2010年6月 转录组表达谱专题班

作者:   2010-05-17
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培训特色:

1.东北地区首次新测序技术应用的生物信息学培训班;

2.讲师来自深圳华大基因研究院科研项目一线,实践经验丰富;

3.专题设置清晰,内容由浅入深,讲解系统;

4.最前沿技术、更高品质服务、边讲解边上机实践;

授课方式:

1.全天笔记本单机实习

2.采用理论授课与具体案例分析相结合,讲师与学员互动研讨的方式授课;

3.学时利用充分,晚上提供两小时上机自习辅导时间,全天累计10学时;

4.深入讲解华大基因开发的生物信息学工具软件,引导学员挖掘生物信息学资源;

5.课程结束后,考核合格者颁发结业证。

讲师团队:

彭智宇 深圳华大基因研究院科学生物信息部 RNA线项目负责人

毕业于北京大学生物信息学专业,博士学位,导师为李松岗教授和邓兴旺教授。主要研究方向“基因表达进化的研究”。长期从事基因表达调控信息的数据挖掘和生物信息学分析工具的研发工作。已发表的相关论文有:

Zhi-Yu Peng*, Huiyong Zhang*, Tingting Liu, Katherine M Dzikiewicz, Songgang

Li, Xiangfeng Wang, Guocheng Hu, Zhengge Zhu, Xinhua Wei, Qi-Hui Zhu,

Zongxiu Sun, Song Ge, Ligeng Ma, Lei Li, xingwang deng : Characterization of the

genome expression trends in the heading-stage panicle of six rice lineages.

Genomics. 2009. 93: 169-178.

Wang, X.*, A.A. Elling*, X. Li*, N. Li*, Z. Peng, G. He, H. Sun, Y. Qi, X.S. Liu, and

X.W. Deng. Genome-Wide and Organ-Specific Landscapes of Epigenetic

Modifications and Their Relationships to mRNA and Small RNA Transcriptomes in

Maize. Plant Cell. 2009.

Zhi-Yu Peng*, Xin Zhou*, Linchuan Li*, Xiangchun Yu, Hongjiang Li, Zhiqiang

Jiang, Guangyu Cao, Mingyi Bai, Xingchun Wang, Caifu Jiang, Haibin Lu, Lijia

Qu, Zhiyong Wang, Jianru Zuo, Xiangdong Fu, Jianmin Zhou, Zhen Su,

Songgang Li, and Hongwei Guo: Arabidopsis Hormone Database: A

Comprehensive Genetic and Phenotypic Information Database for Plant Hormone

Research in Arabidopsis, Nucleic Acids Research 2008; doi:

10.1093/nar/gkn873.

Li, L.*, Wang, X.*, Xia, M., Stolc, V., Su, N., Peng, Z., Li, S., Wang, J., Deng, X. W.

Tiling microarray analysis of rice chromosome 10 to identify the transcriptome

and relate its expression to chromosomal architecture. Genome Biol, 2005. 6(6):

p. R52.

刘航 深圳华大基因研究院科学生物信息部 RNA线转录组项目骨干人

毕业于中科院水生生物研究所,硕士学位,导师为朱作言教授和汪亚平教授,在华大一直从事基因表达调控信息的数据挖掘。参与过多项表达谱和转录组合作分析项目。

王晓玲 华大基因科技合作事业部培训主管 职业培训师

七年的生物信息学项目经验,负责组织实施生物信息学对外培训班,时刻跟进基因组学和生物信息学前沿动态,紧密结合BGI生物信息平台丰富的项目研究资源,实时更新培训内容,编撰培训教材及设计习题。

Publications:

?BMC Genomics 2007; 8: 93.

Identification and characterization of insect-specific proteins by genome data analysis.

?Science 2004; 306: 1937-40.

A draft sequence for the genome of the domesticated silkworm (Bombyx mori).

?Nature 2004; 432: 717-22.

A genetic variation map for chicken with 2.8 million single-nucleotide polymorphisms.

?Nucleic Acids Res 2005; 33: D399-402.

SilkDB: a knowledgebase for silkworm biology and genomics.

?Nucleic Acids Res. 2005 Jan 1;33 Database Issue:D438-41.

ChickVD: a sequence variation database for the chicken genome.

?PLoS Biol. 2005 Feb;3(2):e38. Epub 2005 Feb 01.

The Genomes of Oryza sativa: A History of Duplications.

?Theor Appl Genet. 2004 Mar;108(5):903-13. Epub 2003 Nov 18.

Characterization of soybean genomic features by analysis of its expressed sequence tags.

?Genome Res. 2002 May;12(5):824-31

RePS: A Sequence Assembler That Masks Exact Repeats Identified from the Shotgun Data.

隋欣 华大基因科技服务事业部助理培训师

毕业于澳大利亚悉尼大学(The University of Sydney),分子生物学和生物信息学双硕士,导师Dr Jenny Saleeba,主要研究方向土壤中微生物差异性(Microbial diversity in soils)等。

报名方式:

13651281331 王老师; 010-80481664/13611155716 曹老师

E-mail: training@genomics.org.cn (深圳华大基因研究院)

0411-87402740/13941177061 伦老师

E-mail:lunyongzhi@dlu.edu.cn (大连大学医学院)

报名截止:2010年6月22日

住宿交通:

协助安排大连大学创想宾馆【3星级】,100元/人/晚(标准二人间),费用自理。

附:大连大学乘车路线说明

机场:乘532路或710路至周水前下车,过马路换乘6路至金家街快轨站车站,换乘快轨至开发区,换乘开发区5路至大连大学。

火车站:乘轻轨列车,到开发区后再转5路车。

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