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兔单抗亲和力和灵敏度更高
相对于鼠单抗(解离常数Kd在10-9-10-10M水平),兔单抗的亲和力可提高100-1000倍(Kd在10-10-10-12M水平)。实际使用时,兔单抗的工作浓度更低,灵敏度更高,因此产生的背景更低,大大降低了假阳性的发生。用作免疫组化等用途时,有时甚至可免去抗原修复的步骤。

兔单抗能识别更多表位
很多蛋白在人类和啮齿动物中同源性很高,这些保守表位在小鼠体内免疫原性很弱,不容易产生高质量抗体。而兔做为宿主,可以更好地识别这些表位,产生针对更多表位的抗体。当然,兔也适合生产针对鼠类蛋白的抗体。

多肽基本常识

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发布日期:2012-04-27 10:46 文章来源:丁香园
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关键词: 丁香园 丁香通 生物专题 义翘神州 多肽   点击次数:

九、固相多肽合成Fmoc方法

任何多肽链的关键连接为肽键,由一个氨基酸的氨基与另氨基酸的缩合形成。通常一个氨基酸由一个中心碳原子组成,它由四个基它基团包围:氨基、羰基、基和侧链。侧链,称为R,区别不同氨基酸的结构。某些侧链含有干扰肽键形成的功能团。因此侧链功能团的封闭很重要。

图工显示了Fmoc合成的一般流程,首先第一个Fmoc氨基酸通过一个酸性接头接到不溶载体树脂上,Fmoc去保护通过用碱处理树脂来完成,一般是Poperidine。用预先激活或原位激活连接第二个Fmoc氨基酸。要求总多肽合成后,通过TFA分离来除去树脂和去保护。

1、Fmoc分离

固相多肽合成中多肽分离主要用酸解

Fmoc法用弱酸,比如TFA或TMSBr。各种添加剂, 一般为thiol compound , 水和酚,用来保护多肽的免分离中Carbocation的破坏。

2、下列保护基与TFA和TMSBr分离相合:(略)

基于保护基团的类别,必须使用去保护剂的组合。 例如,当Boc和tButyl存在时,它们的Carbocation对应物能与Trp,Tyr和Met反应形成tbutyl产物。EDT是极有效的t-butyl trifluoroacetate清除剂,但它不保护Trp。因此,必须加水以控制烷基化。Trp的吲哚环和Tyr的OH极易与Pmc反应。水再次表现出对此反应的抑制。Trt和Mtr基团也有相似情形。较此适当组合清除剂将极大降低副反应。

tBoc和CBZ多肽合成

tBoc合成法见图3

3、tBoc法的分离法

Boc使用强酸,比如HF,TFMSA或TFMoTf。分离加入各种添加剂,一般为thiol化合物以保护多肽免受carbocation破坏。

4、HF分离法(如下)略

5、TFMSOTf分离

TMSOTf分离

SPPS的一般连接方法

适于固相多肽合成的连接反应要求酰化反应,对同源多肽最有效。

Fmoc SPPS连接方法FmocSPPS最常用的连接法是活性酯,要么原位,要预先激活。 起初P-nitrophenyl和N-hydnxysuccinimide激活酰是常用形式。甚至,有HOBt时,连接反应也很慢,此外,Fmoc氨基酸ONSu、酯与succinimido-carbonyl-β-alanine -N-Hydroxysuccinidide酯副产物的形成相关。今天最常用的激活酯是Opfp和Odhbt。有HoBt时反应速度极快,副产物少。

另一方面,使用象DCC,HBTU,BOP,BOP-Ce,或TBTU活化剂时,能原位进行许多连接反应。Carbondiimide的直接添加是最佳选择。然而,TBTU和HBTU第二个出现,接着BoP,最后是BoP-CE。再者,酯连接发现BoP/HoBt>Carbodiimido/HoBt> Carbodiimido/ODHbT> Carbodiimide/Opfp。

最近以来,HOAt和其对应Uronium盐同类物HATU的发展,发现此HoBt和HBTU具更强催化活性,结果是增加连接产出,缩短连接时间,消旋降低。故此,更适合阻位氨基酸的连接,使得难合成肽的合成更成功。

tBoc SPPS的普通连接法

Carbodiimides,主要是DCC是使用多年的连接试剂,主要的问题是激活和酰化过程中dicyclohexylurea的沉淀。并且伴有许多副反应,已有几种产生可溶脲的Carbodiimide,例如DIC, t-butylmethyl-和t-tatyllethyl-carbodiimide,但是这些试剂未解决副反应的问题。结果生产出了新的激活剂。首先是BOP,随后是PyBrop, PyBOP,HBTU,TBTU和HATU。所有前述试剂都要活性碱基。

所有前面讨论的DCC及其衍生物都通过对称酐的形成起作。通常,对称酐反应性极强已广泛用于SPSS,特别t-Boc合成中,对称酐整合入Fmoc氨基酸有一些困难,例如,从N-(3-dimethylamino propyl ) -N?/FONT>-ethyl -carbodiimides -HG制备的对称酐,由于Z-alkory-5(4H)-oxayolne中间体的形成, 在Carbodiimidie和tertiany amines存在时重排,还有,不是所有的Fmoc 对称酐都溶于DCM,或者无论所有试剂如何都不溶。

对称酐的另一种改变是混合酐,Carboxglic-Carbonate或Carboxglic-phosphinic混合酐,典型的情况且是,由活性isobutyl-或isopropyl-choroformate制备这些,用Nox被阻氨基酸代替phosphinic chloride。通常反应迅速及少或无有副反应。

混合酐,N-carboxy酐(NCAS),也叫,Leuch酐,已广泛用于多聚氨基酸制备,这类化合物联合Nox保护和活化炭基,一旦和另一个氨基酸或肽残基反应,释放CO2做为副产物。

用光气处理α氨基酸很容易得到NCA衍生物,在严格调控条件下,NCA衍生物常结晶析出,便可使用。这些条件要求严格控制合成中的PH,在PH 值低于10时,NCA和肽或氨基酸残基反应产物,肽-Carbamate易失去CO2形成自由α-氨基端,发生聚合。pH10.5时,NCA便水解隆解。 所以反应在PH10.2条件下进行。别的条件要求是反应在0℃进行2分钟,要强烈搅动。反应产物老消旋,带有自由α-氨基,可以增加另一个酐而延伸。

十、液相合成

基于将单个N-α保护氨基酸反复加到生长的氨基成份上,合成一步步地进行,通常从合成链的C端氨基酸开始,接着的单个氨基酸的连接通过用DCC,混合炭酐, 或N-carboxy酐方法实现。Carbodiimide方法包括用DCC做连接剂连接N-和C-保护氨基酸。重要的是,这种连接试剂促接N保护氨基酸自己炭基和C保护氨基酸自由氨基间的缩水,形成肽链,同时产出N,N?/FONT>-dyaylcohercylurea副产物。然而,此方法因其导致消旋的副反应,或在强碱存在时形成5(4H)-oxaylones和N-acylurea而受到影响。庆幸地是,这些副反应能最小化,如果还不能完全消除。方法是加入象HoSu或HoBT这样的连接催化剂,此外,此方法也可用于合成N保护氨基酸的活性酯衍生物。依次产生的活性酯将自发与任何别的C保护氨基酸或肽反应形成新的肽。

当从副产品,diaydohexylurea分离活性酯有困难时,可用混合Carbonic酐方法,此方法由两步组成,第一步是在有tertiary碱的有机溶剂中用适当的酰基氯激活Nx保护氨基酸的炭基,第二步是让肽或氨基酸的自由氨基与Carbonic酐反应。Carbonic酐通常加到自由氨基的14倍。

虽然此方法在低温时高效高产,产品纯,但也有其缺点,例如,由羰基的强激活酐衍生物有消旋倾向。然而此问题在使用Nx-α-Urethane保护基(Cb2, 或tBoc)时便不会发生。进一步:由于高反应性,混合Carbonic酐倾向5(4H)-oxagolomes, Urerbanes diacyimide,酯的形成,并易失调。

编辑: wangminchao

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