lncRNA研究策略
1、差异表达筛选
通过lncRNA芯片或RNA-seq测序等方法对多对疾病模型和对照样本组织进行lncRNA表达谱分析。
2、生物信息分析
通过生物信息学的方法筛选出具有表达差异的lncRNA，构建共表达网络，预测lncRNA的靶基因。
3、细胞分子水平研究
（1）功能获得性研究：构建lncRNA过表达载体
（2）功能缺失性研究：可通过siRNA、shRNA、反义核酸等方法沉默lncRNA，干预lncRNA后检测其对疾病相关基因表达的影响和对细胞表型如增值、凋亡、侵袭、转移等的影响
（3）可通过RNA pull down、RNA-RIP、ChIRP-seq等方法检测与lncRNA结合的DNA、RNA、蛋白质。
4、动物实验
（1）构建移植瘤或原位瘤模型，转移模型
（2）导入siRNA或者lncRNA表达质粒
（3）检测肿瘤生长曲线
（4）通过免疫组化、RT-PCR、Western Blot等方法检测相关指标变化。
小知识
RNA-RIP技术（RNA Binding Protein Immunoprecipitation)是一种高通量检测细胞内RNA与蛋白结合情况的技术，运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来，然后经过分离纯化就可以对结合在复合物上的RNA进行分析。RIP技术下游结合microarray技术被称为RIP-Chip，帮助我们更高通量地了解癌症以及其它疾病整体水平的RNA变化。
CHIRP-Seq( Chromatin Isolation by RNA Purification )是一种检测与RNA绑定的DNA和蛋白的高通量测序方法。方法是通过设计生物素或链霉亲和素探针，把目标RNA拉下来以后，与其共同作用的DNA染色体片段就会附在到磁珠上，最后把染色体片段做高通量测序，这样会得到该RNA能够结合到在基因组的哪些区域；如果结合物是蛋白质，可以通过将蛋白质打断成短肽再通过质谱进行鉴定，从而或者与RNA结合的蛋白质。RNA Pull down技术与此类似。
生物芯片
锐博生物的RiboArray芯片覆盖当前各个lncRNA数据库，用于检测已知lncRNA在不同样本之间的表达差异，或检测疾病样本中表达异常的lncRNA。
锐博生物可以根据研究需要选择不同容量的芯片型号。从芯片设计，芯片检测，到结果的分析，一站式解决方案，简单，方便，可靠
高通量测序平台
高通量测序不仅能够检测已知lncRNA表达量，还能发现全新的lncRNA。 锐博生物的新一代高通量测序平台具有灵活、快速、高通量的特点。 专业的测序技术和生物信息团队，可为您完成样品提取、上机测序到最终数据分析。
编辑: gaowei2010
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