNA表达谱

www.mirz.unibas.ch/smiRNAdb

UTRsouse

UTR数据收集

http://bighost.area.ba.cnr.it/BIG/UTRHome

PolymiRTS

Bao et al., 2007

miRNA靶位点的多态性

http://compbio.utmem.edu/miRSNP/

miRNApath

Chiromatzo et al., 2007

miRNA所在的信号通路

http://lgmb.fmrp.usp.br/mirnapath

miRDB

Wang, 2008

miRNA 靶点预测及miRNA及靶基因功能注释

http://mirdb.org.

miR2Diseae

Jiang et al., 2009

在人类疾病中差异表达的miRNA数据库

http://www.miR2Disease.org.

CoGemiR

Maselli et al., 2008

miRNA基因定位、表达

http://cogemir.tigem.it