以「共变法」思想为核心的关联分析是研究人类复杂疾病的主要手段,其与以「求同法」思想为核心的「序列比对(Blast)」同样重要,但方法学却复杂得多。北京市计算中心生物计算事业部,主要针对具备一定统计学、遗传学、分子生物学基础的人类医学领域研究人员,特开设人类医学数据关联分析精品班。
为了确保教学质量,授课团队由具有 9 年以上统计学、遗传学、人类医学及计算科学研究经验的老师领衔,曾成功申请、主持或参与国内外多项重大课题,具有丰富的论文写作、发表经验,小班人数限 15-20 人, 额满为止。
一、举办单位
主办单位:
中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位:
北京市计算中心
协办单位:
云计算关键技术与应用北京市重点实验室
中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
中国生物工程杂志
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司
二、培训安排
举办地点:北京市海淀区丰贤中路 7 号北科产业 3 号楼
培训时间:2016 年 9 月 26 日-9 月 28 日
日期 | 授课题目 | 授课内容 |
第一天 | 人类医学统计分析与 R 实践 | 1. 统计学基础、经典概率论、贝叶斯概率及其统 计 2. R 语言基础 |
使用 R 语言进行基础统计学分析与医学数据分析:假设检验、方差分析、线性回归、聚类分析和主成分分析等 | ||
第二天 | 人类基因组测序、数据库、全基因组关联分析 | 1. 人类基因组测序及生物信息学分析理论基础 2. 遗传变异位点与基因分型 3. 人类基因组与遗传变异数据库、数据资源获得、使用及分析 |
1. 全基因组关联分析(GWAS)理论与实践 2. link、Haploview 等软件使用 3. 低覆盖度测序+基因型填充原理 4. 基因型填充软件 Beagle 的数据格式与使用 | ||
第三天 | RNA-seq 及基因表达与疾病的关系 | 1. 转录组与小 RNA 测序在人类医学中应用 2. 基因表达与人类医学数据分析 |
基于 NGS 的 GWAS 上机 | 1. Linux 基础与常用命令 2. 外显子组、重测序测序数据分析 3. 基因组 IGV 可视化 4. 基因组变异 ANNOVAR 功能注释 |
(课程内容以实际授课为准)
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。
三、培训特色
1. 无需任何计算机语言基础
2. 深入简出,内容精要实用
3. 结合人类医学、动植物育种等生物学数据背景知识与实例讲授
4. 统计学原理+模型/算法+编程实现+生物医学应用
5. 边学边练,重实践,力求实效
6. 小班授课,个别辅导
四、报名费用
注册费:3500 元/人(含听课费、资料费、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)
付费方式:
现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心
账号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(汇款信息里备注上:「生物计算事业部——您的姓名」)
报名优惠政策:
1. 2016 年 9 月 1 日前报名并缴费,可享受减免 400 元优惠
2. 3 人以上团体报名每人可减少 400 元
3. 4+1 团报,可免费赠送一个名额
4. 上面 3 种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种
注:培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。
五、联系咨询
员老师:010-59341773
邮箱:yuanll@bcc.ac.cn
QQ:2814500767
于老师:010-59341771
邮箱:yurt@bcc.ac.cn