转录组学专题研讨班

作者:   2016-12-31
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  • 会议时间: 2017-02-15至 2017-02-17
  • 会议地点: 北京
  • 电话:010-59371771
  • 传真:暂无
  • 联系人:于瑞婷
  • Email: yurt@bcc.ac.cn
  • 联系地址:北京市海淀区永丰产业基地丰贤中路7号北科产业3号楼
  • 会议网址:暂无

近年来,随着高通量测序技术的迅猛发展,转录组研究从以前的微阵列技术,SAGE 及 MPSS 技术的低通量模式切换至 RNA-seq 的高通量模式。转录组学作为一个伴随高通量测序技术率先发展起来的技术开始在生物学前沿研究中得到了广泛的应用。     RNA-seq 对于真核生物的基因表达调控,癌症等疾病的发生机制和新治疗方案确定,遗传育种等众多方面的研究具有不可估量的潜力。

为了辅助广大科研工作者掌握转录组高通量测序技术原理、实验设计以及后期数据分析技能,北京市计算中心生物计算事业部举办「转录组学」培训研习班。

一、组织机构

主办单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会

承办单位:北京市计算中心

协办单位:

云计算关键技术与应用北京市重点实验室

中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会

北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心

中国生物工程杂志

北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司

二、课程安排

培训时间:2017 年 2 月 15-17 日 (报名中)

上课时间:9:30-11:30/13:30-17:00

日期授课题目授课内容
第一天转录组测序与数据分析

1. 转录组基本概况和技术发展前沿动态

2. 转录组技术流程及技术细节(重点讲解)

3. 转录组应用案例及应用热点 

转录组数据分析实例

(上机操作)

1. linux 基础

2. 转录组数据准备和软件介绍

3. 转录组数据的比对(重点讲解)

4. 表达量估计和分析(重点讲解)

第二天lncRNA 数据分析与上机操作

1. lncRNA 目前的定义、应用和发展

2. lncRNA 的生物学过程(重点讲解)

3. lncRNA 的测序(重点讲解)

4. lncRNA 测序数据分析软件(重点讲解)

5. lncRNA 测序数据分析案例展示(重点讲解)

6. lncRNA 测序数据分析实例(重点讲解)

转录组组拼接及功能注释

(包含上机操作)

1. 转录组序列拼接的技术方法

2. 转录组组装的流程介绍

3. 原始测序数据的预处理

4. 介绍 Trinity 的使用,并以测试测序数据为例进行组装

5. 介绍寻找 ORF 的方法

第三天

microRNA 测序与数据分

析(包含上机操作)

1. microRNA 目前的应用、发展历史以及 microRNA 的定义

2. microRNA 的生物学过程(重点讲解)

3. microRNA 的测序(重点讲解)

4. microRNA 测序数据分析软件(重点讲解)

5. microRNA 测序数据预处理(重点讲解)

6. microRNA 的预测(重点讲解)

7. microRNA 靶标基因预测,结果提取、统计(重点讲解)

转录组学的云计算平台

课程答疑与实际数据指导

1. 介绍如何使用云计算平台分析 RNA-seq 数据

2. 学员可以准备自己的数据,带着问题来实践课程所学内容,直接应用与科研当中。

(课程内容以实际授课为准)

注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。 

三、讲师团队

邀请中科院和北京市计算中心一线工作经验丰富的老师主讲。

四、报名费用

注册费:2800 元/人(含听课费、资料费、上机费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)。

附近最近酒店为:如家酒店(永丰店),可自行网上预定,费用自理。

付费方式:

现金、支票、银行转账、银行汇款

单位全称:北京市计算中心

账号:0200151819100023937

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

(汇款信息里 备注上:「生物计算事业部——您的姓名」,个人汇款请备注上单位名称)

报名优惠政策:

1. 1 月 20 日前报名成功并缴费每人可优惠 300 元

2. 3 人以上团体报名每人可减少 300 元

3. 4+1 团报,可免费赠送一个名额

4. 上面 4 种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。

五、联系咨询

于老师:010-59341771
QQ 号:2814500767

员老师:010-59341773,18701529461
邮箱:yuanll@bcc.ac.cn

编辑: 郁金香1130   

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