perl语言零基础培训班

Perl语言作为绝大多数生物信息学工作者首选语言之一。北京市计算中心生物计算事业部针对没有任何计算机语言的生物学、医学、农学等人员，且有从事生物信息学工作相关研究工作的需要。欢迎您报名参加！

主办单位：北京市计算中心，生物计算事业部

举办地：北京，北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

培训时间：2013年7月23日-26日

报名截止：2013年 7月23日

培训内容及安排：

第一天

09:30-10:00  生物信息学与Perl语言概述，概括介绍生物信息学背景与Perl语言的概念及特点

10:00-10:20  软件安装与运行环境调试，Perl语言解释器、编辑器安装，Perl程序运行测试

10:20-12:00  基本操作与基本概念，DOS、Unix命令行操作基本命令；Perl语言基本变量与操作符

13:30-16:00  基本变量，变量、字符串赋值、基本运算等练习

第二天

09:30-12:00  基本语法结构，判断结构；循环结构；练习

13:30-16:00  数组及应用，数组的概念及用法；练习

第三天

09:30-11:00  文件与文件夹操作，文件的读入与输入；文件夹操作；练习

11:00-12:00  二维数组与hash表及应用，二维数组概念、关联数组(hash表)概念及用法；练习

13:30-16:00  常用函数及子程序，常用Perl语言基础函数学习；子程序概念与应用；练习

第四天

09:30-12:00  正则表达式及生物信息学Perl程序实例，Perl特色功能正则表达式学习与应用；生物信息学实例程序学习；练习

13:30-16:00  Bioperl简介、CPAN简介、常用生物信息学数据库与软件简介，Bioperl简介与安装；Perl第三方代码库CPAN简介；常用生物信息学数据库简介、数据类型与应用；常用生物信息学软件数据格式及软件应用简介

授课实例：

1、生物学数据文件批量的合并、分隔、去冗余等；

2、生物信息序列数据fastq、fasta、genbank文件等格式转换与批量自动化处理；

3、按个性化实验需求，从生物信息学数据库文件（如genbank、EMBL）中批量自动化提取特定数据信息；

4、表格矩阵型数据的行列转换、特定数据信息的自动化过滤与数据筛选等；

5、二代测序原始数据的批量过滤处理，如barcode识别、质量值过滤等；

6、基因、蛋白质序列特定位点的识别，如起始、终止位点、ORF、motif、CDS等；

7、生物信息学数据序列特征提取与自动化统计，如GC百分含量、k-mer统计、基因反向互补转换等；

8、生物信息学数据库文件的批量自动化下载与信息提取（选学）。

13年暑期课程安排：

6.16-6.19（已圆满结束）、7.23-26（报名中）、8.26-29（未启动报名）、9.22-25（未启动报名）

培训特色：

1、对口生物信息；

2、非严格语法，适合初学；

3、功能强大、跨平台；

4、有巨大的第三方代码库CPAN

报名费用：

注册费：2800元/人（含听课费、资料费、上机费、午餐，请自带笔记本电脑以备上机实践使用），主办方可协助安排入住酒店，住宿费用自理。

付费方式：

现金、支票、银行转账、银行汇款

单位全称：北京市计算中心      账号：0200151819100023937

开户银行：中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

（汇款信息里 备注上：“生物计算事业部——您的姓名”）

报名优惠政策：

1、开课前20天报名的学员每人可减少200元；

2、3人以上团体报名的学员每人可减少200元；

3、任意两班同时报名可减少300元；

4、4+1团报，可免费赠送一个名额；

5、4种优惠政策不能同时享受，只能享受其中一种，适用于所有培训班。

联系咨询：

张利英 010-59341771 ,18618295767，QQ号：2814500767，邮箱：zhangly@bcc.ac.cn

员丽丽 010-59341773, 18701529461 ,  邮箱：yuanll@bcc.ac.cn

网址：http://www.bioc.org.cn/China/

编辑： 小蒋