RNA提取的细节
RNA 抽提的“三大纪律八项注意”
纪律一:杜绝外源酶的污染。
注意一:严格戴好口罩,手套。
注意二:实验所涉及的离心管,Tip 头,移液器杆,电泳槽,实验台面等要彻底处理。
注意三:实验所涉及的试剂/溶液,尤其是水,必须确保 RNase-Free。
纪律二:阻止内源酶的活性
注意四:选择合适的匀浆方法。
注意五:选择合适的裂解液。
注意六:控制好样品的起始量。
纪律三:明确自己的抽提目的
注意七:任何裂解液系统在接近样品最大起始量时,抽提成功率急剧下降。
注意八:RNA 抽提成功的唯一经济的标准是后续实验的一次成功,而不是得率。
RNase 污染的10大来源
1:手指头 – 手指头是外源酶的第一来源,所以必需戴手套并且频繁更换。另外,口罩也必需戴,因为呼吸也是一个重要的酶来源。戴手套口罩的另外的好处是保护实验人员。
2:枪头,离心管,移液器 – 单纯的灭菌是不能灭活 Rnase 的,所以枪头和离心管要用 DEPC 处理,即使是标明为 DEPC 处理过的。移液器最好是专用的,用前用 75% 的酒精棉球搽拭干净,尤其是杆子;另外,一定不要使用褪头器。
3:水/缓冲液一定要确保无 Rnase 污染。
4:实验台面最起码要用 75% 的酒精棉球搽拭干净。
5:内源 Rnase所有组织均含内源酶,故组织用液氮速冻是降低降解的最好办法。液氮保存/碾磨方法的确不方便,但对有一些内源酶含量很高的组织,却是唯一的办法。
6:RNA 样品RNA 抽提产物可能都会含痕量的 Rnase 污染。
7:质粒抽提质粒抽提往往用到 Rnase 降解 RNA,残留的 Rnase 要用 Proteinase K 消化,PCI 抽提。
8:RNA 保存即使低温保存,痕量的 Rnase 亦会导致 RNA 降解。长期保存 RNA 的最好办法是盐/醇悬液,因为醇在低温时抑制所有的酶活性。
9:阳离子 (Ca, Mg)在含这些离子时,80C 加热 5 分钟会导致 RNA 被剪切,故如果 RNA 需要被加热,保存液需要含螯合剂 (1mM Sodium Citrate, pH 6.4)。
10:后续实验所用的酶酶均有可能被 Rnase 污染。
RNase 和 DEPC 处理
1:高压灭菌是可以灭活部分 Rnase A 的。实验证明:37 C 与 RNA 反应,没有灭菌的 PBS,活性点为 100 pg/ml;灭菌后,活性点为 100 ng/ml。当然,灭菌后 Rnase 仍然不能认为没有残留。
2:DEPC 在水中半衰期为 30 分钟。0.1% 的 DEPC 灭菌 15 分钟可以认为彻底破坏了 DEPC。破坏后可以闻到一点气味。
编辑: ludongcn 作者:taozicao