2016 年人类医学数据关联分析精品班

作者:   2016-08-03
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以「共变法」思想为核心的关联分析是研究人类复杂疾病的主要手段,其与以「求同法」思想为核心的「序列比对(Blast)」同样重要,但方法学却复杂得多。北京市计算中心生物计算事业部,主要针对具备一定统计学、遗传学、分子生物学基础的人类医学领域研究人员,特开人类医学数据关联分析精品班。

为了确保教学质量,授课团队由具有 9 年以上统计学、遗传学、人类医学及计算科学研究经验的老师领衔,曾成功申请、主持或参与国内外多项重大课题,具有丰富的论文写作、发表经验,小班人数限 15-20 人, 额满为止。

一、举办单位

主办单位

中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会

承办单位

北京市计算中心

协办单位:

云计算关键技术与应用北京市重点实验室

中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会

北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心

中国生物工程杂志

北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司

二、培训安排

举办地点:北京市海淀区丰贤中路 7 号北科产业 3 号楼

培训时间2016 年 9 月 26 日-9 月 28 日

日期授课题目授课内容
第一天人类医学统计分析与 R 实践

1. 统计学基础、经典概率论、贝叶斯概率及其统

2. R 语言基础

使用 R 语言进行基础统计学分析与医学数据分析:假设检验、方差分析、线性回归、聚类分析和主成分分析等
第二天人类基因组测序、数据库、全基因组关联分析1. 人类基因组测序及生物信息学分析理论基础
2. 遗传变异位点与基因分型
3. 人类基因组与遗传变异数据库、数据资源获得、使用及分析
1. 全基因组关联分析(GWAS)理论与实践
2. link、Haploview 等软件使用
3. 低覆盖度测序+基因型填充原理
4. 基因型填充软件 Beagle 的数据格式与使用
第三天RNA-seq 及基因表达与疾病的关系1. 转录组与小 RNA 测序在人类医学中应用
2. 基因表达与人类医学数据分析
基于 NGS 的 GWAS 上机1. Linux 基础与常用命令
2. 外显子组、重测序测序数据分析
3. 基因组 IGV 可视化
4. 基因组变异 ANNOVAR 功能注释

(课程内容以实际授课为准)

注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。

三、培训特色

1. 无需任何计算机语言基础

2. 深入简出,内容精要实用

3. 结合人类医学、动植物育种等生物学数据背景知识与实例讲授

4. 统计学原理+模型/算法+编程实现+生物医学应用

5. 边学边练,重实践,力求实效

6. 小班授课,个别辅导

四、报名费用

注册费:3500 元/人(含听课费、资料费、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)

付费方式:

现金、支票、银行转账、银行汇款

单位全称:北京市计算中心

账号:0200151819100023937

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

(汇款信息里备注上:「生物计算事业部——您的姓名」)

报名优惠政策:

1. 2016 年 9 月 1 日前报名并缴费,可享受减免 400 元优惠

2. 3 人以上团体报名每人可减少 400 元

3. 4+1 团报,可免费赠送一个名额

4. 上面 3 种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种

注:培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。

五、联系咨询

员老师:010-59341773

邮箱:yuanll@bcc.ac.cn

QQ:2814500767

于老师:010-59341771

邮箱:yurt@bcc.ac.cn

编辑: 王雪婷   

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