单细胞测序
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发布日期: 2010-12-06 22:54 文章来源: 丁香园
关键词: 华大基因 点击次数:

2007年至今,以Illumina公司Genome Analyzer(GA)为代表的第二代测序平台已经大规模普及。同时,人类单倍型计划、千人基因组计划、癌症基因组计划、Meta-Hit计划等重大国际合作项目也将基因组研究日渐推向高潮。然而,迄今为止使用的测序材料无一例外都是大量细胞的混合DNA样本。在微生物生态学、癌症基因组、法医学、微量诊断、遗传印记等研究中,这样的材料显然是无法满足要求的,而单细胞微量测序为解决以上难题打开了一扇崭新的大门。

单细胞测序是指在单个细胞水平上对基因组进行扩增与测序的一项新技术。该技术的建立需要两个必备条件:1.高质量的全基因组扩增技术2.高通量低成本的测序技术(Next Generation Sequencing , NGS)。

1. 技术路线

2. 技术优势

♦  结合外显子捕获测序技术,可获得大量重要变异,节省项目成本

♦ 可挖掘DNA突变的来源和频率,结果验证率高

♦ 分析癌细胞的发生、发展和演化过程

♦  能将正常细胞与癌细胞在遗传变异水平上区分开

3. 生物信息学分析

分析结果:

♦ 单细胞所有点突变信息列表

♦ 对所有检测出的SNP和InDel进行注释

♦ 正常细胞和癌细胞的突变频率图谱

♦ 建立进化树分析各肿瘤细胞的关系

♦ 所有样品的原始数据和处理数据

*更多技术细节,请与BGI技术人员联系!


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