随着高通量测序技术的不断发展,测序成本逐渐降低,基因组、转录组测序变得越来越普遍。二代测序技术由于读长较短,对于重复序列高、杂合率高的基因组往往组装质量较差。高质量的参考基因组对我们的研究是非常重要的,但是某些复杂动植物基因组(高重复序列、高杂合率)一直是基因组组装的难题。三代测序技术以其独特的长读长优势,可以很好地解决复杂基因组组装的难题。成功的解决了包括基因组组装,碱基修饰,转录组分析等问题,随着三代测序技术的快速发展,其应用必将对基因组研究、疾病医疗研究、药物研发、育种等领域产生巨大的推动作用。
为帮助各领域广大科研人员解决如何选择三代测序文库,如何优化测序实验方案,如何了解并掌握测序数据分析流程,如何进行基因组、转录组和碱基修饰分析等问题。北京市计算中心特聘请行业一线项目经验丰富的科研人员精心组织了本次培训课程,为保证听课质量和教学质量,本研讨班采用小班授课方式。课程内容针对性极强、上机实践比重更达到 70%,整套课程教学目的明确,从三代测序(单分子测序)实验方案的宏观到细节再到注意事项的讲解,为项目能产出更有效的测序数据打下坚实的基础,上机实践课程贯穿从测序数据下机后质量评估、数据筛选到基因组分析、转录组分析整个流程。诚邀各领域广大科研工作者和高校教师及研究生报名参加!
一、组织机构
主办单位:
中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位:
北京市计算中心
协办单位:
云计算关键技术与应用北京市重点实验室
中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
中国生物工程杂志
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司
二、培训安排
培训地点:北京海淀区丰贤中路 7 号 3 号楼,北京市计算中心三层会议室
课程时间:2016 年 10 月 17-19 日(报名中)
上课时间:9:00-12:00/13:30-17:30
日期 | 授课题目 | 授课内容 |
第一天 | 基于三代测序的基因学研究 | 1. 三代测序在基因组学研究中的应用 2. 三代测序实验方案,包括文库选择,测序文库构建注意事项 3. 三代基因组 De novo 测序及技术流程 |
实例分析+上机 | 1. 三代基因组实例分析 2. 软件介绍及上机操作(SMRT MHAP Spades、PBJelly) | |
第二天 | 基于三代测序的转录组学研究 | 1. 三代测序在转录组学研究中的应用 2. 三代测序实验方案,包括文库选择,测序文库构建注意事项 3. 三代全长转录组分析流程 |
实例分析+上机 | 1. 三代全长转录组实例分析 2. 软件介绍及上机操作(SMRT-Analysis Isoseq) | |
第三天 | 基于三代测序的甲基化研究 | 1. 碱基修饰研究技术进展 2. 碱基修饰芯片技术原理及流程介绍 3. 碱基修饰实验数据分析上机操作上机操作数据分析及问题解答 |
(课程内容以实际授课为准)
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。
三、讲师团队
邀请中科院和北京市计算中心一线工作经验丰富的老师主讲。
四、报名费用
注册费:2500 元/人(资料费、上机费、午餐费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)
附近最近酒店为:如家酒店(永丰店),可自行网上预定,费用自理。
报名优惠政策:
1. 9 月 20 日报名缴费可优惠 300 元
2. 3 人以上团体报名每人可减少 300 元
3. 4+1 团报,可免费赠送一个名额
4. 上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排
付费方式:
现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心
账 号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(备注:在汇款明细里加上「生物计算事业部——您的姓名+单位」)
五、联系咨询
于老师
电话:010-59341771
QQ 号:2814500767
员老师
电话:010-59341773
手机:18701529461
邮箱:yuanll@bcc.ac.cn