为帮助各领域广大科研人员解决从方案设计、数据解读、图表绘制、数据挖掘和文章设计各环节中遇到的问题。北京市计算中心特聘请一线项目经验丰富的科研人员精心组织了本次培训课程,为保证听课质量和教学质量,本研讨班采用小班授课方式。课程内容针对性极强、上机实践比重更达到 70%,整套课程教学目的明确,从微生物组学实验方案的宏观到细节再到注意事项的讲解,为项目能产出更有效的测序数据打下坚实的基础,上机实践课程贯穿从测序数据下机后质量评估、物种注释到数据分析和结果呈现整个流程。诚邀各领域广大科研工作者和高校教师及研究生报名参加!
一、组织机构
主办单位:
中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位:
北京市计算中心
协办单位:
云计算关键技术与应用北京市重点实验室
中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
中国生物工程杂志
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司
二、培训安排
培训地点:北京海淀区丰贤中路 7 号 3 号楼,北京市计算中心三层会议室
本次课程时间:2016 年 10 月 20-23 日(报名中)
上课时间:9:30-12:00/13:30-17:00
日期 | 授课题目 | 授课内容 |
第一天 | 微生物组学研究概论及进展 | 1. 微生物组研究的发展历史 2. 微生物测序分析技术及实验技术原理 3. 研究热点分享 |
经典案例分享与方案设计 | 1. 微生物组学经典文章回顾,未来微生物组学发展方向 2. 已发表各类精品文章的经验总结:包括经典项目总体设计思路、遇到的困难及解决方案 | |
第二天 | Linux 基础操作 | 1. Linux 常用命令使用和上机操作 2. Linux 环境下软件安装 |
16s 测序分析结果解读 | 1. OUT 分析 2. 物种分类与丰度分析 3. Alpha 多样性分析 4. Beta 多样性分析 5. 显著性差异分析 16s 数据分析 | |
上机 | 1. 质控与数据拼接 2. OTU 聚类 3. 物种注释 4. 统计分析: (1)α多样性分析 (2)β多样性分析 (3)群落结构及丰度分析 (4)进化分析 (5)差异分析 (Lefse) (6)功能分析 (picrust) | |
第四天 | R 语言基础及 R 语言绘图 | 1. R 语言简介、功能及基本语法介绍 2. R 数据处理,对 R 语言中常用的数据结构包括向量,数组,矩阵,列表,数据框等的介绍、使用方法及使用范围 3. R 语言绘图,绘制常见的图表(散点图、条形图、文氏图、饼图、盒形图、频率直方图及热图等的绘制) |
文章写作经验介绍 | 1. 方案设计经典思路分享 2. 文章写作经验分享,包括文章架构设计、语言风格、结果呈现等写作技巧 |
(课程内容以实际授课为准)
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。
三、讲师团队
邀请中科院和北京市计算中心一线工作经验丰富的老师主讲。
四、报名费用
注册费: 2500 元/人(资料费、上机费、午餐费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)
附近最近酒店为:如家酒店(永丰店),可自行网上预定,费用自理。
报名优惠政策
1. 9 月 20 日报名缴费可优惠 300 元
2. 3 人以上团体报名每人可减少 300 元
3. 4+1 团报,可免费赠送一个名额
4. 上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。
付费方式
现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心
账 号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(备注:在汇款明细里加上「生物计算事业部——您的姓名+单位」)
五、联系咨询
于老师
电话:010-59341771
QQ 号:2814500767
员老师
电话:010-59341773,18701529461
邮箱:yuanll@bcc.ac.cn