表观遗传与 DNA 甲基化数据分析上机实操班

作者:   2018-04-04
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  • 会议时间: 2017-11-24至 2017-11-27
  • 会议地点: 重庆
  • 电话:15131335232
  • 传真:暂无
  • 联系人:康乐
  • Email: 274260631@qq.com
  • 联系地址:暂无
  • 会议网址:暂无

一、培训特色:主题明确,针对性强,理论和实践结合,主讲与学员研讨的方式进行;   授课专家拥有丰富的表观遗传学数据分析和项目执行经验;   课下主讲老师为您所遇到的问题提供个性化解答;   配合研究中所需的要点, 围绕实际研究中常用的软件展开;   学员通过与专家直接交流,能够分享到顶尖学术机构的研究经验和实验设计思路。  

二、培训内容  
6. 常用在线工具和数据库使用操作       

DNA 甲基化原理及数据分析
(1)DNA 甲基化原理、应用及研究方法、微生物基因组      
1. 甲基化特异性的 PCR(Methylation-specific PCR,MSP)     
2. 亚硫酸氢盐测序法(Bisulfite sequencing PCR,BSP)     
3. 高分辨率熔解曲线法(High Resolution Melting,HRM)
4. 比较各项甲基化研究方法存在的优缺点等 

(2)DNA 甲基化数据分析策略 
1.WGBS 分析:利用 fastqc 和 perl 脚本对原始数据进行质控      
2. 之后用 bismark 进行 mapping 和 beta 值计算      
3.R 的 methylKit 包筛选差异甲基化位点并用 pheatmap 包和 ggplot2 包进行可视化      
4.PeakAnnotator 对这些位点进行功能域和基因注释,最后用 DAVID 进行 GO 和 KEGG 通路注释 DNA 甲基化调控案例讲解   

(3)DNA 甲基化芯片数据分析上机实战 
1. 芯片 DNA 甲基化分析     
2. 利用 R 的 IMA 包进行差异甲基化位点鉴定并用 pheatmap 包和 ggplot2 包进行可视化,用 DAVID 进行 GO 和 KEGG 通路注释     

染色质及组蛋白修饰实战 
1. 染色质可及性测序技术   
2. 组蛋白修饰原理与分子功能   
3. 组蛋白修饰功能   
4. 核小体定位图谱分析实战练习   
5. 组蛋白修饰数据分析实战练习一   
6. 组蛋白修饰数据分析实战练习二      

干细胞与表观遗传学研究 
1. 还原真实染色,质构象--HiC 技术   
2.TCGA 与 ICGC,数据库介绍与使用 
3. 干细胞的表观遗传学研究   
4. 转录因子 ChIP-seq 数据分析   
5. 生存曲线分析  

非编码 RNA 研究及数据分析  
1.miRNA 研究的综合解决方案; 
2.miRNA 研究的数据分析(芯片、测序); 
3.lncRNA 研究的综合解决方案;
4.lncRNA 研究的数据分析(芯片、测序); 
5.Agilent 相关技术在非编码 RNA 研究中的应用。  

三、报名办法及费用:每人¥3900 元(含报名费、培训费、资料费等相关费用,不含食宿费用),食宿可统一安排,费用自理。优惠政策:同一单位 5 人同时报名,可免 1 人费用。

四、联系方式:
联系人:康乐 
联系电话:151 3133 5232
座     机:010-58032788
报名邮箱:274260631@qq.com

编辑: 姚俊华   

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