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miRNA研究解决方案

美国GeneCopoeia公司是目前全球最大的基因和miRNA功能研究材料供应商之一,为客户提供全球最多的人类编码全长蛋白的ORF克隆。这些ORF构建在具有不同特征的多套载体中,使这些克隆易于在多种不同类型的细胞及无细胞转录翻译偶联体系中进行功能分析、蛋白质表达和纯化、大规模功能基因组学和蛋白质组学研究。 GeneCopoeia关注miRNA研究领域多年,基于自身强大的专业技术与完善的基因功能研究 。

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RISC复合体的靶标感知模式和效应模式

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发布日期:2011-01-05 02:36 文章来源:美国GeneCopoeia(复能基因)
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关键词: GeneCopoeia RNAi   点击次数:

当RISC复合体与小RNA分子的向导链结合之后,它又是如何发现靶标mRNA的呢?绝大部分RISC复合体与靶标mRNA之间的结合能(binding energy)都来自于小RNA分子种子区的核苷酸。看来RISC复合体之所以能够被靶标识别并结合主要是因为RISC复合体在通过小RNA分子5'端种子区与靶标发生特异性的结合之后表现出来的对ssRNA具有固有的、非特异性的亲和力。但是,靶标的可结合性是直接与其降解效率相关的,这说明RISC复合体并不能够打开RNA分子的二级结构。

在细胞内,mRNA分子均与核蛋白(ribonucleoproteins,RNP)结合在一起,以复合体的形式存在,因此mRNA分子的可识别性还会受到几种RNA结合蛋白的影响,因为这些蛋白有可能会遮蔽mRNA分子的结合位点或者打开mRNA分子的二级结构。因此,RISC复合体的作用似乎就是根据结合的靶标而定的,它的作用模式不仅会受到靶标mRNA分子上用来与小RNA分子结合的位点结构的影响,还会受到与每一个Argonaute蛋白结合的RNA结合蛋白的影响。比如,在动物体内,miRNA至少可以通过作用于靶mRNA3'端非翻译区里的结合位点的三条各不相同的途径来沉默基因表达,即切割mRNA靶标分子、抑制mRNA靶标分子的翻译表达,或降解mRNA靶标分子。不过,对于每一个单独的miRNA-mRNA沉默复合体来说,由抑制翻译和直接降解而造成的基因沉默效果并不相同。此外,最终的沉默效果可能还会受到其它能够与靶mRNA或RISC复合体发生相互作用、抵消miRNA的蛋白质的影响。这样,每种组织因其所含蛋白的不同,导致了完全不同的调控结果。

编辑: helen

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