在肿瘤研究进入高通量与大数据的今天,您是否对利用已经存在的海量数据以及学习相关的生物信息学方法感兴趣?TCGA/ICGC 的数据该如何查找并进行下载分析?如何在自己的课题中应用 TCGA 的数据?从哪里获取临床病人的肿瘤突变数据、表达谱数据及病人生存数据?
如何对这三类数据进行关联分析?如何分析临床样本测序后得到的突变位点?如何推断测序得到的突变位点是否可能是重要的功能性突变?如何分析肿瘤二代测序数据?有哪些实用的软件可以用?如何在自己的课题中使用二代测序数据?有没有研究实例可以参考?
如果您也对上述问题感兴趣,那么上海交通大学医学院医药生物信息学中心联合主办的《肿瘤生物信息学培训班》,将为您奉上一道精心打造、能为您解疑答惑的精选课程大餐。
一、基本信息
主办单位:上海宇道生物技术有限公司,上海交通大学医学院医药生物信息学中心
培训地点:上海交通大学医学院(上海市重庆南路 280 号 4 号楼 103)
课程时间:2017 年 03 月 24 日~ 03 月 26 日(报名中)
二、课程安排
日期 | 时间 | 授课内容 |
03.24 | 08:30-09:30 | 肿瘤生物信息学概论 |
09:45-10:45 | 临床病人肿瘤样本数据库(TCGA/ICGC 等)介绍 | |
11:00-12:00 | TCGA 数据分析方法及经典实例 | |
13:30-15:30 | TCGA 数据应用实例 - 临床病人肿瘤突变位点与蛋白功能的关联分析 | |
15:45-17:45 | 上机实践 | |
03.25 | 08:30-10:00 | 肿瘤 RNA 二代测序数据分析流程与实用软件 |
10:15-11:45 | R 语言分析二代测序数据基本技能入门 | |
13:30-15:30 | 二代测序数据分析实例讲解 | |
15:45-17:45 | 上机实践 | |
03.26 | 08:30-10:00 | 二代测序技术在罕见病中的应用实例 |
10:15-11:45 | 二代测序数据挖掘肿瘤标志物应用实例 |
温馨提示:主办方提供远程服务器,请自带笔记本电脑。
课程采取小班化教学,满 10 人开班,每期不超过 35 人,名额有限,欲报从速。培训期间午餐由本中心提供,住宿可以协助预定学校附近宾馆,步行至学校 10 分钟内(校内宾馆装修中,暂时无法预订),费用自理。
三、课程特色
课程主要为生物医学方面的实验人员设置,力求学以致用。即使参加培训的人员没有生物信息学方面的相关基础,通过本课程也能学会基本的肿瘤样本二代测序数据分析方法与常用软件,学会 TCGA 的数据库的使用,并对如何使用临床病人的肿瘤样本进行研究分析有基本的理解和实践能力。
四、讲师团队
上海交通大学医学院、上海生物信息学中心、上海高研院、上海儿童医学中心的教授以及多位在一线承担科研工作的研究人员。
五、报名费用
培训费 2900 元(费用包括教材费、培训费、上机费、午餐费)。
优惠政策:截图分享至朋友圈优惠 100 元/人,3 人及以上同时报名,减免 200 元/人(三种优惠可以叠加使用)。
培训费用请尽量提前转账,现场也可接受刷卡、现金以及支付宝方式支付。
付费方式:现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:上海宇道生物技术有限公司
账 号:1001253709006849379
开户银行:中国工商银行上海市瑞金二路分行
(备注:在汇款明细里加上「肿瘤生物信息学培训班——您的姓名+单位」)
六、联系方式
微信:18621300721(注明:培训)
E-mail:ucdom@vip.163.com
联系电话:18621300721(洪老师)
QQ:1957286417(注明:培训)
七、其他
(一)推荐住宿宾馆:
1. 莫泰 168 连锁酒店(会务组协议酒店,可帮助预定)
地址: 上海黄浦区思南路 113 号(步行至上课地点 10 分钟)
联系电话:021-51703333
收费标准:标间:331 元/天,单人房:297 元/天,不含早餐
2. 上海交通大学医学院尔逸宾馆(装修中,暂时无法预订)
地址:上海市重庆南路 227 号
电话:021-63851650
收费标准:标间:280 元/天,单人房:318 元/天,均含早餐
(二)交通路线:
1. 浦东机场—上交大医学院:地铁 2 号线至世纪大道站,换乘 9 号线至马当路站路,出站步行 900 米
2. 虹桥机场—上交大医学院:地铁 10 号线至新天地站,出站步行 1000 米
3. 虹桥火车站—上交大医学院:地铁 10 号线至新天地站,出站步行 1000 米
4. 上海火车站—上交大医学院:建议打车,打车费用约 18 元
5. 上海火车南站—上交大医学院:地铁 1 号线至徐家汇站,换乘 9 号线至马当路站路,出站步行 900 米