2016 年 8 月组学数据分析与挖掘研讨班

作者:   2016-07-11
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  • 会议时间: 2016-08-23至 2016-08-26
  • 会议地点: 北京
  • 电话:010-59341773
  • 传真:暂无
  • 联系人:员老师
  • Email: yuanll@bcc.ac.cn
  • 联系地址:暂无
  • 会议网址:暂无

您是否还在苦恼如何通过 GO/KEGG/DAVID 注释的目的找出基因表达与疾病的关系?

您是否知道怎样做靶基因、转录因子和增强子的预测,及如何从这些预测的数据中锁定待研究的靶标?北京市计算中心 8 月 23 号至 26 日的培训将帮您解决您的苦恼与疑惑!

本期培训班以生物医学基因组数据分析为主题,从学员的实际问题出发,详细讲解该领域常用的研究方法,结合实际上机操作系统学习分析软件的使用和图表绘制方法,真正解决您的科研苦恼与困扰。赶快来参加我们的培训班吧。真诚的欢迎您的到来!

主办单位:

北京市计算中心(生物计算事业部)

中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会

培训地点:北京海淀区丰贤中路 7 号 3 号楼,北京市计算中心三层会议室

本次课程时间: 2016.8.23-8.26(火热报名中)

上课时间:上午:9:00 - 12:00    下午:1:30 – 5:30

时间

课程名称

课程内容

第一天上午

人类基因组测序、数据库、全基因组关联分析

  • Linux 基础与常用命令

  • 人类基因组测序及生物信息学分析理论基础

  • 人类基因组与遗传变异数据库、数据资源获得

  • 全基因组关联分析(GWAS)理论与实践、低覆盖度测序+基因型填充原理

第一天下午

基因组重测序与 GWAS 数据分析

  • 对二代测序数据的解读及数据质量控制及数据过滤

  • 使用 BWA 和 Samtools 进行数据比对及结果 IGV 可视化

  • 寻找 SNP 和 Indel 并进行注释

  • 基因组变异 ANNOVAR 功能注释

  • 关联分析软件 Plink、Haploview 等软件使用

第二天上午

生物信息学专业常用工具及科研绘图

  • ioedit 与生物信息序列处理

  • last 与序列检索比对及参数、Blast 建库与 Blast 本地化

  • Mega 的使用及系统发育分析

  • 分子网络分析工具 Cytoscape 使用

  • 运用生物信息常用的工具进行专业绘图及格式转换

第二天下午

蛋白结构基础及常用工具软件

  • 蛋白质结构分析与 PDB 数据库应用

  • DB 文件格式概述

  • 常用蛋白结构分析软件应用(VMD,Pymol 等)

第三天上午

转录组数据分析上机操作

  • 转录组数据准备和软件介绍及安装

  • 转录组数据的比对(重点讲解)

  • 表达量估计和分析(重点讲解)

  • 使用 DAVID 进行功能分析与基因浏览器

第三天下午

RNA-seq 与基因表达与疾病的关系

  • 转录组与小 RNA 测序在人类医学中应用

  • 基因表达与人类医学数据分析

  • 基因本体数据及 GO 注释

  • 生物学通路 KEGG 注释方法与实现

第四天上午

转录组学测序技术

  • 从转录组数据发现 SNPs

  • 从转录组数据预测 lncRNAs

第四天下午

TCGA 项目及数据应用

  • TCGA 项目及数据介绍

  • TCGA 数据在医学应用中的案例分析

(课程内容以实际授课为准)

注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。

特色:

1. 一线讲师团队,具有丰富的项目经验

2. 理论知识与上机操作相结合,为每位学员提供实际操作机会

3. 增值服务, 课下主讲老师将为您实际工作中遇到的问题提供个性化解答

4. 小班教学,每期培训班的人数不超过 35 人

报名费用:

注册费 4800 元,含听课费、资料费、上机费和午餐。请自带笔记本电脑用以上机实习。所有学员自动成为 VIP 会员,永久享受生物计算分析服务 9 折优惠。

报名优惠政策

1. 3 人以上团体报名每人可减少 300 元

2. 4+1 团报,可免费赠送一个名额

3. 上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。

联系方式:

于老师 010-59341771, QQ 号:2814500767,

员老师 010-59341773,   邮箱:yuanll@bcc.ac.cn

付费方式:现金、支票、银行转账、银行汇款

单位全称:北京市计算中心

账     号:0200151819100023937

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

(备注:在汇款明细里加上「生物计算事业部——您的姓名+单位」)


编辑: 王雪婷   

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