miRBase 更新至19.0版—你的研究升级了么?
2012年8月1日,Sanger microRNA序列数据库(miRBase)升级至19.0版。与以往的数据库相比,miRBase 19.0更新了大量数据:miRNA发夹前体序列新增3171条,总数升至21264条;成熟miRNA新增3625条,总数升至25141条;miRBase 19.0版报道的所有物种新增25个,总数升至193个。并且新版数据库对miRNA序列注释和命名法进行了系统的修正,彻底取消了miR*命名法,而以-5p和-3p的命名法取代之。
相比于miRBase 18.0版,最具代表性的Homo sapiens [人]、Mus musculus [小鼠]、 Rattus norvegicus [大鼠] 成熟miRNA数量有较大改变。Homo sapiens [人] 成熟miRNA新增123条,删除了2条,名称不变但序列改变的有2条,序列不变但名称改变的有36条;在Mus musculus [小鼠]中,成熟miRNA新增129条,删除了5条,名称不变但序列改变的有2条,序列不变但名称改变的有41条;在Rattus norvegicus [大鼠]中,成熟miRNA新增44条,删除1条,序列不变名称改变的有477条。锐博生物miRNA表达谱芯片、iRNA模拟物(miRNA mimic)、miRNA抑制物(miRNA inhibitor)、miRNA激动剂(miRNA agomir)、miRNA拮抗剂(miRNA antagomir)、miRNA文库、miRNA实时定量PCR、miRNA原位杂交等miRNA相关产品第一时间全线同步升级至19.0版。你的研究升级了么?
编辑: gaowei2010