近年来，以基因组科学为代表的研究工作和技术平台先后获得各项资助，如国家 863 计划、973 计划、中国科学院知识创新工程、国家重大攻关项目、自然科学基金等。为了辅助广大科研工作者掌握高通量测序技术原理、实验设计以及后期数据分析技能，北京市计算中心生物计算事业部与军事医学科学院微生物流行病研究所生物信息学研究室联合举办「实用生物信息学」培训研习班。
一、组织机构
主办单位：中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位：北京市计算中心
协办单位：
云计算关键技术与应用北京市重点实验室
中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
中国生物工程杂志
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司
二、培训安排
培训时间：2016 年 12 月 8 日-12 月 12 日 （报名中）
上课时间：9:30~12:00/13:30~16:30
日期 | 授课题目 | 授课内容 |
| 第一天 | 生物信息学导论 | 1. 生物信息学发展简史（重点讲解） 2. 生物信息学主要研究领域（重点讲解） 3. 生物信息学软件和工具 4. 生物信息学重要会议 |
生物信息学基础 （上机操作） | 1. linux 基础 掌握 Linux 系统下的常用命令 (重点) 掌握 linux 环境下软件的安装使用 了解 shell 脚本的编写 2. perl 基础 介绍 Perl 的基本元素 erl 在生物信息中应用示例 (DNA 复制、DNA 转录、RNA 翻译) | |
| 第二天 | 二代测序技术原理及基因组拼接 | 1. 介绍目前主流二代测序仪的测序原理 2. 主要操作流程及特点 3. 序列拼接的技术方法 4. 常用软件及全基因组个性化组装的技巧 |
基因组拼接组装 （以细菌/病毒为例） （上机操作） | 1. 全基因组组装的流程介绍 2. 原始测序数据的预处理 3. 分别介绍 Velvet 和 SOAPdenovo 的使用，并以一株细菌的测序数据为例进行组装 4. 介绍 Newbler 的是使用，并以一个 IonTorrent 测序的噬菌体数据为例进行组装 5. 以细菌的数据为例, 介绍填补 gap 的方法，包括延伸法，局部拼接法 | |
| 第三天 | 基因组重测序与数据分析 | 1. 讲解基因组重测序的概念、目的与应用 2. 结合实例讲解其原理、类据类型与格式、操作流程、软件等相关知识 |
基因组重测序数据分析实例 （上机操作） | 1. 对二代测序数据的解读 2. 数据质量控制及数据过滤 3. 使用 BWA 和 Samtools 进行数据比对并对比对结果进行可视化（重点讲解） 4. 寻找 SNP 和 Indel 并进行注释（重点讲解） 5. 寻找结构变异并对变异进行注释（重点讲解） | |
| 第四天 | 转录组测序与数据分析 | 1. 转录组基本概况和技术发展简介 2. 转录组技术流程及技术细节（重点讲解） 3. 转录组应用案例 |
转录组数据分析实例 （上机操作） | 1. 转录组数据准备和软件介绍及安装 2. 转录组数据的比对（重点讲解） 3. 表达量估计和分析（重点讲解） 4. 后续功能分析简介 | |
| 第五天 | microRNA 测序与数据分析 | 1. microRNA 目前的应用、发展历史以及 microRNA 的定义 2. microRNA 的生物学过程（重点讲解） 3. microRNA 的测序（重点讲解） 4. microRNA 测序数据分析软件（重点讲解） 5. microRNA 目前的挑战以及将来的研究前景 6. microRNA 测序数据分析案例展示（重点讲解） 7. 近期文献 |
microRNA 数据分析实例 （上机操作） | 1. microRNA 测序数据预处理（重点讲解） 2. 测序数据长度分布计算 3. microRNA 的预测（重点讲解） 4. microRNA 碱基偏好性计算 5. microRNA 靶标基因预测，结果提取、统计（重点讲解） | |
| 蛋白质组信息学平台及应用 | 1. 蛋白质鉴定的质量控制 2. 非限制性蛋白质翻译后修饰鉴定 3. 蛋白质定量分析 4. 蛋白质组数据管理 5. 案例分析 |
注：参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》，通过审稿的论文将会优先发表。
三、课程特色
讲师团队：来自首师大、蛋白质中心、计算中心、军科院，多个海归博士，均在生物信息学领域有丰富的工作经验。
上课形式：理论讲授和上机实习搭配，结合具体案例。
精致小班：每班少于 35 人，可根据学员课前提出的工作需求调整课程内容。
VIP 待遇：培训后，仍可免费来我中心与生物信息专家一对一辅导。
效果保障：至今已经成功举办多次生物信息分析专题培训，累计百余人次，广受学员好评。
四、报名费用
在校学生（需学生证）：4950 元/9 折
工作人员：5500 元
注册费含听课费、资料费、上机费和午餐。请自带笔记本电脑用以上机实习 报名费含听课费、资料费、上机费，请自带笔记本电脑以备上机实践使用。附近最近酒店为：如家酒店（永丰店），可自行网上预定，费用自理。
付费方式：
现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称：北京市计算中心
账号：0200151819100023937
开户银行：中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
（汇款信息里 备注上：「生物计算事业部——您的姓名」，个人汇款请备注上单位名称）
报名优惠政策：
1. 11 月 20 日前报名成功并缴费每人可优惠 500 元
2. 3 人以上团体报名每人可减少 400 元
3. 4+1 团报，可免费赠送一个名额
4. 上面 3 种优惠政策不能同时享受，只能享受其中一种
培训以收到学员培训费为成功报名，培训座位按收到费用先后顺序安排。
五、联系咨询
于老师：010-59341771
QQ 号：2814500767
员老师：010-59341773，18701529461
邮箱：yuanll@bcc.ac.cn
