2015.3.28-3.30《重测序数据分析专题培训》

时间

授课题目

授课内容

第一天

上午

重测序研究背景及理论

生物信息学知识背景概述；
二代测序的基本概况和技术发展简介；
重测序的基本概念、研究历史、内容和意义；
重测序研究策略以及技术、前沿热点及趋势；

下午

Linux上机操作及生物信息学软件安装
（上机操作）

linux基础基本操作；
生物信息学软件应用及常用软件介绍、重测序相关分析软件介绍及安装；

第二天

上午

动物、植物、微生物重测序的案例分析应用及分析流程（个体水平）

动物重测序理论与案例分析；
植物重测序理论与案例分析；
微生物重测序理论与案例分析；

下午

重测序分析上机练习
（上机操作）

重测序的分析流程；
原始测序数据的质控及过滤；
学习bwa，samtools,pindel等工具的使用，进行calling SNP,INDEL、变异注释及功能分析；

第三天

上午

群体遗传学、进化
与GWAS分析
（理论+上机）

群体遗传学理论：
进化分析；
GWAS分析；

下午

群体水平数据分析实例
（理论+上机）

低覆盖度重测序与缺失基因型填充（Imputation）分析流程；
GWAS分析流程

□实用生物信息学培训班  □科研论文绘图研习班 □重测序专题研习班
□宏基因组分析专题研讨班  □Perl语言专题班  □转录组专题研习班

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发票内容：

住宿明细

入住时间：
离店时间：

房间类型

□大床间
□标准间（和       合住）
□拼房（与其他学员拼标准间）

备注：