多组学实验及数据分析系列研习会(第五期)之转录组、蛋白质组和代谢组学会议

作者:   2016-03-07
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  • 会议时间: 2016-04-25至 2016-04-29
  • 会议地点: 上海
  • 电话:18917805836
  • 传真:暂无
  • 联系人:许丹丹
  • Email: 1377122204@qq.com
  • 联系地址:上海市奉贤区明城路1168弄4号802室
  • 会议网址:暂无

会议背景:

在后基因组时代,生命科学研究开始进入系统、全面、动态的功能探索阶段。多种高通量的研究策略如基因组测序、转录组测序、小 RNA 测序、蛋白质组定量实验和代谢组学被组合应用到同一个课题研究中,在原先单个平台产出数据分析挖掘的的基础上增加了多个实验平台产出数据的整合分析。本系列研习会将深入探讨转录组、蛋白质和代谢组的实验方法、研究策略、实验设计和数据分析,并介绍转录组和蛋白质组实验整合研究的案例,研讨内容由多年实践经验的科研和技术人员进行讲解和带领数据分析的实际上机操作。

会议时间:2016 年 4 月 25 日~4 月 29 日
会议地点:上海中电大酒店,上海市浦东新区南泉北路 1029 号中电大厦(近张扬路)

会议日程:

4 月 25 日(周一)下午 14:30~17:30  或 4 月 26 日上午 8:30-9:30 注册。

4 月 26 日(周二)上午(9:30~12:00)
基于质谱技术的蛋白质组学研究
修饰蛋白质组学研究

4 月 26 日(周二)下午(13:30~17:30)
蛋白质组学数据分析搜索引擎
质谱搜库软件演示和 maxquant 上机实习 
蛋白质组学数据分析 1.6 Mev 软件上机

4 月 27 日(周三)上午(9:00~12:00)
蛋白质组常用数据库和网站   包括 NCBI、UNIRPOT 数据库资源,Gene Ontology,KEGG 网站介绍
维恩分析,GO 分析,KEGG 分析上机

4 月 27 日(周三)下午(13:30~17:30)
当代蛋白质组学研究方法综述 
蛋白质组学在肿瘤研究中的应用
蛋白质组学在药物研究中的应用
采用 cytoscape 进行蛋白蛋白相互作用网络构建和计算

4 月 28 日(周四)上午(9:00-12:00)
转录组测序数据分析及其在临床医学方面的应用研究

4 月 28 日(周四)下午(13:30-17:30)
转录组测序在农林方面的应用研究
转录组和蛋白质组整合分析案例介绍

4 月 29 日(周五)上午(9:00-12:00)
LC-MS、GC-MS、CE-MS 在代谢组学中的应用
靶向代谢组学及脂质组学介绍

4 月 29 日(周五)下午(13:30-17:30)
NMR 技术基础及其在代谢组数据处理中的应用
多组学数据分析案例
多维统计分析(SIMCA-P 软件)及 LC-MS 数据解析
聚类分析、富集分析、网络模型构建

注:
1. 课程具体安排以报名当天的课程表为准;
2. 因需上机练习,请自带笔记本电脑,默认是 windows 系统,若安装的是 linux 或苹果 iOS 请自行下载上机软件。
我们所讲解的软件均是可以免费获取的,但可能有操作系统的限制。

收费标准
1.  标准费用 4000 元/人(含资料费和中餐)
2.  仅报名 4 月 26 日、27 日蛋白质组学课程 2600 元/人(含资料费和中餐)
3.  仅报名 4 月 28 日、29 日转录组和代谢组课程 2600 元/人(含资料费和中餐)

联系方式:

许丹丹 ddxu@biorefer.com; 1377122204@qq.com;189-1780-5836;021-311315312

讲师信息:

戴文韬 博士,毕业于中科院生物物理所,从事生物信息学研究多年,利用数据挖掘和机器学习方法从事生物大分子模拟分析,组学数据分析挖掘等工作。发展了进行蛋白结构模型质量评估和蛋白相互作用界面预测的算法,开发了在国内处于最高精度的蛋白结构预测服务器。

侯辰瑞 资深蛋白质组学工程师,具有超过 10 年的蛋白质组学方向的从业经历,承接过大量的不同类型、不同物种的蛋白质组学服务项目,在实验设计和实施上有丰富的经验。 

何有裕 具有超过 15 年的生命科学方向的从业经历,尤其在高通量测序方面有丰富的实验设计和数据分析经验。 

库鑫 博士,2007 年毕业于华中科技大学同济医学院,获学士学位。同年 9 月被保送至中科院上海药物研究所并于 2010 年取得硕士学位。2010 年 10 月至 2014 年 6 月在德国慕尼黑工业大学(Technische Universität München)生物分析与蛋白质组学研究所(Prof. Bernhard Kuster)攻读博士学位,专业方向为基于串联质谱的蛋白质组学在肿瘤药物研究中的应用。现任职于上海交通大学系统生物医学研究院,研究方向为肿瘤相关生物标志物的发现和蛋白质糖基化修饰的研究。库鑫博士长期从事肿瘤蛋白质组学的相关研究,在国际期刊上发表过多篇相关论文。 

徐志平 毕业于湖北大学,主修遗传学,从事分子生物学和微生物学相关研究,发表多篇相关 SCI 学术论文。就职于 Anachro Technologies Inc. 接受 Chenomx Inc.  公司(基于核磁共振代谢组目标性分析法的创始者)原厂技术人员的专业技术培训及指导,专注于代谢组分析方面的工作,其中包括使用 Chenomx Inc. 公司的专利化技术「目标性分析法」提供代谢组样本分析服务、高通量代谢组样本分析的实现,以及多种分析技术在代谢组分析中的交叉互补研究。迄今为止已为全球 10 个国家的研究人员完成超过 20000 个样本的代谢组数据分析。 

于复东 博士、副研究员,2008 年 1 月毕业于中国科学院上海生命科学研究院,获生物信息学博士学位。毕业后一直从事二代测序等高通量数据分析、肿瘤基因组学、及相关数据库开发和分析平台建立等生物信息学研究工作。目前主要从事肿瘤基因组学方面的研究工作,运用系统生物学的方法研究可以应用于临床早期诊断、预后、复发和转移相关的分子标志物基因及其功能等。近年来作为项目负责人完成了国家自然科学基金、上海市博士后基金、上海市白玉兰科技人才基金各一项,作为生物信息学分析平台负责人完成传染病重大专项课题一项,作为技术骨干参与完成 863 计划项目一项,累积发表 SCI 论文十余篇。 

俞鸿,资深生物信息学工程师  具有超过 10 年生物信息学分析经验。参与了水稻基因组、家蚕基因组、人肝蛋白质组计划以及其他的国家 973、863 计划及国家自然科学基金等项目。主要从事蛋白质组、基因组方向的数据分析. 

吴谦博士,副研究员,上海生物信息技术研究中心质谱平台负责人,从事质谱研究十多年,近年研究方向主要为蛋白质组学、代谢组学及质谱定量分析新方法开发。         

编辑: 宋珺    来源:丁香园

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