一步一步教你使用NCBI(Part two)(多图)
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发布日期: 2007-07-25 21:37 文章来源: 丁香园
关键词: NCBI 使用方法 引物设计 序列比对 点击次数:

    2. 查找mRNA、蛋白序列

    回到步骤1点击“Go”之后出现的页面,点击目的基因的名字,出现以下页面(只抓取相关部分):


    页面的下半部分,即可以获取mRNA和蛋白序列的部分:


    找到“NCBI Reference Sequences (RefSeq)”,它分为几个板块,第一个“mRNA and Protein”区可以让我们找到连续的编码mRNA序列和蛋白序列。在mRNA and Protein下面有两个序列代码(中间划有一个箭头),这代表了mRNA序列和蛋白序列。分别点击就可以得到相应的序列页面。点击后如图所示,mRNA序列:


    蛋白序列如下:


本文中图片由网友[urbest]提供


    NCBI Reference Sequences (RefSeq)的第二个板块是Reference assembly,它下面显示的是Genomic ,点击Genomic下面Reference assembly对应的Genbank或FASTA即可出现编码的DNA序列(注意:只是编码序列,其中包括内含子,但一般没有5‘非编码区)。

    这样我们就可以找到基因的cDNA序列、连续的编码mRNA序列、蛋白序列以及含有内含子的编码DNA序列了。

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   作者: urbest


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