微生物组学分析研讨班

作者： 2017-03-22

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近年来，微生物组学在医疗、环保、资源开发、科研领域都发挥着举足轻重的作用，成为了上述领域必不可少的研究技术。在此，北京市计算中心生物部为您提供了最前沿、最实用的微生物组学课程《微生物组学分析研讨班》。为您在微生物组学研究中样品制备、实验设计、数据分析、结果展示等方面的困扰提供一键式解决方案。

专业一流的讲课老师团队将与您一起探讨科研奥秘、挖掘科学价值，为您拓宽科研思路、解决实验困扰。欢迎报名参加！

主办单位：中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会

承办单位：北京市计算中心

协办单位：

云计算关键技术与应用北京市重点实验室

中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会

北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心

中国生物工程杂志

北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司

培训地点：北京海淀区丰贤中路 7 号 3 号楼

培训时间：2017 年 4 月 28 日-30 日（报名中）上午：9:30-11:30 下午：13:30-17:00

日期	授课题目	授课内容
第一天上午	微生物组学研究的发展和挑战	1. 微生物组研究的发展历史 2. 测序平台介绍 3. 基于测序的研究方法 3.1 宏基因组（target sequencing 和全基因组） 3.2 单个微生物 de novo 测序 4. 应用案例分析
第一天下午	target sequencing 数据分析	1. linux 常用命令使用和上机操作 2. 数据分析过程中的编程简介（perl、R、python 等） 3. target sequencing 数据分析加上机 3.1 质控 3.2 去嵌合体 3.3 OTU 聚类 3.4 注释 3.5 统计分析：（1）α多样性分析；（2）β多样性分析；（3）群落结构及丰度分析；（4）进化分析；（5）差异分析 (Lefse)；（6）功能分析 (picrust)。
第二天全天	Whole metagenome 和 metatranscriptome 数据分析	1. 质控 2. 拼接组装：SOAPdenovo；MetaVelvet; Meta-IDBA 等 3. 聚类 Binning：TETRA; MetaCluster; Phymm 等 4. 基因注释：FragGeneScan；MetaGeneMark；MetaGeneAnnotator 等 5. 功能注释：RAMMCAP；Blast 等 6. 统计分析：（1）物种分析；（2）功能分析；（3）差异分析；（4）表达分析
第三天全天	微生物 de novo 测序分析	1. 质控 2. 单细胞测序去污染、去嵌合体等 3. 拼接组装：SPAdes 等 4. 基因预测 5. 功能注释 6. 代谢途径分析 7. 进化分析：（1）SNP；（2）插入缺失（3）水平基因转移； 8. 转录组分析：（1）基因差异表达分析；（2）代谢通路分析