您是否还在苦恼如何通过 GO/KEGG/DAVID 注释的目的找出基因表达与疾病的关系? 您是否知道怎样做靶基因、转录因子和增强子的预测,及如何从这些预测的数据中锁定待研究的靶标?
本期培训班以生物医学基因组数据分析为主题,从学员的实际问题出发,详细讲解该领域常用的研究方法,结合实际上机操作系统学习分析软件的使用和图表绘制方法,真正解决您的科研苦恼与困扰真诚的欢迎您的到来!
一、组织机构
主办单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位:北京市计算中心
协办单位:
云计算关键技术与应用北京市重点实验室
中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
中国生物工程杂志
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司
二、培训安排
培训时间:2016 年 11 月 15-18 日(报名中)
上课时间:9:00-12:00/13:30-17:00
日期 | 授课题目 | 授课内容 |
第一天 | 人类基因组测序、数据库、全基因组关联分析 | 1. Linux 基础与常用命令 2. 人类基因组测序及生物信息学分析理论基础 3. 人类基因组与遗传变异数据库、数据资源获得 4. 全基因组关联分析(GWAS)理论与实践、低覆盖度测序+基因型填充原理 |
基因组重测序与 GWAS 数据分析 | 1. 对二代测序数据的解读及数据质量控制及数据过滤 2. 使用 BWA 和 Samtools 进行数据比对及结果 IGV 可视化 3. 寻找 SNP 和 Indel 并进行注释 4. 基因组变异 ANNOVAR 功能注释 5. 关联分析软件 Plink、Haploview 等软件使用 | |
第二天 | 生物信息学专业常用工具及科研绘图 | 1. Bioedit 与生物信息序列处理 2. Blast 与序列检索比对及参数、Blast 建库与 Blast 本地化 3. Mega 的使用及系统发育分析 4. 分子网络分析工具 Cytoscape 使用 5. 运用生物信息常用的工具进行专业绘图及格式转换 |
蛋白结构基础及常用工具软件 | 1. 蛋白质结构分析与 PDB 数据库应用 2. PDB 文件格式概述 3. 常用蛋白结构分析软件应用(VMD,Pymol 等) | |
第三天 | 转录组数据分析上机操作 | 1. 转录组数据准备和软件介绍及安装 2. 转录组数据的比对(重点讲解) 3. 表达量估计和分析(重点讲解) 4. 使用 DAVID 进行功能分析与基因浏览器 |
RNA-seq 与基因表达与疾病的关系 | 1. 转录组与小 RNA 测序在人类医学中应用 2. 基因表达与人类医学数据分析 3. 基因本体数据及 GO 注释 4. 生物学通路 KEGG 注释方法与实现 | |
第四天 | 转录组学测序技术 | 1. 从转录组数据发现 SNPs 2. 从转录组数据预测 lncRNAs |
TCGA 项目及数据应用 | 1. TCGA 项目及数据介绍 2. TCGA 数据在医学应用中的案例分析 |
(课程内容以实际授课为准)
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。
三、讲师团队
邀请中科院和北京市计算中心一线工作经验丰富的老师主讲。
四、报名费用
注册费 4800 元,含听课费、资料费、上机费和午餐。
请自带笔记本电脑用以上机实习。所有学员自动成为 VIP 会员,永久享受生物计算分析服务 9 折优惠。
附近最近酒店为:如家酒店(永丰店),可自行网上预定,费用自理。
付费方式:
现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心
账号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(汇款信息里 备注上:「生物计算事业部——您的姓名」,个人汇款请备注上单位名称)
报名优惠政策:
1. 10 月 20 日前报名成功并缴费每人可优惠 300 元
2. 3 人以上团体报名每人可减少 300 元
3. 4+1 团报,可免费赠送一个名额
4. 上面 4 种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
培训座位按收到报名表先后顺序安排。
五、联系咨询
于老师
电话:010-59341771
QQ 号:2814500767
员老师
电话:010-59341773,18701529461
邮箱:yuanll@bcc.ac.cn