学科设有门诊胸部疾病诊断中心（包括7个专科门诊）、普通门诊和呼吸普通病房、呼吸老年病房、呼吸重症监护病房、肺部肿瘤综合诊疗中心；有四个专业实验室，分别是肺功能、临床微生物、细胞及分子生物学和生物物理实验室。此外，还兼管上海市呼吸内科临床质控中心和上海市院内感染质控中心。开展的医疗新技术有介入性纤支镜、肺部肿瘤综合诊疗、肺部感染诊断和鉴别诊断、呼吸衰竭治疗新技术、全麻密闭加压给氧分侧肺盥洗术以及胸肺介入技术和胸腔镜等，经常派出专家参加上海和各省市的疑难病例会诊，并经常受邀请参加国内外的学术讲座和报告。

 目前承担上海市医学重点学科、国家自然科学基金、卫生部、教委博士点、上海市科委重大科技攻关项目和美国NIH的RO1等多项课题，另外即将启动复旦大学肺损伤和炎症科技创新平台建设项目。近5年先后发表SCI索引论文30余篇，核心期刊数百篇，主编专著7部。白春学教授还兼任英国Taylor & Francis出版社《J Organ Dysfunction》副主编，提出创立Against Respiratory Dysfunction Alliance (ARDA)建议，旨在引起社会和医务界对呼吸衰竭的重视，及早防治呼吸功能不全，以期起到事倍功半的效果。该研究小组对水通道和肺损伤治疗的研究已引起了国内外关注。在《Respiratory Physiology & Neurobiology》，2004，142：1－11的文章The role of aquaporin-1 (AQP1) expression in a murine model of lipopolysaccharide- Induced acute lung injury被Science Direction评为2004年前25篇文章中第8篇（检索途径：http://top25.sciencedirect.com/?journal_id=15699048）。

 此外，呼吸科在国际上最早应用RNAi技术研究抗肺肿瘤药物，已获得“一种双链RNA及其用途”的专利（专利号：ZL03115489.1）；获得2005年上海市优秀发明选拔赛一等奖；最早研究联合应用血液净化和膜氧合器 (专利号：ZL 2004 2 0091118.1) 治疗ARDS；目前联合复旦大学高分子科学系研发成功具有自主知识产权的随弃式氧和pH生物光纤化学传感器，并开发出以其为基础的实时血气分析仪雏型，首次在体系列应用获得成功。

 呼吸科历年获得许多殊荣，先后获得上海市优秀发明选拔赛一等奖2项，卫生部科技进步奖5项、上海市科技进步奖5项，另外还有中华医学奖和上海市卫生局奖各1项。已培养博士和硕士研究生80余名，博士后1名。目前在读研究生16名，博士后2名。