组学数据与生物信息在医学研究中的应用专题班

作者:   2016-10-17
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  • 会议时间: 2016-11-15至 2016-11-18
  • 会议地点: 北京
  • 电话:010-59371771
  • 传真:暂无
  • 联系人:于瑞婷
  • Email: yurt@bcc.ac.cn
  • 联系地址:北京市海淀区永丰产业基地丰贤中路7号北科产业3号楼
  • 会议网址:http://dxy.me/qmu6bu

您是否还在苦恼如何通过 GO/KEGG/DAVID 注释的目的找出基因表达与疾病的关系?     您是否知道怎样做靶基因、转录因子和增强子的预测,及如何从这些预测的数据中锁定待研究的靶标?

本期培训班以生物医学基因组数据分析为主题,从学员的实际问题出发,详细讲解该领域常用的研究方法,结合实际上机操作系统学习分析软件的使用和图表绘制方法,真正解决您的科研苦恼与困扰真诚的欢迎您的到来!

一、组织机构

主办单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会

承办单位:北京市计算中心

协办单位:

云计算关键技术与应用北京市重点实验室

中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会

北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心

中国生物工程杂志

北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司

二、培训安排

培训时间:2016 年 11 月 15-18 日(报名中)

上课时间:9:00-12:00/13:30-17:00

日期授课题目授课内容
第一天
人类基因组测序、数据库、全基因组关联分析

1. Linux 基础与常用命令

2. 人类基因组测序及生物信息学分析理论基础

3. 人类基因组与遗传变异数据库、数据资源获得

4. 全基因组关联分析(GWAS)理论与实践、低覆盖度测序+基因型填充原理

基因组重测序与 GWAS 数据分析

1. 对二代测序数据的解读及数据质量控制及数据过滤

2. 使用 BWA 和 Samtools 进行数据比对及结果 IGV 可视化

3. 寻找 SNP 和 Indel 并进行注释

4. 基因组变异 ANNOVAR 功能注释

5. 关联分析软件 Plink、Haploview 等软件使用

第二天生物信息学专业常用工具及科研绘图

1. Bioedit 与生物信息序列处理

2. Blast 与序列检索比对及参数、Blast 建库与 Blast 本地化

3. Mega 的使用及系统发育分析

4. 分子网络分析工具 Cytoscape 使用

5. 运用生物信息常用的工具进行专业绘图及格式转换

蛋白结构基础及常用工具软件

1. 蛋白质结构分析与 PDB 数据库应用

2. PDB 文件格式概述

3. 常用蛋白结构分析软件应用(VMD,Pymol 等)

第三天
转录组数据分析上机操作

1. 转录组数据准备和软件介绍及安装

2. 转录组数据的比对(重点讲解)

3. 表达量估计和分析(重点讲解)

4. 使用 DAVID 进行功能分析与基因浏览器

RNA-seq 与基因表达与疾病的关系

1. 转录组与小 RNA 测序在人类医学中应用

2. 基因表达与人类医学数据分析

3. 基因本体数据及 GO 注释

4. 生物学通路 KEGG 注释方法与实现

第四天转录组学测序技术

1. 从转录组数据发现 SNPs

2. 从转录组数据预测 lncRNAs

TCGA 项目及数据应用

1. TCGA 项目及数据介绍

2. TCGA 数据在医学应用中的案例分析

(课程内容以实际授课为准)

注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。

三、讲师团队

邀请中科院和北京市计算中心一线工作经验丰富的老师主讲。

四、报名费用

注册费 4800 元,含听课费、资料费、上机费和午餐。

请自带笔记本电脑用以上机实习。所有学员自动成为 VIP 会员,永久享受生物计算分析服务 9 折优惠。

附近最近酒店为:如家酒店(永丰店),可自行网上预定,费用自理。

付费方式:

现金、支票、银行转账、银行汇款

单位全称:北京市计算中心

账号:0200151819100023937

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

(汇款信息里 备注上:「生物计算事业部——您的姓名」,个人汇款请备注上单位名称)

报名优惠政策:

1. 10 月 20 日前报名成功并缴费每人可优惠 300 元

2. 3 人以上团体报名每人可减少 300 元

3. 4+1 团报,可免费赠送一个名额

4. 上面 4 种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。

培训座位按收到报名表先后顺序安排。

五、联系咨询

于老师

电话:010-59341771

QQ 号:2814500767

员老师

电话:010-59341773,18701529461

邮箱:yuanll@bcc.ac.cn

编辑: 周薇   

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