转录组学数据分析专题研讨班

作者:   2015-06-01
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近年来,随着高通量测序技术的迅猛发展,转录组研究从以前的微阵列技术,SAGE及MPSS技术的低通量模式切换至RNA-seq的高通量模式。转录组学作为一个伴随高通量测序技术率先发展起来的技术开始在生物学前沿研究中得到了广泛的应用。RNA-seq对于真核生物的基因表达调控,癌症等疾病的发生机制和新治疗方案确定,遗传育种等众多方面的研究具有不可估量的潜力。为了辅助广大科研工作者掌握转录组高通量测序技术原理、实验设计以及后期数据分析技能,北京市计算中心生物计算事业部举办"转录组学"培训研习班。

主办单位:北京市计算中心 中国生物工程杂志

培训地点:北京海淀区丰贤中路7号3号楼

培训时间: 2015年6月15日-16日(报名中)

本次课程时间: 上午:9:30-11:30下午:13:30-17:00

日期

授课题目

授课内容

第一天上午

转录组学和数据分析基础

1、转录组的定义与内涵

2、转录组学技术发展简介

3、高通量转录组技术流程及技术细节(重点讲解)

4、转录组学技术应用案例

第一天下午

转录组数据分析上机操作

1、linux基础,掌握Linux系统下的常用命令(重点)

2、转录组数据准备和软件介绍

3、转录组数据的比对(重点讲解)

4、表达量估计和分析(重点讲解)

5、使用DAVID进行功能分析。

第二天上午

转录组组拼接及上机操作

1、转录组序列拼接的技术方法和相关软件

2、常用软件及转录组个性化组装的技巧

3、转录组原始测序数据的预处理

4、介绍Trinity的使用,并以测试测序数据为例进行组装

5、介绍寻找ORF的方法

第二天下午

microRNA数据分析与上机操作

1、microRNA目前的定义、应用和发展

2、microRNA的生物学过程(重点讲解)

3、microRNA的测序(重点讲解)

4、microRNA测序数据分析软件(重点讲解)

5、microRNA测序数据分析案例展示(重点讲解)

6、microRNA测序数据分析实例(重点讲解)

(课程内容以实际授课为准)

注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。

【报名费用】 注册费:工作人员2000元/人、学生1500元/人(含听课费、资料费、上机费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用),主办方可协助安排入住酒店,住宿费用自理。

【付费方式】 现金、支票、银行转账、银行汇款 单位全称:北京市计算中心 账号:0200151819100023937 开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行 (汇款信息里 备注上:"生物计算事业部——您的姓名",个人汇款请备注单位名称)

【报名优惠政策】 1、5.29日前预报名的学员每人可优惠300元, 2、3人以上团体报名每人可减少300元; 3、4+1团报,可免费赠送一个名额 4、上面4种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。 培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。

请联系:张老师 010-59341771 ,18618295767,QQ号:2814500767,邮箱zhangly@bcc.ac.cn 员老师 010-59341773, 18701529461 , 邮箱:yuanll@bcc.ac.cn

编辑: 崔子冉   

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