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miRNA qRT-PCR 表达检测

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发布日期:2012-09-20 14:06 文章来源:丁香园
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关键词: RNA miRNA 技术专题 锐博生物 丁香通 丁香园   点击次数:


miRNA表达分析是生物功能研究的基础,是当今生物学研究的热点领域。准确检测细胞或实验动物组织中miRNA的表达可用来帮助研究者更快地切入miRNA的功能研究;而准确检测病理组织或血液中miRNA的表达谱则有助于分析miRNA与疾病的相关性,这为探索miRNA作为疾病诊断及治疗的生物标志物,和为开发以miRNA为基础的药物奠定了基础。锐博生物经过不断的探索与努力,完成了针对miRBase数据库中全部人、小鼠、大鼠miRNA的 Bulge-Loop? miRNA qPCR Primer Set开发工作,并在细胞、组织或血液中miRNA表达谱的检测中得到了非常可靠的结果。锐博生物现向您提供最优质的miRNA实时荧光定量PCR全套技术服务。

Bulge-LoopTM miRNA qRT-PCR是锐博生物自主开发的成熟miRNA检测方法,采用SYBR Green染料,不需荧光探针,具有高灵敏度和特异性的优点。该检测方法包括两个步骤:(1) 基于茎凸环结构引物的逆转录反应。(2) 实时荧光定量PCR。茎凸环结构的逆转录引物与miRNA 3'端部分结合,在逆转录酶作用下进行逆转录反应,特异的正向引物、通用反向引物及SYBR Green荧光染料进行定量扩增,实现逆转录产物实时定量检测。

 

图1 Bulge-LoopTM miRNA qRT-PCR原理示意图



■ 特异性--hsa-let-7家族成员同源性极高(上表),彼此之间仅单个或数个碱基的差异。传统检测方法对此无能为力,无法区分各个家族成员。但Bulge-LoopTM miRNA qRT-PCR方法采用了具有茎凸环结构的逆转录引物以及高特异的miRNA正向引物,保证了该方法的特异性,高度同源的miRNA也能被准确检测。

■ 灵敏度--能够准确定量0.1pg总RNA中,最低量至5个拷贝目标miRNA, 具有7个数量级的动态变化范围。比传统的miRNA定量检测方法(如Northern blot和micro-array)具有更宽广动态变化范围,无需担心因样品量少或者miRNA表达量低而无法精确检测。

■ 准确性--Bulge-LoopTM miRNA实时定量PCR可验证微阵列芯片表达谱数据的准确性。尽管只有少量的样品, 该方法也可有效、准确、可重现地检测出miRNA的表达量。

Bulge-LoopTM miRNA qPCR Primer Set是一个包含了miRNA特异的逆转录引物,以及PCR正反向引物的套装。具有茎凸环结构状的miRNA特异逆转录引物以及高度特异的正反向引物,使得Bulge-LoopTM miRNA qPCR反应避免了miRNA前体的干扰。并且Bulge-LoopTM miRNA qRT-PCR反应的模板可以是总RNA,也可以使已纯化的miRNA分离物。通常细胞或组织样本采用U6 snRNA或5S rRNA作为miRNA检测的内参,适用于单个或多个样品中不同miRNA的相对定量;样本中miRNA的绝对数量,可使用化学合成的miRNA标准品(MQP-0412)来制作标准曲线。

 

  

 

    



1、Bulge-LoopTM miRNA qPCR技术服务项目:

a) 相对定量:以U6 snRNA或5S rRNA为内参,检测样本中相关miRNA的表达量;

b) 绝对定量:以化学合成的miRNA成熟链(MQP-0412)为标准品,做5个梯度点以上的稀释后制作定量标准曲线,通过标准曲线对待检测miRNA进行绝对定量;

c) miRNA芯片数据确认:对芯片所筛选目的miRNA进行qRT-PCR数据验证。

2、Bulge-LoopTM miRNA qPCR技术服务方法及仪器:

用SYBR Green I荧光定量PCR试剂检测;

检测仪器为Bio-Rad CFX96,ABI7300等。

3、Bulge-LoopTM miRNA qPCR技术服务流程:

a) 样品RNA准备

b) RNA质量检测

c) 逆转录合成cDNA

d) 实时荧光定量PCR

e) 分析结果、提供实验报告

编辑: gaowei2010

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