一类新型长非编码RNA的发现——sno-lncRNAs
9月6日，国际学术期刊《分子细胞》（Molecular Cell）在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组的最新研究论文，揭示了一类全新内含子来源的长非编码RNA的产生机制，及其参与剪接调控的重要功能。
几乎所有哺乳动物细胞的基因都由外显子和内含子组成。一般认为，外显子片段通过转录剪接成为具有功能的RNA，而内含子序列在剪接后被核酸酶快速降解，因此没有生物学功能。生化与细胞所的最新研究成果证实了内含子来源的非编码RNA序列既可以在剪接后稳定存在，又可以在细胞中发挥重要的调控作用。
研究具体阐明了一类双末端都含有小核仁RNA (snoRNA)的内含子序列在剪接发生过程中，可以形成一类新型长非编码RNA，命名为sno-lncRNAs。在人类基因疾病PWS综合症 (小胖威利症) 紧密关联区域存在五个sno-lncRNAs，它们在人源胚胎干细胞中表达量极高，且异常稳定。功能研究表明，这些sno-lncRNAs加工成熟后均聚集于其转录位点附近，形成一种全新的细胞核亚定位；它们同时还含有多个剪接调控因子Fox2蛋白的特异结合位点，从而可以像“海绵”一样吸附细胞核内的Fox2，调节Fox2在细胞核内的局部浓度，进而影响Fox2对特异mRNA底物的选择性剪接调控。
值得一提的是，因PWS综合症的病理机制至今不详，而这些sno-lncRNAs在PWS综合症病人中完全缺失，从而提示这些新的RNA分子可能与PWS综合症的病理发生相关。该工作也为进一步了解PWS综合症的病理机制提供了新的研究思路。同时这一研究成果揭示了哺乳动物细胞中存在着内含子来源的、具有重要生物学功能的新型长非编码RNA (sno-lncRNAs)，从而丰富了人们对真核细胞转录组表达调控多样性的认识。（转自生物谷）
注：PWS综合症 (小胖威利症) ，主要表现为神经系统发育和生长发育障碍。
原文摘要：
Long Noncoding RNAs with snoRNA Ends
Qing-Fei Yin1, 4, Li Yang2, 4, Yang Zhang1, Jian-Feng Xiang1, Yue-Wei Wu1, Gordon G. Carmichael3, , , Ling-Ling Chen
We describe the discovery of sno-lncRNAs, a class of nuclear-enriched intron-derived long noncoding RNAs (lncRNAs) that are processed on both ends by the snoRNA machinery. During exonucleolytic trimming, the sequences between the snoRNAs are not degraded, leading to the accumulation of lncRNAs flanked by snoRNA sequences but lacking 5′ caps and 3′ poly(A) tails. Such RNAs are widely expressed in cells and tissues and can be produced by either box C/D or box H/ACA snoRNAs. Importantly, the genomic region encoding one abundant class of sno-lncRNAs (15q11-q13) is specifically deleted in Prader-Willi Syndrome (PWS). The PWS region sno-lncRNAs do not colocalize with nucleoli or Cajal bodies, but rather accumulate near their sites of synthesis. These sno-lncRNAs associate strongly with Fox family splicing regulators and alter patterns of splicing. These results thus implicate a previously unannotated class of lncRNAs in the molecular pathogenesis of PWS.
编辑: gaowei2010
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