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1. 灵敏度/检测限(detection limit)
“灵敏度”最初是一个统计学概念,表示样本中检测结果阳性数占所有阳性样品的比例。扩展到各个领域当中就成为各种机器或方法的性能指标,灵敏度越高,越能反应测定值的实际情况。在Western Blot试验中,如果要量化抗体检测的灵敏度就需要一个参数——抗体检测限(detection limit)。
2.抗体浓度
抗体浓度对于商品化抗体的影响有两方面。首先,较高浓度的抗体(>0.5mg/mL)通常性质更稳定,受生产工艺和成本控制等因素影响,不同品牌的抗体的浓度也不相同,所以购买时应注意比较;另外,经验不足的实验者往往被抗体的体积迷惑,然而相同质量下,低浓度的抗体体积更大所以,计算抗体性价比的时候应该考虑的因素是抗体的质量而非体积。
SDS-PAGE实验操作
试剂:
1. 5x样品缓冲液(10ml):0.6ml 1mol/l的Tris-HCl(pH6.8),5ml 50%甘油,2ml 10%的SDS,0.5ml巯基乙醇,1ml 1%溴酚蓝,0.9ml蒸馏水。可在4℃保存数周,或在-20℃保存数月。
2. 凝胶贮液:在通风橱中,称取丙烯酰胺30g,甲叉双丙烯酰胺0.8g,加重蒸水溶解后,定容到100ml。过滤后置棕色瓶中,4℃保存,一般可放置1个月。
3. pH8.9分离胶缓冲液: Tris 36.3g ,加1mol/l HCl 48ml,加重蒸水80ml使其溶解,调pH8.9,定容至100ml, 4℃保存。
4. pH6.7浓缩胶缓冲液: Tris 5.98g ,加1mol/l HCl 48ml,加重蒸水80ml使其溶解,调pH6.7,定容至100ml, 4℃保存。
5. TEMED(四乙基乙二胺)原液。
6. 10%过硫酸铵(用重蒸水新鲜配制)。
7. pH8.3 Tris-甘氨酸电极缓冲液:称取Tris 6.0g,甘氨酸28.8g,加蒸馏水约900ml,调pH8.3后,用蒸馏水定容至1000ml。置4℃保存,临用前稀释10倍。
8. 考马斯亮蓝G250染色液:称100mg考马斯亮蓝G250,溶于200ml蒸馏水中,慢慢加入7.5ml 70%的过氯酸,最后补足水到250ml,搅拌1小时,小孔滤纸过滤。
SDS-PAGE凝胶的有效分离范围
丙烯酰胺浓度(%) 15 12.5 10 7.5 5.0
线性分离范围 15-435kDa 15-60kDa 18-75kDa 30-120 kDa 60-212 kDa
器材
电泳仪,电泳槽,水浴锅,摇床。
样品制备
将蛋白质样品与5X样品缓冲液(20μl+5μl)在一个Eppendorf管中混合。放入100℃加热5-10min,离心,取上清点样。
电泳
1. 将玻璃板、样品梳、Spacer用洗涤剂洗净,用ddH2O冲洗数次,再用乙醇擦拭,晾干;
2. 将两块洗净的玻璃板之间加入Spacer,装好玻璃板;
3. 按如下体积配制10%分离胶8.0 ml,混匀;
ddH2O 3.0 ml
1.0 mol/l Tris-HCl pH=8.8 2.1 ml
30% Acr-Bis 2.8 ml
10% SDS 80 μl
10%AP 56 μl
TEMED 6 μl
4. 向玻璃板间灌制分离胶,立即覆一层重蒸水,大约20 min后胶即可聚合;
5. 按如下体积配制6%浓缩胶3.0 ml,混匀;ddH2O 1.0 mol/l Tris-HClpH=6.8 30%
将上层重蒸水倾去Acr-Bis
2.0 ml 400 μl 600 μl
10% SDS 10% AP TEMED
36μl 24μl 4μl
6. 滤纸吸干,灌制浓缩胶,插入样品梳;
7. 装好电泳系统,加入电极缓冲液,上样20 μl;
编辑: helen