第五期蛋白质组信息学培训班 (第一轮通知)

作者:   2016-06-08
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  • 会议时间: 2016-08-02至 2016-08-05
  • 会议地点: 北京
  • 电话:(010)61777010
  • 传真:(010)61777050
  • 联系人:北京蛋白质组研究中心
  • Email: dw3026@163.com
  • 联系地址:北京市昌平区科学园路38号(102206)
  • 会议网址:http://www.bprc.ac.cn/

时间:2016 年 8 月 2-5 日

地点:北京蛋白质组研究中心(北京市昌平区科学园路 38 号,中关村生命科学园内)

主办单位

  • 国家蛋白质科学中心•北京 (凤凰中心)

  • 北京蛋白质组研究中心(BPRC)

  • 蛋白质组学国家重点实验室(SKLP)

  • 中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会(CNHUPO)

国家蛋白质科学中心•北京(简称「凤凰中心」)/北京蛋白质组研究中心(BPRC)坐落在国家科技创新示范区——中关村生命科学园,是我国生命科学领域的国家科技基础设施,也是国际人类肝脏蛋白质组计划执行总部、蛋白质组学国家重点实验室和首都科技条件平台。

凤凰中心/BPRC 在以院士领衔,入选「千人计划」、国家杰青、北京市科技新星为骨干的专家团队带领下,在生命科学领域不断开拓,建立了高通量、高分辨率、高精度的蛋白质组学,以高性能「天河」超级计算机为核心的生物信息学,蛋白质相互作用,多功能多层次显微成像,流式分选,模式生物构建,抗体药物筛选等技术体系与平台。我们愿与从事生命科学研究的有识之士一起,推动生命科学新发现、新技术、新产品的涌现,实现「创造历史,引领世界」的梦想。

培训目的

本课程为生命科学研究人员介绍如何合理利用和开发蛋白质生物信息学资源。课程着眼于实际数据库搜索、工具使用、大型数据库分析、生物学网络构建、可视化和数据分析等。采取小班授课,专人指导;理论课与实践课相结合,讲师与学员研讨的方式进行;精心挑选相应的上机软件,提供充足的实际操作机会;让每位学员学有所成。

培训对象

  • 从事生命科学、农学、医学等领域科研工作者和高校教师及研究生

  • 迫切希望提升生物信息分析能力的学者

培训内容

质谱数据深度分析、蛋白质注释及功能分析、蛋白质相互作用网络构建及分析、蛋白质组研究主题信息服务和专业数据库研发。

课程安排


2016 年 8 月 2 日
主持人:杨冬朱伟民
主题:蛋白质组信息学蛋白质鉴定
时间 主讲人 培训内容
9:00-10:00 讲座朱伟民
  • 课程介绍

  • 蛋白质组学

  • 蛋白质组信息学工作流程

10:00-10:45 讲座

朱伟民

工作流原理

  • 序列数据库

  • 肽段鉴定

  • 蛋白组装

  • 蛋白定量

  • 质量控制和标准

10:45-11:00茶歇
11:00-11:45 讲座杨冬工作流原理
  • 翻译后修饰

  • 数据挖掘

  • 数据注释

  • 聚类和其他分析

11:45-12:30 练习

杨冬常用的生物信息数据库和工具
12:30-13:30午餐
13:30-14:30 讲座杨冬Mascot:实践中的搜索工具

14:30-15:15 练习

杨冬搜索工具的环境
15:15-15:30茶歇

15:30-16:30 讲座

杨冬 搜索工具实际应用
16:30-17:15 讲座朱伟民

数据依赖采集 (DDA)

数据非依赖采集 (DIA)

17:15-18:00BBQ 和墙报展示
2016 年 8 月 3 日
主持人:朱云平
主题:定量蛋白质组
时间主讲人
培训内容
9:00-10:00 讲座常乘标记定量蛋白质组学:precursor 标记方法
10:00-10:45 讲座常乘标定定量蛋白质组学:isobaric 标记方法
10:45-11:00 茶歇
11:00-11:45 练习

常乘

马洁

冯晓东

MaxQuant 标记定量上机练习
11:45-12:30 练习

常乘

马洁

冯晓东

练习
12:30-13:30午餐
13:30-14:30 讲座常乘非标定量蛋白质组学
14:30-15:15 练习常乘差异表达蛋白的统计分析
15:15-15:30茶歇
15:30 讲座常乘PANDA 和 PANDA 视图介绍
16:30 练习常乘

马洁

冯晓东

PANDA 和 PANDA 视图
17:15 结束

2016 年 8 月 4 日

主持人:冯晋文
主题:工作流数据发布
时间主讲人培训内容

9:00 讲座

冯晋文TPP(trans proteome pipeline) 数据分析平台介绍

10:00 练习

冯晋文


  • 基于 X!Tandem 肽段鉴定

  • 基于 peptide Prophet 肽段验证

10:45-11:00茶歇

11:00 练习

冯晋文

蛋白质定量

  • Libra

蛋白质组装

  • Protein Prophet

11:45 练习

冯晋文实际操作
12:30-13:30  午餐

13:30 讲座

冯晋文Firmiana 简介

14:30 练习

冯晋文Firmiana 上机练习
15:15-15:30 茶歇

15:30 讲座

Henning Hermjakob数据存储与发布:ProteomeXchange

16:30 练习

马洁实际操作:基于 Iprox 的数据存储

17:15-18:00 

参观 Phoenix center

2016 年 8 月 5 日

主持人:李栋
主题:网络和通路
时间 主讲人培训内容

9:00 讲座

李栋蛋白质网络的构建与分析

10:00 讲座

李栋蛋白质数据集深度挖掘
10:45茶歇

11:00 练习

李栋

网络工具介绍:

  • KEGG, Reactome

  • STRING

11:45 练习

李栋上机练习
12:30午餐

13:30 讲座

刘中扬Cytoscape 简介

14:30 练习

刘中扬Cytoscape 上机练习
15:15-15:30茶歇

15:30-16:30 练习

刘中扬Cytoscape 上机练习
17:15 结束


培训费用

  • 即日起至 8 月 1 日之间注册:每人 4500 元,学生 4000 元。

  • 培训费用包含:培训资料、培训期间的午、晚餐。

  • 可协助安排住宿,住宿费用自理。需住宿的学员请在网上注册时填写住宿信息。

报到时间和地点

  • 报到:8 月 1 日全天,凤凰中心/BPRC

  • 培训:8 月 2-5 日,凤凰中心/BPRC(北京市昌平区科学园路 38 号,中关村生命科学园内)。

  • 住宿:北京梧桐苑商务酒店,预订电话:010-61777200(预定时请说明参加此次会议)

  • 学员自备笔记本电脑(具有 WiFi 无线网络功能)用以操作练习。

汇款信息

帐号:0200004909200041055

账户名称:北京蛋白质组研究中心

开户银行:工商银行北京市永定路支行

注:汇款时请务必注明学员姓名、单位和「信息学培训班」字样。汇款后将汇款凭据传真至中心,或将扫描电子版发送至邮箱 bprctrain@163.com,以确保汇款安全到账。

如需发票请注明发票抬头,培训结束后统一开具发票(培训费、注册费、会议费、技术服务费等),有其他特殊要求请声明。

联系方式

联系电话: 注册:(010)61777015    咨询:(010)61777010

传真:(010)61777050

电子邮件:dw3026@163.com

通信地址:北京市昌平区科学园路 38 号(102206)

编辑: 朱卿    来源:丁香园

声明:

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