Endnote教程(中)--应用篇
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发布日期: 2006-12-11 22:46 文章来源: 丁香园
关键词: Endnote 软件 应用 点击次数:

二、通过endnote检索网上数据库

这一部分我们介绍如何通过endnote直接检索网上数据库,比如我们平时常用的pubmed

1 连接Tools-->Connect-->Connect,就会出现连接选择窗口,选择一个想要查询的数据库,比如pubmed,然后按Connect,就会弹出连接窗口了(如果你装有防火墙,这时可能会跳出提醒窗口,允许连接即可)

2 搜索:连接以后,出现窗口1,这和搜索窗口是一样的,我们可以按照自己的要求进行检索,就像在pubmed网站上一样。输入条件之后,按search,会出现窗口2,也就是确认窗口。告诉你找到了多少篇文献,以及是否开始下载文献的相关信息。(像我的例子里就有100多万文献)

3 显示、选择、保存文献:在上面的确认窗口里点yes后会来到窗口3,这个就是下载窗口。endnote开始从pubmed网站上面下载文献的相关信息(当然,是没有全文的。全文哪里找?去检索区好好学习前辈高手的经验吧)

4 说明:在下载的过程中,随时都可以窗口下方的pause暂停下载过程。下载完毕后,可以选择需要保存的文献。点击窗口右下角的Show Preview可以看到文献的信息,这和数据库浏览的时候是一样的。然后,当我们已经选择好需要保存的文献,点击窗口上方的copy all references to按钮,选择new library(新建一个数据库)或者choose library(添加到当前数据库)。添加完毕后,关闭窗口即可。


三、把检索所得结果导入endnote

endnote搜索是好,但是有的时候endnote连接不好,或者我们习惯于使用ie,或者我们检索的机器上没有endnote,需要把检索的结果拿回我们自己的机器上去导入,这个时候,应该如何去做呢?

首先,我们的检索结果必须是保存为纯文本格式,并且数据排列方式为tagged格式,也就是每行一个字段。就像这样

PMID- 15170088
OWN - NLM
STAT- publisher
DA - 20040531
IS - 1346-9843
VI - 68
IP - 6
DP - 2003
TI - Aortic Calcification Detected in a Mass Chest Screening Program Using a...

在这里只举一个例子,在pubmed上保存检索结果时(窗口4),首先选择好你要保存的文献,然后把保存类型选成medline格式,后面的保存类型选成file(当然也可以选text,会在浏览器窗口中出现结果,剪切复制到记事本里即可),然后按send to,保存为文件即可。别忘了是纯文本格式(txt)。

这里要说明一下,在我的机器上,保存的结果是query.fcgi文件,这样不能用记事本直接打开,很是不便。要保存为txt格式,我们需要出现是打开还是保存query.fcgi文件的时候,选择保存。然后在保存窗口下面的文件类型里面选择“所有文件”,然后在文件名这一栏输入的时候要加上扩展名txt,比如我们想把检索结果起名叫cancer,就要输入cancer.txt(注意是英文句号)。

现在,我们的检索结果已经保存好了,可以开始导入了:

1 选择filter:顾名思义,就是过滤器。每个数据库的结果都有自己不同的格式,而要针对不同的格式,我们就要选择对应的filter,这样才能得到正确的结果。在Edit-->Import Filters-->Open Filter Manager,打开filter管理器(窗口1),选择我们所使用的数据库(我这里选择的是pubmed

2 导入:首先打开你要导入的目标数据库,然后File-->Import,会出现导入窗口。点choose file选择我们保存的结果文件。在import option(窗口2)里面选择我们使用的数据库,这里我选择pubmed。(从这里还可以看出,endnote也可以导入reference managerprocite的数据,毕竟都是isi一家人么)。在Duplicates(窗口3)里面选择import all是全部导入(与原有数据库重复的文献也导入),discard duplicates是不导入与原有文献重复的文献,import into duplicates library是把重复的文献导入到另外一个数据库中。

3 结束:各种选项调整好之后,按import,如果操作正确,我们的结果就进入数据库里面啦。



编辑:bluelove

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   作者: oldbike等


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