手把手教你使用Imagepro-Plus（12.macro-投机取巧之道）
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| 发布日期: 2006-10-31 21:09 | 文章来源: 丁香园 - 计算机与医学、生物学软件 |
关键词:
Imagepro-Plus
macro
IPP
批处理图片
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自从写了imagepro plus教学系列帖子“手把手教你使用IPP”以来，得到了不少好评。前两天这个帖子又被人翻了出来，发现它的点击已经升到了一万二。可见这个帖子还是有许多人看的。甚至把Media Cybnetics公司的工程师给招来了。他们才是真正的IPP高手，给了我很多指导，也教了我许多妙招。
无论是经常使用IPP还是第一次使用，如果需要分析测量一大批图片的话，都免不了要花费大量时间。为了省时省力，最好是制作一个宏操作来完成那些枯燥的一下下点鼠标动作。可是自己制作宏也是挺麻烦的。如果能找到一个现成的宏来处理图片就能省事了。在IPP公司的网站上就有大量这样的通用的宏程序，macro。
Media Cybnetics公司的软件工程师注意到了很多人都在使用IPP测量免疫组化图片的光密度，也注意到了论坛上大家讨论的分析免疫组化图片的方法，于是他们给大家编制了一个macro，专门用来方便地进行免疫组化图片的分析，这可是专业水平的macro。我近水楼台得到了一个试用版本，使用这个macro分析上百张免疫组化图片，不到一个小时就能全部搞定。好东西要大家分享，再写一篇“手把手教你使用IPP"。
先把这个试用版本传给大家，正式版本则需到Media Cybnetics网站上下载。
http://www.mediacy.com.cn/cn/index/index.asp
Pathology.scr (27.26k)
当然，如果你对IPP一点也不了解，是使用不了这个macro的。希望你看过了以前的手把手教你使用IPP的系列帖子。
http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=10&id=3554359&sty=1&tpg=2&age=0
特别是看过了第十一个关于免疫组化图片光密度测量的帖子（包括后面的跟帖）
http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=10&id=5923479&sty=1
这个macro基本上就是根据这个分析方法来分析测量免疫组化图片的。
下载了这个macro后，首先用记事本打开这个文件，在第三十几行上找到这句话：Shell（"c:\program files\microsoft office\office10\excel.exe"）。然后到你自己的电脑上按照这个路径看看。如果你安装的是officeXP，则能找到这个excel.exe文件。不同版本的office，其excel.exe文件的位置是不一样的。你需要在自己的电脑上找到excel.exe文件所在的路径，然后在记事本里修改这句命令，使它能正确地指到excel.exe文件。
一般office2000的系统要把这句话改为Shell（"c:\program files\microsoft office\office\excel.exe"），office2003的系统要把这句话改为Shell（"c:\program files\microsoft office\office11\excel.exe"）。改完后直接在记事本里点保存。
把保存好的文件另存到C盘IPP文件夹下面的scripts目录里。
启动IPP程序，点macro菜单下的macro命令。在macro窗口里点chang按纽。在弹出的打开文件窗口中选择pathology。再点OK关闭所有窗口。
这个macro就安装好了。
测量免疫组化图片光密度，实际上测量的就是一个平均光密度mean density。这就需要先测量一下有效测量区域的面积，再测量这个面积范围内目标染色区域的累积光密度值IOD。两者相除得到mean density。
作为一个特例，如果测量区域就是整张图片，可以直接测量IOD值。不必考虑面积区域。
以下图为例。图片中黄色染色区域主要集中于蓝色框住的区域内。测量平均光密度就要根据图片情况有三种选择：
1.测量整张图片黄色的IOD，除以整张图片面积。
2.测量整张图片黄色的IOD，除以红线框住区域的面积。（这是扣除空白区域）
3.测量蓝线所框区域的黄色IOD，除以蓝线框住区域的面积。（这是计算特定组织区域的染色平均光密度）
在许多情况下，都需要选择测量区域，作为特例，在测量区域充满整个画面时不需要考虑测量区域。
需要指出的是，使用IPP的count/size测量IOD及area时，测量出的面积area是选定的黄色染色区域的面积。用IOD除以这个面积一般来说是不准确的。它的意思是“黄色染色区域的平均光密度”。
所以使用这个宏进行测量时就有两件事要干：
1.画出测量区域
2.选择特定染色物的颜色。
无论是经常使用IPP还是第一次使用，如果需要分析测量一大批图片的话，都免不了要花费大量时间。为了省时省力，最好是制作一个宏操作来完成那些枯燥的一下下点鼠标动作。可是自己制作宏也是挺麻烦的。如果能找到一个现成的宏来处理图片就能省事了。在IPP公司的网站上就有大量这样的通用的宏程序，macro。
Media Cybnetics公司的软件工程师注意到了很多人都在使用IPP测量免疫组化图片的光密度，也注意到了论坛上大家讨论的分析免疫组化图片的方法，于是他们给大家编制了一个macro，专门用来方便地进行免疫组化图片的分析，这可是专业水平的macro。我近水楼台得到了一个试用版本，使用这个macro分析上百张免疫组化图片，不到一个小时就能全部搞定。好东西要大家分享，再写一篇“手把手教你使用IPP"。
先把这个试用版本传给大家，正式版本则需到Media Cybnetics网站上下载。
http://www.mediacy.com.cn/cn/index/index.asp
Pathology.scr (27.26k) 当然，如果你对IPP一点也不了解，是使用不了这个macro的。希望你看过了以前的手把手教你使用IPP的系列帖子。
http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=10&id=3554359&sty=1&tpg=2&age=0
特别是看过了第十一个关于免疫组化图片光密度测量的帖子（包括后面的跟帖）
http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=10&id=5923479&sty=1
这个macro基本上就是根据这个分析方法来分析测量免疫组化图片的。
下载了这个macro后，首先用记事本打开这个文件，在第三十几行上找到这句话：Shell（"c:\program files\microsoft office\office10\excel.exe"）。然后到你自己的电脑上按照这个路径看看。如果你安装的是officeXP，则能找到这个excel.exe文件。不同版本的office，其excel.exe文件的位置是不一样的。你需要在自己的电脑上找到excel.exe文件所在的路径，然后在记事本里修改这句命令，使它能正确地指到excel.exe文件。
一般office2000的系统要把这句话改为Shell（"c:\program files\microsoft office\office\excel.exe"），office2003的系统要把这句话改为Shell（"c:\program files\microsoft office\office11\excel.exe"）。改完后直接在记事本里点保存。
把保存好的文件另存到C盘IPP文件夹下面的scripts目录里。
启动IPP程序，点macro菜单下的macro命令。在macro窗口里点chang按纽。在弹出的打开文件窗口中选择pathology。再点OK关闭所有窗口。
这个macro就安装好了。
测量免疫组化图片光密度，实际上测量的就是一个平均光密度mean density。这就需要先测量一下有效测量区域的面积，再测量这个面积范围内目标染色区域的累积光密度值IOD。两者相除得到mean density。
作为一个特例，如果测量区域就是整张图片，可以直接测量IOD值。不必考虑面积区域。
以下图为例。图片中黄色染色区域主要集中于蓝色框住的区域内。测量平均光密度就要根据图片情况有三种选择：
1.测量整张图片黄色的IOD，除以整张图片面积。
2.测量整张图片黄色的IOD，除以红线框住区域的面积。（这是扣除空白区域）
3.测量蓝线所框区域的黄色IOD，除以蓝线框住区域的面积。（这是计算特定组织区域的染色平均光密度）
在许多情况下，都需要选择测量区域，作为特例，在测量区域充满整个画面时不需要考虑测量区域。
需要指出的是，使用IPP的count/size测量IOD及area时，测量出的面积area是选定的黄色染色区域的面积。用IOD除以这个面积一般来说是不准确的。它的意思是“黄色染色区域的平均光密度”。
所以使用这个宏进行测量时就有两件事要干：
1.画出测量区域
2.选择特定染色物的颜色。
作者: hbchendl
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