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StepByStep学习核酸序列分析软件DNAssist1.0

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发布日期: 2006-12-13 00:01	文章来源: 丁香园
关键词: 核酸序列分析软件 DNAssist1.0	点击次数：

9. 再说DNAssist其他功能。一个是找开放阅读框（ORF）。用Analyze/Find ORF……命令可以找到阅读框。它从第一个ATG开始找，到遇见一个终止密码子为止。点Find next可以挨个找，点几下就什么都明白了。

10.分析DNA物化性质。用Analyze/Properties/Physicochemical命令，出现如下窗口。我们可以知道序列长度为441bp，ATGC各有几个，GC含量37%，单、双链时的分子量，退火温度等。

11. 酶切位点分析。这可是个十分重要的功能。用Analyze/Restriction mapping命令，出现Restriction enzymes 窗口。这里列举了他们知道的所有酶切位点。你可以选择其中你知道的所有酶（尤其是可能用到的酶，还是要多些），以免以后的结果中显示了太多的酶切位点而令人目眩。确定。

12. 这里将结果用两种方法显示。一种是简捷的Graphic Map。一种是详细的Restriction map。后者不但列出酶切位点在双链DNA的哪个位置，还能够列出相邻酶的酶切片段的长度和起止位置，以及出现和没有出现的酶切位点。都可以打印下来。

13. DNAssist还有个很绝的功能，分析质粒序列时可用Convert/Circularize命令将它环化后分析，就不会漏掉酶切位点了。

14. 还可以做简单的蛋白质分析。我们把刚才的那个AB-CTB序列用Convert/DNA→protein命令转化为蛋白质序列。

15.用Analyze/Properties/Physicochemical命令分析可以知道分子量16kD、氨基酸组成、等电点等物化性质。

16.还可以用Analyze/Properties/Antigenicity 和Analyze/Properties/Hydrophobicity分析蛋白质的抗原性和疏水性。

编辑：西门吹血

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　　　作者: palmyard


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