深圳华大基因研究院(BGI)与美国国家进化综合中心(NESCent)将于2010年08月06日在中国深圳联合举办为期10天的系统发育信息学暑期班。此次暑期班主题为系统发育生物信息学,广大在校学生现在就可以开始在线申请,审查合格就可以6800元的优惠价格体验来自国际顶尖研究机构的系统生物信息学课程。
美国国家进化综合中心(NESCent)是由美国国家基金会资助,由杜克大学、北卡罗莱纳州立大学和北卡罗莱纳大学教堂山分校联合成立的重要学术合作机构。杜克大学在历史上曾有过“南方哈佛”之称。其本科学院在美国新闻和世界报道的2007年美国大学排名榜上排名第8,列全球大学排名第11位。连续五年在全美大学排名榜上名列第5。
深圳华大基因研究院(BGI)以推动基因组学和生物信息学发展为己任,本着传递前沿知识的目的,生物信息学培训班至今已走过6年的风雨历程。在这6年中,我们积累了丰富和珍贵的培训经验,搭建了高素质讲师梯队,形成了科学系统的培训教材和练习题库;拥有了大量自主知识产权分析软件;形成了卓越的实战型讲师团。
本期暑期班是两家国际顶尖基因组学和生物信息学研究机构的首次合作,本次暑期班是立足深圳,面向亚太地区招生,针对在校学生的技能型训练班。课程不仅提供理论指导,同时也为广大学员提供了亲自动手上机实践的机会,并由讲师团队提供全程技术支持。
课程还特别邀请到了来自耶鲁大学的William Piel博士和英属哥伦比亚大学的Rutger Vos博士,担任主讲师。两位博士同时也是Google Summer of Code 计划导师。通过这项计划,Google在每年的5月到8月期间将会为全球任何地方的参与编写开放资源软件的学生提供5000美元补助。到目前为止Google已经资助了98个国家大约2500名学生。我们鼓励有志于在2011年暑期为系统发育信息学编写开放代码的同学来到课程中与Dr. Piel和Dr. Vos探讨其研究方向。同时,也欢迎同学们带着在实际操作中遇到的问题来到课堂上研讨其解决办法。
在Perl阶段的课程中我们将会进行庞大的分析,其中包括访问所有的常用目标、不同格式文件和在Phyloinformatics和Bioperl中的应用的服务,通过一个较大的小树形系列,构建一个超级树形结构,然后挖掘GenBank中的序列以便为这个树形结构绘制图谱。对比序列,选择它们的替代模型,根据这些模型估算树形结构分支的长度,最后对比分支长度并应用到超级树形结构,最终的结构将会是一个在整合大量数据基础上的高度清晰的系统发展综合评估。
对于SQL课程我们主要是学习如何安装和连接到SQL92,在不依靠SQL生成工具的情况下与关联信息库进行基本内部交互作用以及如何在信息库中调控信息,并且学习怎样在SQL中表达作为邻接目录的阶层式数据,学习巢式序列表达法的最优方案。最终使学员在自己的操作下编写一个数据库:DBI。
BioPerl和BioSQL课程的重点将会放在教会学员设计并填充数据库,理解数据完整性并应用数据库约束去执行数据并为新类型数据创建一个关联模型,最终可以应用BioSQL构架实例化脚本创造一个BioSQL数据库。课程同时也将涉及到分布式软件的发展及其下级结构的最新进展等内容。
想近距离了解深圳华大基因研究院(BGI)和美国国家进化综合中心(NESCent)吗?一次深圳之行就可以做到,还等什么快快申请吧……
培训时间:课程时间:2010.08.06-2010.08.16
培训地点:课程地点:中国?深圳
主办单位:主办方:深圳华大基因研究院和美国国家进化综合中心
培训对象:学历背景要求:在读本科生、硕士生、博士生
学员名额:学员人数:25人