浙江大学基因组科学研习班

作者:   2017-10-10
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  • 会议时间: 2017-11-17至 2017-11-24
  • 会议地点: 杭州市
  • 电话:18757558672
  • 传真:暂无
  • 联系人:代成林
  • Email: genetrain@zju.edu.cn
  • 联系地址:杭州(浙江大学华家池校区)
  • 会议网址:http://www.zcni.zju.edu.cn/

浙江大学基因组科学(第 33 期/总 53 期)研习班通知

总  期   数:53 期 
办 学 历 史:16 年(2002 年~2017 年)
开 班 时 间:2017 年 11 月 17 日~11 月 24 日(17 日为全天报到日,18 日开始上课)
上 课 地 点:杭州     浙江大学华家池校区

随着众多生物基因组测序项目的完成,生物学数据正在加速度增长。如何科学地分析和注释这些高通量数据,已成为生物学工作者急需学习和解决的问题。 

浙江大学「基因组科学」研习班邀请北京基因组所于军教授、胡松年教授为您讲授基因组学基础知识和前沿进展、基因转录组的测定及分析、二代测序等实验技术的关键事项;浙江大学杨军教授、陈铭教授等讲解系统生物学及高通量分析研究方法和思路。

本研习班多次获得浙江大学优秀项目创新奖,目前已举办 52 期,学员来自全国 30 余个省市,累计培训学员 5100 余名。每次研习班不乏教授、博导参加,更受到博士后、硕博生等年轻学者的青睐。

他们中有一些带着课题或问题前来交流和联系,不少学员通过本研习班建立了长期协作关系,共同申请国家 973、863 课题,共同发表论文,其中不少优秀的研究成果,已在 SCI 期刊上发表。

一、培训班上课内容
上课内容涵盖「基因组学—蛋白质组学—系统生物学」的研究方法、技术思路、前沿进展及其在各生物学科中的应用。
核心课程包括:
1. 基因组的比较研究、DNA 测序技术原理与进展(讲课人:于 军 教授)
2. 转录组的测定与分析、大规模测序方法及应用、微生物基因组学、基因组学与精准医学(讲课人:胡松年教授)
3. 系统生物学建模分析及高通量分析技术应用(讲课人:杨军、陈铭教授等)
4. 蛋白质组学概论及应用(讲课人:钟伯雄教授)

二、培训班上机内容
上机实习课采用 「跟我学」方式,学习实践各类基础生物信息学软件,每人一台 PC 机跟着大屏幕一步步学会基因组、蛋白质组学数据分析的基本方法。
主要内容如下:
实习一: 基因组数据注释和功能分析
通过序列比对工具 BLAST 的学习,了解基因功能注释的原理;介绍多序列联配工具 ClustalX 及分子进化分析软件 MEGA4,掌握系统发生树绘制的基本方法,认识基因复制在进化上的功能;学习基因序列分析常用的数据库和软件。
实习二: 转录组数据分析
介绍转录组数据分析的基本流程及其原理;通过对 tophat、cufflinks、R 等转录组数据分析工具的介绍及演示,了解基于二代测序数据的转录组分析流程及常用分析方法; 利用 kegg、GOstat、DAVID 等在线工具挖掘转录组数据的生物学意义。
实习三:系统生物学软件实习-----网络结构显示与分析
利用 Cytoscape 系统生物学分析软件,分析蛋白-蛋白相互作用,展示分子网络系统,并与基因表达等数据整合。
实习四:蛋白质结构与功能分析
从数据库搜索感兴趣的蛋白质氨基酸序列开始,接着对蛋白质基本理化性质、二级结构、和三维空间结构和序列模体进行分析,预测目标蛋白的生物功能。
实习五: 蛋白质组质谱分析
使用 X!Tandem、Mascot、Sequest 等软件鉴定蛋白质质谱数据,将质谱结果匹配到蛋白质组数据库鉴定蛋白;使用 TPP 软件包进行统计学分析和优化检索结果练习。

三、培训对象
1.      无生物信息学背景,希望了解生物信息学的学员;
2.      计划开展各类组学研究的科研人员;
3.      已有组学数据需了解分析方法的研究人员;
4.      有志从事生物信息学相关工作的学生或者技术人员。

四、报名方法
若有参加意向,请直接将回执发至 genetrain@zju.edu.cn,我们会即刻回函并在浙江大学继续教育系统录入,待排定课表后发给您详细课程表。待您再次确认后,发给您报到通知并排定上机号。培训结束,发放浙江大学继续教育证书。(尚有少量名额,请尽快报名)
点此下载回执>>

五、教材「DNA 和蛋白质序列数据分析工具」(第三版), 薛庆中等编著,科学出版社出版 2012 年 6 月发行。会务组提供。

六、其他事项
收费标准:注册费为¥3800/人(可转账、现金、刷卡【含公务卡】)。

食宿可统一安排,费用自理。
联 系 人:代成林 18757558672       咨询电话:0571-88206579
电子邮件地址:genetrain@zju.edu.cn;daichenglin@zju.edu.cn。

编辑: 刘跃    来源:丁香园

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