生物信息学 Python 语言培训

作者： 2017-01-18

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会议时间： 2017-03-23至 2017-03-25
会议地点：北京
电话：010-59371771
传真：暂无
联系人：于瑞婷
Email： yurt@bcc.ac.cn
联系地址：北京市海淀区永丰产业基地丰贤中路7号北科产业3号楼
会议网址：暂无

一、培训背景

生物信息学中常用的语言是 Perl，不过最近 Python 语言很火，Python 是一个高层次的结合了解释性、编译性、互动性和面向对象的脚本语言。它设计简洁，具有很强的可读性，相比其他语言更有特色的语法结构。Python 目前拥有很多专用的科学计算扩展库，生物信息学专用的 Biopython，提供了生物信息学处理分析功能如快速数组处理、数值运算以及绘图，已经有大量程序软件全部或部分使用 Python 来设计。

越来越多的科研人员学习 Python 语言处理实验数据、制作图表。在学习编程的路上，您可能看过很多 Python 电子书、Python 教程和视频依然不会 Python 编程！如果有个导师给您指导，您会走的更快、更好一些！北京市计算中心自 2011 年起已成功举办 100 多期生物信息类培训班，学员累计达 1500 人次，其中不乏教授、博导。

不少学员通过培训建立了长期协作关系，共同申请国家课题，共同发表论文。特聘请行业一线项目经验丰富的科研人员精心组织了生物信息学 Python 语言培训课程，专业老师帮助大家学习编程语言，不用再担心枯燥无味，学员与老师之间互动讨论，可对重点知识实践快速掌握，快速学会 Python！诚邀您报名参加！

二、培训内容

第一天

09:30-10:30 Python 概述及其在生物信息领域的应用，概括介绍 Python 语言的概念及特点，及其在生物信息领域的应用
10:30-12:00 Python 软件安装、运行与基本操作 Python 及 iPython 的安装及使用，Python 程序的运行；DOS、Unix 命令行操作基本命令；Python 变量定义、数字及基本运算
13:30-15:00 核心数据类型，列表、元组
15:00-16:00 基本语法结构判断结构、循环结构、异常处莅
16:00-17:00 实例练习使用 python 编程，生成斐波那契数字序列

第二天

09:30-11:00 核心数据类型，字符串、字典
11:00-13:00 文件与文件夹操作文件的读入与写入、文件夹操
13:30-17:00 实例练习 FASTA 文件的处理：1、序列基本信息的统计（序列数、碱基数、及平均长度）；2、fasta 序列反向互补转换和切割

第三天

09:30-11:00 函数和模块系统库函数、第三方函数、自定义函数；模块定义、导入、使用
11:00-12:00 正则表达式 Python 特色功能正则表达式学习与应用
13:30-14:30 实例练习系统命令在 python 中的调用
14:30-17:00 实例练习大数据文件的分割及合并

第四天

09:30-11:00 BioPython 简介及应用实例 BioPython 安装及学习，生物信息学中的实际应用
11:00-12:00 BioPython 快速应用使用 BioPython 处理传统的生物信息数据
15:00-17:00 实例练习应用 biopython 实现 genbank、uniprot 格式数据转换为 fasta 格式，应用 biopython 在 blast xml 结果文件中提取目的信息。（课程内容以实际授课为准)
注：参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》，通过审稿的论文将会优先发表

三、培训特色

一流的讲师团队--基因组学专家与一线分析人员亲自授课；全面的课程--技术应用、原理流程、实例联系全贯穿；理论知识与上机操作相结合，为每位学员提供实际操作机会；增值服务，课下主讲老师将为您实际工作中遇到的问题提供个性化解答；小班教学，每期培训班的人数不超过 35 人。

四、培训时间

培训时间：2017 年 3 月 23-3 月 26 日（报名中）
上课时间：上午：9：30 - 12：30 下午：13：30 – 17：00

五、主办单位

中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会

六、承办单位

北京市计算中心

七、协办单位

云计算关键技术与应用北京市重点实验室
中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
中国生物工程杂志
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司

八、报名费用

注册费：3500 元/人（含听课费、资料费、上机费，请自带笔记本电脑以备上机实践使用）
附近最近酒店为：如家酒店（永丰店），可自行网上预定，费用自理