华大基因将多年积累的宝贵经验,分享给生命科学界的各位同仁。我们将秉承最前沿课程、高品质服务、重教学实践的宗旨,为您打造全面而实用的生物信息学精品课程——《生物信息学前沿技术专题培训班》。
课程特点:
1. 传递华大所掌握的最新的前沿信息;
2. 系统介绍科研项目如何从大思路着眼进行海量数据挖掘;
3. 结合华大各大项目实践经验,详细介绍多种数据分析软件的使用方法;
4. 华大经典项目总体设计思路、遇到的困难及解决方案。
华大基因应广大学者的需求,将前沿专题班内容进一步提炼并细化,期待您的参与!来这里您将目睹基因新技术和新产业的迷人魅力,来这里您将切身体会生物信息学的震撼力量,来这里您将感受业内顶尖专家学者的灵感火花……
主办单位:深圳市华大基因学院
举办地点:中国 深圳
培训时间:2016 年 3 月 21 日-3 月 25 日
课程安排:
第一天
1. 基因组学、生物信息学前沿技术动态(3 h)
2. 基因组 de novo 组装方法与软件(5 h)
第二天
3. 基因组注释和基因注释(8 h)
3.1 基因组注释的方法
重复序列注释 、基因预测、基因功能注释、非编码 RNA 基因注释、其它功能原件注释
3.2 上机与实操
(RepeatMasker、Genescan、Genewise、 InterproScan、tRNAScan-SE、序列综合分析 —— MEGA)
第三天
4. 单细胞分析技术(含项目设计)(3 h)
5. 全基因组或目标区域重测序数据分析 ( 4 h) SNP 分析、人工选择
第四天
6. 比较基因组 (4 h)
6.1 比较基因组学相关内容和分析方法
同源性与共线性、保守性与变异性、古基因组推断和重建、全基因组复制事件推断、比较功能基因组学
6.2 上机实操
A. 全基因组序列比对 BLASTZ
B. 共线性区块鉴定方法,Mcscan,、i-adhore 两部分
7. 进化分析 (4 h)
7.1 进化分析相关内容和分析方法
分子钟与蛋白质进化速率、碱基替换模型、基因家族进化研究、系统发育树构建、DNA 水平自然选择压力检测、方法与方案分析
7.2 上机实操
A. 基因家族聚类 OrthoMCL
B. 系统分育树构建常用软件
C. 分子进化分析 PAML
第五天
8. 蛋白质鉴定和质量控制
8.1 蛋白质搜库上机
8.2 蛋白质组数据分析
GO 功能分类和富集分析;通路分析;网络构建
8.3 上机实操
DAVID,Cytoscape+BiNGO,GSEA,CateGOrizer,Cluster+Treeview,Mev,Motifx 等
【注】:深圳市华大基因学院保留对以上课程信息(包括主题、课程安排和其他细节)进行调整的权利,具体课程信息以实际上课为准。
讲师团队
·各专题学科带头人、《nature》《science》作者亲自授课。
培训特色
·培训宗旨——尽华大所能,全力为您打造您所需要的课程,最大可能的满足您的需求
·一流的讲师团队——丰富的软件研发经验、重大项目执行经验
·理论课与实践课相结合,讲师与学员研讨的方式进行
·精心挑选相应的上机软件,为每位学员提供实际操作的机会
·课下主讲老师为您所遇到的瓶颈问题提供个性化解答
·为保证培训效果及培训质量,每期班的课程人数不超过 30 人。资源有限,欲报从速。
收费标准
·注册费:6800 元/人,含学费、资料费、上机费、餐费等;
·培训期间协助安排住宿,住宿费用自理。
课程对象
·从事生命科学、医学、农学等领域科研工作者和高校教师及研究生
·具备生物信息学基础的学者
联系方式
·联系电话:0755-36352044 对外培训组(咨询时间:周一至周五 9:00-18:00)
·E-mail:training@service.genomics.cn ·如有任何疑问请发邮件 training@service.genomics.cn 或 留言 。