基因组关联分析技术应用培训班

作者:   2017-03-22
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  • 会议时间: 2017-04-18至 2017-04-20
  • 会议地点: 北京
  • 电话:010-59371771
  • 传真:
  • 联系人:于瑞婷
  • Email: yurt@bcc.ac.cn
  • 联系地址:北京市海淀区永丰产业基地丰贤中路7号北科产业3号楼
  • 会议网址:http://dxy.me/YVVbA3

以「共变法」思想为核心的关联分析是研究人类复杂疾病的主要手段,其与以「求同法」思想为核心的「序列比对(Blast)」同样重要,但方法学却复杂得多。北京市计算中心生物计算事业部,主要针对具备一定统计学、遗传学、分子生物学基础的人类医学领域研究人员,特开设基因组关联分析培训班。 

主办单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会 

承办单位:北京市计算中心 

协办单位:

云计算关键技术与应用北京市重点实验室 

中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会 

北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心 

中国生物工程杂志 

北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司 

举办地点:北京,北京市海淀区丰贤中路 7 号北科产业 3 号楼 

培训时间:2017 年 4 月 18 日-4 月 20 日   上午 9:30-12:00,下午 13:30-17:30


日期

授课题目

授课内容

第一天

基因组关联分析理论基础

1. 基因组学与生物信息学概述;
2. 基于群体遗传的数据获取;
3. 基因组关联分析的原理、数模、策略及常用软件介绍;
4. 常用 GWAS 数据库介绍;

link 软件基础应用

5. Plink 软件应用;
6. Plink 文件格式生成与解析;
7. 等位基因频率计算;
8. 哈-温平衡计算; 

9. 目标区域数据提取;
10. 基因组关联分析流程;
11. 关联分析结果分析与 p 校正;

第二天

基因型填充 Imputation

12. 基因型填充 Imputation 的原理及应用;
13. Beagle 软件介绍与应用;
14. 基因组填充的方法与分析流程;
15. 1000 G 数据应用

link 软件进阶应用

16. 基于家系的关联分析;
17. 曼哈顿图的绘制与结果展示;
18.  SNP 位点的 condition 分析;
19. Meta gwas 数据分析;

第三天

Haploview 软件

20. Haploview 软件应用;
21. Haplotype 单倍型分析;
22. LD 连锁不平衡指数计算;
23. SNP marker 之间的 r2、D 值等计算;

Tassel 软件

24. Tassel 软件应用;
25. Tassel 基于命令行的批量数据分析;
26. 生物多样性指数、PCA、遗传距离计算等;

(课程内容以实际授课为准)

注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。 

培训特色

无需任何计算机语言基础 

深入简出,内容精要实用 

结合人类医学、动植物育种等生物学数据背景知识与实例讲授 

统计学原理+模型/算法+编程实现+生物医学应用 

边学边练,重实践,力求实效 

小班授课,个别辅导 

报名费用 

注册费:3500 元/人(含听课费、资料费、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)。 

付费方式

现金、支票、银行转账、银行汇款 

单位全称:北京市计算中心       账号:0200151819100023937  

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行 

(汇款信息里备注上:「生物计算事业部——您的姓名」) 

报名优惠政策

1. 2017 年 3 月 15 日前报名并缴费,可享受减免 300 元优惠; 

2. 3 人以上团体报名每人可减少 400 元; 

3. 4+1 团报,可免费赠送一个名额 

4. 上面 3 种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。 

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。 

联系咨询

QQ:2814500767

于老师   010-59341771,15600660904,邮箱:yurt@bcc.ac.cn 

员老师   010-59341773,18701529461, 邮箱:yuanll@bcc.ac.cn

编辑: 公开课管理员   

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