微生物组学分析研讨班

作者:   2016-12-31
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  • 会议时间: 2017-02-20至 2017-02-22
  • 会议地点: 北京
  • 电话:010-59371771
  • 传真:暂无
  • 联系人:于瑞婷
  • Email: yurt@bcc.ac.cn
  • 联系地址:北京市海淀区永丰产业基地丰贤中路7号北科产业3号楼
  • 会议网址:暂无

北京市计算中心生物部一直以来都以最前沿、最实用的课程和高品质的服务为广大科研工作者提供理论与实践相结合的生物信息培训课程。为了解决您在宏基因组样品制备、实验设计、数据分析、结果展示等方面的困扰,生物部特推出「微生物组学分析研讨班」。

专业一流的讲课老师团队将与您一起探讨科研奥秘、挖掘科学价值,为您拓宽科研思路、解决实验困扰。欢迎报名参加!

一、组织机构

主办单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会

承办单位:北京市计算中心

协办单位:

云计算关键技术与应用北京市重点实验室

中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会

北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心

中国生物工程杂志

北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司

二、培训安排

培训时间:2017 年 2 月 20-22 日 (报名中) 

上课时间:9:30-11:30/13:30-17:00

日期

授课题目

授课内容


第一天

上午



微生物组学研究的发展和挑战


1. 微生物组研究的发展历史

2.  测序平台介绍

3.  基于测序的研究方法

3.1 宏基因组(target sequencing 和全基因组)

3.2 单个微生物 de novo 测序

4.  应用案例分析


第一天

下午



target sequencing 数据分析


1. linux 常用命令使用和上机操作

2.  数据分析过程中的编程简介(perl、R、python 等)

3. target sequencing 数据分析加上机

3.1 质控

3.2 去嵌合体

3.3 OTU 聚类

3.4 注释

3.5 统计分析:(1)α多样性分析(2)β多样性分析(3)群落结构及丰度分析(4)进化分析(5)差异分析 (Lefse)(6)功能分析 (picrust)


第二天

全天



Whole metagenome 和 metatranscriptome 数据分析


1.  质控

2.  拼接组装:SOAPdenovo;MetaVelvet; Meta-IDBA 等

3.  聚类 Binning:TETRA; MetaCluster; Phymm 等

4.  基因注释:FragGeneScan;MetaGeneMark;MetaGeneAnnotator 等

5.  功能注释:RAMMCAP;blast 等

6.  统计分析:(1)物种分析(2)功能分析(3)差异分析(4)表达分析


第三天

全天



微生物 de novo 测序分析


1.  质控

2.  单细胞测序去污染、去嵌合体等

3.  拼接组装:SPAdes 等

4.  基因预测

5.  功能注释

6.  代谢途径分析

7.  进化分析:(1)SNP(2)插入缺失(3)水平基因转移

8.  转录组分析:(1)基因差异表达分析(2)代谢通路分析

(课程内容以实际授课为准) 

注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。

三、讲师团队

邀请中科院和北京市计算中心一线工作经验丰富的老师主讲。

四、报名费用

注册费:3500 元/人(含听课费、资料费、上机费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)。

附近最近酒店为:如家酒店(永丰店),可自行网上预定,费用自理。

付费方式:

现金、支票、银行转账、银行汇款

单位全称:北京市计算中心

账号:0200151819100023937

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

(汇款信息里 备注上:「生物计算事业部——您的姓名」,个人汇款请备注上单位名称)

报名优惠政策:

1. 1 月 20 日前报名成功并缴费每人可优惠 300 元

2. 3 人以上团体报名每人可减少 300 元

3. 4+1 团报,可免费赠送一个名额

4.  同时报 2 个以上培训班的可额外优惠 200 元

5.  上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。

五、联系咨询

于老师:010-59341771
QQ 号:2814500767

员老师:010-59341773,18701529461
邮箱:yuanll@bcc.ac.cn

编辑: 郁金香1130   

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