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miRNA研究解决方案

美国GeneCopoeia公司是目前全球最大的基因和miRNA功能研究材料供应商之一,为客户提供全球最多的人类编码全长蛋白的ORF克隆。这些ORF构建在具有不同特征的多套载体中,使这些克隆易于在多种不同类型的细胞及无细胞转录翻译偶联体系中进行功能分析、蛋白质表达和纯化、大规模功能基因组学和蛋白质组学研究。 GeneCopoeia关注miRNA研究领域多年,基于自身强大的专业技术与完善的基因功能研究 。

miRNA表达量差异分析

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RNA沉默途径的调控措施

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发布日期:2011-01-05 02:38 文章来源:美国GeneCopoeia(复能基因)
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关键词: GeneCopoeia RNAi   点击次数:

各种不同的RNA沉默途径之间存在竞争关系,比如黑腹果蝇中的endo-siRNA和miRNA之间就相互竞争LOQS。这种竞争机制就是RNAi途径中决定每一个阶段里如何发生调控的关键步骤。很多植物和动物病毒都会编码抑制蛋白来抑制宿主细胞的RNAi途径,使得这些调控机制无法在各个不同阶段发挥正常作用。细胞的蛋白质同样也能够调控RNAi。比如,在人体胚胎细胞中,miRNA let-7分子(一种抑癌分子,同时也是一种细胞周期调控分子)的生成过程就是一条转录后被抑制的过程,该途径被多潜能因子LIN28所抑制。LIN28蛋白可以阻止pri-let-7分子在微处理器复合物中的剪切过程及后续由Dicer蛋白负责的pre-let-7前体分子的处理过程。不过,人体同时存在另一条路径。转化生长因子β(TGF-β)和生长因子家族中的骨形成蛋白(BMP)都能促进miR-21这种促癌分子的生成。这是因为这些蛋白能够促进DROSHA将pri-miR-21转化成pre-miR-21。更确切地说,SMAD蛋白家族成员TGF-β和BMP信号转换因子与RNA解旋酶p68组成的复合物一起被招募至pri-miR-21,促进pre-miRNA形成。另外,不均一核糖核酸RNP A1蛋白(heterogeneous nuclear RNP A1,hnRNP A1)这种著名的前体mRNA分子剪切调控因子也会帮助DROSHA发挥作用,有效地生成pre-miR-18,这可能是由hnRNP A1蛋白能够重新折叠发夹结构,或者直接与pri-miRNA结合,为DROSHA构建出一个酶切位点而造成的。这也说明在pri-miRNA分子中,某些发夹结构可能是在pri-miRNA分子与RNA伴侣蛋白结合之后才会形成并被剪切的。

RISC复合体的活性同样能够被调控。在拟南芥中,非编码基因IPS1中含有的一段基序能够与miR-399序列互补,但是它们之间的互补配对过程却被该miRNA分子中酶切位点处的一段错配形成的环状结构给破坏了。这样,IPS1基因的mRNA产物不仅没能被miR-399降解,反而还大量“扣押了”miR-399分子。因此,如果IPS1基因大量表达会使得胞内“积聚”大量miR-399分子的靶标--PHO2基因mRNA。这种靶标之间的相似性会给RNA调控网络带来不可预料的复杂性。我们预测,最近在人体细胞中发现的大量mRNA样非编码RNA分子(mRNA-like non-coding RNA)可能会在小RNA- Argonaute蛋白复合体调控过程中起到“减速器(attenuator)”的作用。


 

编辑: helen

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