组学技术的发展,开启了医学健康的新时代,测序技术已渗透到疾病研究的各个方向。2016 年中国精准医疗计划启动。科学界与医学界正在通力合作,希望通过对基因组、转录组、表观遗传组、蛋白质组及代谢组等多组学数据的系统整合和深度挖掘,结合多样的临床数据,最终实现对疾病的精准分类和诊断,并制定个性化的疾病预防和诊疗方案。
随着精准医疗的不断推进,各组学平台的实验手段和数据分析方法也在快速地更新。为了帮助疾病研究领域的临床科研工作者及临床医生们全面深入地了解各个组学研究的有效手段和方法,北京市计算中心,联合生命科学及医学领域的专业一线项目经验丰富的科研人员精心组织了本次培训课程。
为保证听课质量和教学质量,本研讨班采用小班授课方式。课程内容针对性极强、上机实践比重更达到 70%,整套课程教学目的明确,从实验方案设计到细节再到注意事项的讲解,为项目能产出更有效的测序数据打下坚实的基础,上机实践课程贯穿从测序数据下机后质量评估、数据筛选到基因组分析、转录组分析整个流程。诚邀各领域广大科研工作者和高校教师及研究生报名参加!
一、组织机构
主办单位:
中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位:
北京市计算中心
协办单位:
云计算关键技术与应用北京市重点实验室
中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
中国生物工程杂志
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司
二、培训安排
培训地点:北京海淀区丰贤中路 7 号 3 号楼,北京市计算中心三层会议室
本次课程时间:2016.10.24-10.28(报名中)
上课时间:9:30-12:00/13:30-17:00
日期 | 授课题目 | 授课内容 |
第一天 | 新一代测序技术在疾病研究中的发展进程及研究前景 | 1. 测序技术的发展历史 2. 多组学测序技术在慢性疾病研究中的最新方法和动态 3. 测序技术在疾病研究中的热点分享 |
经典案例分享与方案设计 | 1. 经典文章回顾,未来发展方向 2. 已发表各类精品文章的经验总结:包括经典项目总体设计思路、遇到的困难及解决方案 | |
第二天 | 基因组重测序& 全外显子测序 | 1. 在慢性疾病分析中的研究思路及应用 2. 高通量及芯片测序技术原理 3. 数据分析原理、流程 4. Linux |
常用命令使用和上机操作 | 1. 数据质量控制与数据过滤 2. 使用 BWA 和 Samtools 进行数据比对及结果可视化 3. 寻找 SNP 和 Indel 并进行注释 4. 基因组变异 ANNOVAR 功能注释 5. 关联分析软件 Plink、Haploview 等软件使用 | |
第三天 | 转录组测序技术 | 1. 疾病相关转录组研究策略与分析方法 2. 转录组相关测序技术原理与分析流程 3. 定量分析、表达量计算、SNP 检测、可变剪切分析& 基因融合检测等常用信息分析方法 4. 非编码 RNA 在慢性疾病中的功能与研究方法 5. 非编码 RNA 的预测,功能分析,靶基因鉴定 6. 项目设计与案例分析 |
第四天 | 表观遗传学 | 1. 表观遗传学在慢性疾病分析中的研究思路 2. 研究技术:BS、RRBS、MBD、CHIP-seq 3. 常用信息分析方法 |
第五天 | R 语言基础及 R 语言绘图 | 1. R 语言简介、功能及基本语法介绍 2. R 数据处理,对 R 语言中常用的数据结构包括向量,数组,矩阵,列表,数据框等的介绍、使用方法及使用范围 3. R 语言绘图,绘制常见的图表(散点图、条形图、文氏图、饼图、盒形图、频率直方图及热图等的绘制) |
文章写作经验介绍 | 1. 方案设计经典思路分享 2. 文章写作经验分享,包括文章架构设计、语言风格、结果呈现等写作技巧 |
(课程内容以实际授课为准)
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。
三、讲师团队
邀请中科院和北京市计算中心一线工作经验丰富的老师主讲。
四、报名费用
注册费:工作人员 4500 元/人、学生 4000 元/人(资料费、上机费、午餐费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)
附近最近酒店为:如家酒店(永丰店),可自行网上预定,费用自理。
报名优惠政策:
1. 10 月 9 日前报名成功并缴费每人可优惠 300 元
2. 3 人以上团体报名每人可减少 300 元
3. 4+1 团报,可免费赠送一个名额
4. 上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。
付费方式:
现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心
账 号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(备注:在汇款明细里加上「生物计算事业部——您的姓名+单位」)
五、 联系咨询
于老师
电话:010-59341771
QQ:2814500767
员老师
电话:010-59341773,18701529461
邮箱:yuanll@bcc.ac.cn