Perl 语言与生物信息学应用

作者:   2015-06-01
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Perl语言作为绝大多数生物信息学工作者首选语言之一。北京市计算中心生物计算事业部针对没有任何计算机语言的生学、医学、农学等人员,且有从事生物信息学工作相关研究工作的需要。欢迎您报名参加!

主办单位:北京市计算中心,生物计算事业部

举办地:北京,北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

培训时间第九期2015年8月2日-5日 (报名中)

培训内容及安排:

日期

时间

授课题目

授课内容

第一天

09:30-10:00

生物信息学与Perl语言概述

概括介绍生物信息学背景与Perl语言的概念及特点

10:00-10:20

软件安装与运行环境调试

Perl语言解释器、编辑器安装,Perl程序运行测试

10:20-12:00

基本操作与基本概念

DOS、Unix命令行操作基本命令;Perl语言基本变量与操作符;基本变量、字符串赋值、基本运算等

13:30-16:30

基本语法结构、文件与文件夹操作

判断结构;循环结构;文件的读入与输出;文件夹操作

第二天

09:30-12:00

数组、二维数组、hash表及应用

数组的概念及用法;

二维数组概念与应用;

关联数组(hash表)的用法;

13:30-16:30

函数、子程序、正则表达式

常用函数学习;

子程序概念与应用;

正则表达式的应用;

第三天

09:30-11:00

生物信息学Perl程序实例与应用

常用生物信息学数据库及专业软件应用简介;

二代测序数据分析;

生物信息学实用程序;

11:00-12:00

CAPN与Bioperl简介、Bioperl的安装

Perl模块安装、包与引用简介;

Perl第三方代码库CPAN的简介与应用;

Bioperl简介与安装;

13:30-16:30

Bioperl的基本应用

文件读取与格式转换;

生物学数据自动化批量下载;

序列信息统计与分析

第四天

09:30-12:00

Bioperl应用进阶学习

GenBank基因组文件特定信息提取;

序列自动化比对;

进化距离计算;

13:30-16:00

数据可视化与做图等

Perl语言做图;

基因组信息图形化展示;

Perl的外界调用与整合应用;

Perl面向对向编程序

(此表仅供参考,授课内容以实际授课为准)

注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。

【培训特色】

1、对口生物信息;    2、非严格语法,适合初学;

3、功能强大、跨平台;4、有巨大的第三方代码库CPAN

 

【报名费用】  注册费:3000元/人(含听课费、资料费、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用),主办方可协助安排入住酒店,住宿费用自理。

【付费方式】现金、支票、银行转账、银行汇款

单位全称:北京市计算中心      账号:0200151819100023937 

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

(汇款信息里 备注上:“生物计算事业部——您的姓名”)

【报名优惠政策】

1、2015年7月10日前报名缴费,可享受减免400元优惠

   2、3人以上团体报名每人可减少400元;

   3、4+1团报,可免费赠送一个名额                

   4、上面3种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。

【联系咨询】

张利英 010-59341771 ,18618295767,QQ号:2814500767,邮箱:zhangly@bcc.ac.cn

员丽丽 010-59341773, 18701529461 ,  邮箱:yuanll@bcc.ac.cn

 

报名回执表:

培训班类型:(可多选)

□实用生物信息学培训班  □论文发表所需的图表处理实用技能

□生物信息与宏基因组分析专题研讨班    □Perl语言专题班

□实用生物信息技术及应用(罗静初教授主讲)

姓名:

 

性别

 

民族:

 

职称:

 

身份证号

 

工作单位:

 

住宿:

是□;否□

研究方向:

 

报名时间:

 

通讯地址:

 

邮编:

 

固定电话:

 

手机

 

E-mail:

 

报名种类:

A□           B□           (该选项仅报名生物信息培训班人员填写)

对课程了解情况

☆☆☆☆☆

感兴趣的课程:

 

信息渠道:

□中心主页 □邮件宣传(张利英、员丽丽)□海报 □单页 □销售员  □丁香园  □生物论坛  □生物通邮件、主页  □朋友推荐               

发票抬头:

 

发票内容:

 

住宿明细

入住时间:

离店时间:

房间类型

□大床间

□标准间(和       合住)

□拼房(与其他学员拼标准间)

备注:

 

                                   

确定报名后,请将回执表发到上述联系人邮箱里。如在两日内没有收到回复,请电话联系确认。

编辑: 崔子冉   

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