在后基因组时代，生命科学研究开始进入系统、全面、动态的功能探索阶段。多种高通量的研究策略如基因组测序、转录组测序、小 RNA 测序、蛋白质组定量实验和代谢组学被组合应用到同一个课题研究中，在原先单个平台产出数据分析挖掘的基础上增加了多个实验平台产出数据的整合分析。本系列研习会将深入探讨转录组、蛋白质和代谢组的实验方法、研究策略、实验设计和数据分析，并介绍转录组和蛋白质组实验整合研究的案例, 多组学数据分析的案例，研讨内容由多年实践经验的科研和技术人员进行讲解和带领数据分析的实际上机操作。
一、组织机构
1. 主办单位：
上海生咨生物科技有限公司
克里克学院
2. 协办单位：
上海市药物转化工程技术研究中心
上海维基生物科技有限公司
上海康昱盛信息科技有限公司
3. 支持单位：
上海众信生物技术有限公司
二、培训安排
时间：2016 年 11 月 22-25 日
地点：上海中电大酒店，上海市浦东新区南泉北路 1029 号中电大厦（近张扬路）
11 月 21 日（周一）下午 14:30-17:30 或 11 月 22 日（周二）上午 8:30-9:30 注册。
11 月 22 日 9:30-12:00/13:30-17:30
1.1 李亦学教授报告（待定）
1.2 蛋白质组的基本原理和研究进展
1.3 新一代靶向蛋白组学新技术 DIA 在精准医学和肿瘤生物标记物中的应用
1.4 蛋白质组标记和非标记样品的处理方法
1.5 蛋白质组学数据分析之搜索引擎
1.6 蛋白质组学搜库软件（MASCOT、SearchGUI、Ｍaxquant）（含上机）
1.7 蛋白质组学数据分析之功能分析
11 月 23 日 9:00-12:00/13:30-17:30
2.1 蛋白质组序列数据获取方法
2.2 差异基因/蛋白的筛选方法
2.3 Gene Ontology(GO) 数据库资源和分析方法
2.4 通路数据库资源和分析方法
2.5 相互作用数据库介绍和 cytoscape 软件应用
2.6 维恩分析
2.7 层次聚类和热图分析
11 月 24 日 9:00-12:00/13:30-17:30
3.1 转录组测序数据分析及其在临床医学方面的应用研究
3.2 转录组测序在农林方面的应用研究
3.3 转录组和蛋白质组整合分析案例介绍
3.4 R 的 fCI 包进行多组学数据整合分析中的应用
11 月 25 日 9:00-12:00/13:30-17:00
4.1 LC-MS、GC-MS、CE-MS 在代谢组学中的应用
4.2 靶向代谢组学及脂质组学
4.3 多维统计分析（SIMCA-P 软件）及 LC-MS 数据解析
4.4 多组学数据分析案例介绍
注：
1. 课程内容不会有大的变化，具体安排以报名当天的课程表为准
2. 因需上机练习，请自带笔记本电脑，默认是 windows 系统，若安装的是 linux 或苹果 iOS 请自行下载上机软件。我们所讲解的软件均是可以免费获取的，但可能有操作系统的限制
3. 为了学习效果，人数暂定限制为 40 人
三、价格及相关事项
1. 标准费用 4000 元/人（含资料费和中餐）
2. 仅报名 11 月 22 日、23 日课程 2400 元/人（含资料费和中餐）
3. 仅报名 11 月 24 日、25 日课程为 2400 元/人（含资料费和中餐）
4. 仅报名参加其中任意一天为 1400 元/人（含资料费和中餐）
其他优惠：
1. 脱产学习的学生可凭有效学生证优惠 200 元；
2. 同一单位 2 人以上参会，每人优惠 200 元；
3. 2016 年 11 月 1 日之前汇款优惠 200 元，以汇款回执时间为准；
4. 上海市药物转化工程技术研究中心科研合作伙伴, 上海生咨生物科技有限公司客户、之前参会的学员推荐者优惠 200 元。
以上优惠标准费用（1）可以同时享受，仅参加两天课程（2，3）最高优惠 400 元/人，仅参加一天课程（4）仅享有提前汇款的优惠。
会议盖章邀请函和发票于会议结束前发放。交通住宿费用自理，住宿需提前一周预定。提前汇款且参加全程课程者安排前排座位。
撤销注册及申请退款：
因为报名人数有限，提前 30 天以上通知我们可全额退款，10 天以上通知我们，可退还 50% 的费用。培训开始前 10 天以内则不再接受退款申请，您可以替换其它同事或者朋友参加，或者用于下一次研习会使用。
住宿：
协议酒店为上海中电大酒店
上海中电大酒店位于国内商务新热点—浦东陆家嘴金融贸易区，毗邻浦东第一八佰伴等商业中心，距浦东国际机场、虹桥机场仅 30 分钟车程。 上海中电大酒店周围公共交通便捷，最近的大型地铁中转站世纪大道站步行 10 分钟。可换乘地铁 2 号线、4 号线、6 号线。地铁 2 号线东昌路站步行 10 分钟，可方便到达南京路商业街、外滩。
协议价：标准间/大床房 330 元/天（含双早），合住每人 165 元/天（若无法找到合住人需补差价），需要提前一周预定。
周边还有一边商务酒店可自行在网上预定。
报名方式
请将报名回执发回给以下联系人，麻烦将同时抄送到 QQ 邮箱。
四、联系方式
联系人：张女士
手机：13301931853
电话：021-31131531
Email：jgzhang@biorefer.com
QQ：1377122204
备用联系人：俞先生
电话：15900766827
Email：hyu@biorefer.com
QQ：12628609
五、讲师简介
李亦学（拟邀请特约讲师）
研究员，教授，博士生导师。现任上海生物信息技术研究中心主任；中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所生物医学大数据中心主任；上海市生物信息学会理事长；上海药物转化工程技术研究中心主任；中科院「十一五」信息化专家组专家；国家高技术发展计划（863 计划）生物医药技术领域专家组专家。主要从事生物信息学技术基础理论研究与应用、生物信息数据共享平台建设，系统生物学研究等。
李亦学教授在生物信息学领域的多个方面取得系统性和原创性成果，发表 SCI 论文 195 篇，CSCD 收录 11 篇，含（共同）通讯作者论文 145 篇，他引 4834 次。影响因子 996.75。作为副主编编写卫生部 7-8 年制临床医学专业教材《生物信息学》一部，主译《理解生物信息学》英文专著一部，获专利 4 项，软件著作权 25 项。
戴文韬
2008 年毕业于华东师范大学生命科学学院，获生物技术学士学位；同年进入中国科学院生物物理研究所硕博连读，2014 年生物学（生物信息学）博士学位。2 同年，在上海科学院上海生物信息技术研究中心担任助理研究员。2016 年入选上海市科技英才扬帆计划。已完成工作包括：开发了处于领域内先进水平的蛋白质结构模型质量评估方法 MEFTop 和蛋白质结构预测程序 FR-t5-M；利用自主研发的计算工具，参与骨肿瘤相关的 RANKL 新受体 LGR4 蛋白、白虎皮毛颜色遗传机制、耐药结核杆菌基因突变结构功能机制等合作研究，并负责计算生物学模拟和论文相应部分的撰写，相关工作被《Nature Medicine》、《Current Biology》等杂志接收发表；在理论方面，从疏水作用和氢键入手，参与发表了探索蛋白质折叠和空间组织模式与进化、功能关系的研究论文；在多组学数据整合分析方面，参与利用差异化网络分析研究了胃癌发展过程中的调控失常机理。
何有裕
上海众信生物技术有限公司总经理，具有超过 15 年的生命科学方向的从业经历，尤其在高通量测序方面有丰富的实验设计和数据分析经验。
库鑫
博士 2007 年毕业于华中科技大学同济医学院，获学士学位。同年 9 月被保送至中科院上海药物研究所并于 2010 年取得硕士学位。2010 年 10 月至 2014 年 6 月在德国慕尼黑工业大学（Technische Universität München）生物分析与蛋白质组学研究所（Prof. Bernhard Kuster）攻读博士学位，专业方向为基于串联质谱的蛋白质组学在肿瘤药物研究中的应用。现任职于上海交通大学系统生物医学研究院，研究方向为肿瘤相关生物标志物的发现和蛋白质糖基化修饰的研究。库鑫博士长期从事肿瘤蛋白质组学的相关研究，在国际期刊上发表过多篇相关论文。
于复东
博士、副研究员。2008 年 1 月毕业于中国科学院上海生命科学研究院，获生物信息学博士学位。毕业后一直从事二代测序等高通量数据分析、肿瘤基因组学、及相关数据库开发和分析平台建立等生物信息学研究工作。目前主要从事肿瘤基因组学和精准医疗方面的研究工作，运用系统生物学的方法研究可以应用于临床早期诊断、预后、复发和转移相关的分子标志物基因及其功能等。近年来作为项目负责人完成了国家自然科学基金、上海市博士后基金、上海市白玉兰科技人才基金各一项，作为生物信息学分析平台负责人完成传染病重大专项课题一项，作为技术骨干参与完成 863 计划项目一项，累积发表 SCI 论文十余篇。
俞鸿
上海生咨生物科技有限公司经理，资深生物信息学工程师 具有超过 15 年生物信息学分析经验。参与了水稻基因组、家蚕基因组、人肝蛋白质组计划以及其他的国家 973、863 计划及国家自然科学基金等项目。主要从事蛋白质组、基因组方向的数据分析。
吴谦
博士，副研究员，上海生物信息技术研究中心质谱平台负责人，从事质谱研究十多年，近年研究方向主要为蛋白质组学、代谢组学及质谱定量分析新方法开发。
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