时间:2016 年 8 月 2-5 日
地点:北京蛋白质组研究中心(北京市昌平区科学园路 38 号,中关村生命科学园内)
主办单位
国家蛋白质科学中心•北京 (凤凰中心)
北京蛋白质组研究中心(BPRC)
蛋白质组学国家重点实验室(SKLP)
中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会(CNHUPO)
国家蛋白质科学中心•北京(简称「凤凰中心」)/北京蛋白质组研究中心(BPRC)坐落在国家科技创新示范区——中关村生命科学园,是我国生命科学领域的国家科技基础设施,也是国际人类肝脏蛋白质组计划执行总部、蛋白质组学国家重点实验室和首都科技条件平台。
凤凰中心/BPRC 在以院士领衔,入选「***」、国家杰青、北京市科技新星为骨干的专家团队带领下,在生命科学领域不断开拓,建立了高通量、高分辨率、高精度的蛋白质组学,以高性能「天河」超级计算机为核心的生物信息学,蛋白质相互作用,多功能多层次显微成像,流式分选,模式生物构建,抗体药物筛选等技术体系与平台。我们愿与从事生命科学研究的有识之士一起,推动生命科学新发现、新技术、新产品的涌现,实现「创造历史,引领世界」的梦想。
培训目的
本课程为生命科学研究人员介绍如何合理利用和开发蛋白质生物信息学资源。课程着眼于实际数据库搜索、工具使用、大型数据库分析、生物学网络构建、可视化和数据分析等。采取小班授课,专人指导;理论课与实践课相结合,讲师与学员研讨的方式进行;精心挑选相应的上机软件,提供充足的实际操作机会;让每位学员学有所成。
培训对象
从事生命科学、农学、医学等领域科研工作者和高校教师及研究生
迫切希望提升生物信息分析能力的学者
培训内容
质谱数据深度分析、蛋白质注释及功能分析、蛋白质相互作用网络构建及分析、蛋白质组研究主题信息服务和专业数据库研发。
课程安排
2016 年 8 月 2 日 | ||
主持人:杨冬朱伟民 | ||
主题:蛋白质组信息学蛋白质鉴定 | ||
时间 | 主讲人 | 培训内容 |
9:00-10:00 讲座 | 朱伟民 |
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10:00-10:45 讲座 | 朱伟民 | 工作流原理
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10:45-11:00 | 茶歇 | |
11:00-11:45 讲座 | 杨冬 | 工作流原理
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11:45-12:30 练习 | 杨冬 | 常用的生物信息数据库和工具 |
12:30-13:30 | 午餐 | |
13:30-14:30 讲座 | 杨冬 | Mascot:实践中的搜索工具 |
14:30-15:15 练习 | 杨冬 | 搜索工具的环境 |
15:15-15:30 | 茶歇 | |
15:30-16:30 讲座 | 杨冬 | 搜索工具实际应用 |
16:30-17:15 讲座 | 朱伟民 | 数据依赖采集 (DDA) 数据非依赖采集 (DIA) |
17:15-18:00 | BBQ 和墙报展示 | |
2016 年 8 月 3 日 | ||
主持人:朱云平 | ||
主题:定量蛋白质组 | ||
时间 | 主讲人 | 培训内容 |
9:00-10:00 讲座 | 常乘 | 标记定量蛋白质组学:precursor 标记方法 |
10:00-10:45 讲座 | 常乘 | 标定定量蛋白质组学:isobaric 标记方法 |
10:45-11:00 | 茶歇 | |
11:00-11:45 练习 | 常乘 马洁 冯晓东 | MaxQuant 标记定量上机练习 |
11:45-12:30 练习 | 常乘 马洁 冯晓东 | 练习 |
12:30-13:30 | 午餐 | |
13:30-14:30 讲座 | 常乘 | 非标定量蛋白质组学 |
14:30-15:15 练习 | 常乘 | 差异表达蛋白的统计分析 |
15:15-15:30 | 茶歇 | |
15:30 讲座 | 常乘 | PANDA 和 PANDA 视图介绍 |
16:30 练习 | 常乘 马洁 冯晓东 | PANDA 和 PANDA 视图 |
17:15 | 结束 | |
2016 年 8 月 4 日 | ||
主持人:冯晋文 | ||
主题:工作流数据发布 | ||
时间 | 主讲人 | 培训内容 |
9:00 讲座 | 冯晋文 | TPP(trans proteome pipeline) 数据分析平台介绍 |
10:00 练习 | 冯晋文 |
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10:45-11:00 | 茶歇 | |
11:00 练习 | 冯晋文 | 蛋白质定量
蛋白质组装
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11:45 练习 | 冯晋文 | 实际操作 |
12:30-13:30 | 午餐 | |
13:30 讲座 | 冯晋文 | Firmiana 简介 |
14:30 练习 | 冯晋文 | Firmiana 上机练习 |
15:15-15:30 | 茶歇 | |
15:30 讲座 | Henning Hermjakob | 数据存储与发布:ProteomeXchange |
16:30 练习 | 马洁 | 实际操作:基于 Iprox 的数据存储 |
17:15-18:00 | 参观 Phoenix center | |
2016 年 8 月 5 日 | ||
主持人:李栋 | ||
主题:网络和通路 | ||
时间 | 主讲人 | 培训内容 |
9:00 讲座 | 李栋 | 蛋白质网络的构建与分析 |
10:00 讲座 | 李栋 | 蛋白质数据集深度挖掘 |
10:45 | 茶歇 | |
11:00 练习 | 李栋 | 网络工具介绍:
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11:45 练习 | 李栋 | 上机练习 |
12:30 | 午餐 | |
13:30 讲座 | 刘中扬 | Cytoscape 简介 |
14:30 练习 | 刘中扬 | Cytoscape 上机练习 |
15:15-15:30 | 茶歇 | |
15:30-16:30 练习 | 刘中扬 | Cytoscape 上机练习 |
17:15 | 结束 |
培训费用
即日起至 8 月 1 日之间注册:每人 4500 元,学生 4000 元。
培训费用包含:培训资料、培训期间的午、晚餐。
可协助安排住宿,住宿费用自理。需住宿的学员请在网上注册时填写住宿信息。
报到时间和地点
报到:8 月 1 日全天,凤凰中心/BPRC
培训:8 月 2-5 日,凤凰中心/BPRC(北京市昌平区科学园路 38 号,中关村生命科学园内)。
住宿:北京梧桐苑商务酒店,预订电话:010-61777200(预定时请说明参加此次会议)
学员自备笔记本电脑(具有 WiFi 无线网络功能)用以操作练习。
汇款信息
帐号:0200004909200041055
账户名称:北京蛋白质组研究中心
开户银行:工商银行北京市永定路支行
注:汇款时请务必注明学员姓名、单位和「信息学培训班」字样。汇款后将汇款凭据传真至中心,或将扫描电子版发送至邮箱 bprctrain@163.com,以确保汇款安全到账。
如需发票请注明发票抬头,培训结束后统一开具发票(培训费、注册费、会议费、技术服务费等),有其他特殊要求请声明。
联系方式
联系电话: 注册:(010)61777015 咨询:(010)61777010
传真:(010)61777050
电子邮件:dw3026@163.com
通信地址:北京市昌平区科学园路 38 号(102206)