miRNA芯片数据分析
miRNA表达谱芯片数据标准分析：
1、表达差异分析
对于使用参照实验设计进行的重复实验, 可以对多个样本的基因表达数据进行差异基因表达分析, 具体方法包括差异倍数分析、t检验等。
2、聚类分析
聚类分析是通过建立各种不同的数学模型，把基于相似数据特征的变量或样本组合在一起。归为一个簇的基因在功能上可能相似或关联，从而找到未知基因的功能信息或已知基因的未知功能。
miRNA表达谱芯片数据高级分析：
1、miRNA标志物筛选分析
从庞大的芯片数据中找出能作为Biomarker的miRNA，并以此构建模型，达到区别不同组织、状态或类型的生物样品的目的，以便于进行早期诊断、疾病预测和预后分析，是miRNA表达谱芯片的重要应用。
注：需提供足量的miRNA表达谱芯片样本。
2、miRNA靶基因预测及信号通路分析
靶基因预测是miRNA功能研究上的有力工具。通过对多个数据库的靶基因预测结果统计，可以进一步缩小靶基因范围，为实验验证提供指导。结合基因表达谱芯片检测结果，可以更有效地分析miRNA靶基因。
注：可供选择的数据库：TargetScan, miRanda, StarBase, miRDB,picTar, DIANA等。
图1 多种工具对miRNA靶基因的综合预测
3、miRNA靶基因调控网络构建
miRNA在细胞内具有多种重要的调节作用。一个miRNA可能有多个靶基因，而一个基因很可能受多个miRNA的调控。miRNA调控多个基因的表达，也可以通过几个miRNA的组合来精细调控某个基因的表达。
针对客户感兴趣的若干个特定miRNA，锐博生物运用生物信息学的方法和技术通过文献挖掘研究复杂的miRNA调控网络关系，揭示有关的作用机理，为您的科学研究的创新提供帮助！
图2 miRNA调控网络
（根据miRNA芯片或测序，找出几个表达差异较大的miRNA：图中黄色点标识；接着通过生物信息学的方法构建蛋白互作网络，预测miRNA的靶基因：蓝色点标识；最后可进行靶基因验证）
编辑: gaowei2010
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