一、开班背景
近年来,精准医学(PM)成为研究的热点,而新一代测序技术(NGS)的技术进步,使其以高通量、低成本的优势逐渐成为生命医学的研究中常规技术,从而产生大量的以 GB、甚至 TB 为单位量级的海量数据,这些数据产生迅速,量级巨大。对这些海量数据分析、解读、阐释,如何确定遗传基因信息与人类疾病、健康的关联关系,成为许多生物医学研究者面临的问题。
集中于生命科学及生物医学相关的基因组、转录组,从高性能计算的使用、高通量测序数据分析等方面进行入手,为研究人员、专业技术人员开展科研工作,运用新知识新方法,以及新技术的普及而开设课程,并结合实际工作进行专题研讨,本着注重实践、充分交流讨论、细心解答的原则。从学员的实际问题出发,真正的解决您的科研苦恼与困扰。赶快来参加我们的培训班吧。真诚的欢迎您的到来!
二、课程内容
第 1 天上午
生物信息学导论与前沿
1. 生物信息前沿技术在生物医学研究中应用的发展概况与进展生物信息学数据库
2. 常用生物信息学、遗传学、生物医学学公共数据库资源,数据批量下载以及常用工具应用
第 1 天下午
生物医学统计
1. 生物医学统计概述
2.SPSS 软件使用与生物医学统计应用
3. 实例讲解与练习
第 2 天上午
基因组重测序与数据分析与应用
1. 新一代基因组测序(NGS)技术原理及在生物医学研究中的应用
2. 基因组重测序的概念、目的与应用
3. 结合实例讲解其原理、类据类型与格式、操作流程、软件等相关知识
4. 高性能计算机的使用
5.Linux 系统操作与基本上机命令
第 2 天下午
1. 二代测序数据的解读、数据质量控制及数据过滤
2. 数据比对结果进行可视化
3. 寻找 SNP 和 Indel 并进行注释
4. 全基因组关联分析(GWAS)概述
5.Plink 软件使用、Haploview 软件使用及单倍型分析
第 3 天上午
转录组测序与数据分析与应用
1. 转录组基本概况和技术发展简介
2. 转录组技术流程及技术细节
3. 转录组应用案例
第 3 天下午
1. 转录组数据准备和软件介绍及安装
2. 转录组数据的比对
3. 表达量估计和分析
4.GO 注释与 KEGG 生物学通路
5.David 与基因注释;(课程内容以实际授课为准)
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表
三、讲师团队
邀请中科院和北京市计算中心一线工作经验丰富的老师主讲
四、主办单位
中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
五、承办单位
北京市计算中心
六、协办单位
云计算关键技术与应用北京市重点实验室
中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
中国生物工程杂志
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司
七、培训时间
2017 年 2 月 27-3 月 1 日 (报名中)
八、上课时间
上午:9:30 - 12:30
下午:13:30 – 17:00
九、报名费用
注册费:3500 元/人(含听课费、资料费、上机费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)
附近最近酒店为:如家酒店(永丰店),可自行网上预定,费用自理
十、报名优惠政策
1.20 日前报名缴费的学员每人可优惠 300 元
2.3 人以上团体报名每人可减少 300 元
3.4+1 团报,可免费赠送一个名额
4. 同时报 2 个以上培训班的可额外优惠 200 元
5. 上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排
十一、付费方式
现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心
账号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行(汇款信息里 备注上:「生物计算事业部——您的姓名」,个人汇款请备注上单位名称)
十二、联系咨询
于老师:010-59341771
QQ 号:2814500767
员老师:010-59341773,18701529461
邮箱:yuanll@bcc.ac.cn