RNA测序样品质量要求
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发布日期: 2010-11-16 22:09 文章来源: 丁香园
关键词: 华大基因 RNA 测序 点击次数:

 1 RNA样品送样标准

1.1 合作伙伴需要提供Nanodrop, Gel-Electrophotometric,或者Agilent中一种或多种形式的样品分析结果;

1.2 应仔细纯化样品,尽量避免多糖、蛋白质、和外切酶的残留;样品必须注明溶剂成分。

1.3 RNA 样品浓度、纯度、总量标准需求

2 RNA组织及血液样品送样标准

2. 1总量标准需求

注:不同类型的样品RNA或DNA的产量差别较大,像人或哺乳动物的全血中红细胞没有细胞核,每毫升血液中实用细胞数少,核酸得率比较低,送样量会相应增加,而鸟类或鱼类血液中红细胞含有细胞核,核酸得率会增高。含肌纤维细胞丰富的肌肉组织,核酸的得率会受到影响;代谢活跃的肝脏组织由于细胞含量旺盛核酸得率每50毫克组织可达到20~30μg的核酸产量。

2.2 组织样品采集

活体取材后的组织需用RNase-free 的0.9%生理盐水中漂洗样品,以去除血渍和污物,并剔除结缔组织和脂肪组织等非研究所需的组织类型,吸干,并将样品分割成50mg左右的小块(组织块越小,保存效果越好),放入1.5ml 或者2.0ml的Rnase-free 的EP 管中并加入RNAlater 一类的RNA 组织保存试剂,液氮速冻后用封口膜封口,再将EP 管放置于50ml 离心管中或密封性好的小塑料袋中,以大体积干冰运输,且要保证我方在收到样品开箱检验时干冰不能挥发完全。

2.3 血液

请合作伙伴先自行分离白细胞,然后放置RNAlater 或TRIZOL中,液氮速冻后,干冰运输送样;原则上不接收全血样本。

2.4 注意事项

2.4.1 对肿瘤组织的取材,应尽可能准确地判定肿瘤组织和正常组织,如果有可能请根据冰冻切片报告的结果来判定要进行研究的取材部位。

2.4.2 用于RNA样品制备实验的组织样品处理及切割过程应在冰上尽可能快速进行,时间过长会导致样品RNA降解 。

2.4.3 在临床手术过程中采集的病理或正常样品,如果没有条件立即从手术室中取出进行后续处理,请在切除后立即转移到液氮中保存。

 


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