perl语言零基础培训班

作者:   2013-07-05
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  • 会议时间: 2013-07-23至 2013-07-26
  • 会议地点: 北京
  • 电话:010-59341771
  • 传真:
  • 联系人:张利英
  • Email: zhangly@bcc.ac.cn
  • 联系地址:北京市海淀区永丰产业基地丰贤中路7号
  • 会议网址:http://www.bioc.org.cn/China/

Perl语言作为绝大多数生物信息学工作者首选语言之一。北京市计算中心生物计算事业部针对没有任何计算机语言的生物学、医学、农学等人员,且有从事生物信息学工作相关研究工作的需要。欢迎您报名参加!

主办单位:北京市计算中心,生物计算事业部

举办地:北京,北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

培训时间:2013年7月23日-26日

报名截止:2013年 7月23日

培训内容及安排:

第一天

09:30-10:00  生物信息学与Perl语言概述,概括介绍生物信息学背景与Perl语言的概念及特点

10:00-10:20  软件安装与运行环境调试,Perl语言解释器、编辑器安装,Perl程序运行测试

10:20-12:00  基本操作与基本概念,DOS、Unix命令行操作基本命令;Perl语言基本变量与操作符

13:30-16:00  基本变量,变量、字符串赋值、基本运算等练习

第二天

09:30-12:00  基本语法结构,判断结构;循环结构;练习

13:30-16:00  数组及应用,数组的概念及用法;练习

第三天

09:30-11:00  文件与文件夹操作,文件的读入与输入;文件夹操作;练习

11:00-12:00  二维数组与hash表及应用,二维数组概念、关联数组(hash表)概念及用法;练习

13:30-16:00  常用函数及子程序,常用Perl语言基础函数学习;子程序概念与应用;练习

第四天

09:30-12:00  正则表达式及生物信息学Perl程序实例,Perl特色功能正则表达式学习与应用;生物信息学实例程序学习;练习

13:30-16:00  Bioperl简介、CPAN简介、常用生物信息学数据库与软件简介,Bioperl简介与安装;Perl第三方代码库CPAN简介;常用生物信息学数据库简介、数据类型与应用;常用生物信息学软件数据格式及软件应用简介

授课实例:

1、生物学数据文件批量的合并、分隔、去冗余等;

2、生物信息序列数据fastq、fasta、genbank文件等格式转换与批量自动化处理;

3、按个性化实验需求,从生物信息学数据库文件(如genbank、EMBL)中批量自动化提取特定数据信息;

4、表格矩阵型数据的行列转换、特定数据信息的自动化过滤与数据筛选等;

5、二代测序原始数据的批量过滤处理,如barcode识别、质量值过滤等;

6、基因、蛋白质序列特定位点的识别,如起始、终止位点、ORF、motif、CDS等;

7、生物信息学数据序列特征提取与自动化统计,如GC百分含量、k-mer统计、基因反向互补转换等;

8、生物信息学数据库文件的批量自动化下载与信息提取(选学)。

13年暑期课程安排:

6.16-6.19(已圆满结束)、7.23-26(报名中)、8.26-29(未启动报名)、9.22-25(未启动报名)

培训特色:

1、对口生物信息;

2、非严格语法,适合初学;

3、功能强大、跨平台;

4、有巨大的第三方代码库CPAN

报名费用:

注册费:2800元/人(含听课费、资料费、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用),主办方可协助安排入住酒店,住宿费用自理。

付费方式:

现金、支票、银行转账、银行汇款

单位全称:北京市计算中心      账号:0200151819100023937

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

(汇款信息里 备注上:“生物计算事业部——您的姓名”)

报名优惠政策:

1、开课前20天报名的学员每人可减少200元;

2、3人以上团体报名的学员每人可减少200元;

3、任意两班同时报名可减少300元;

4、4+1团报,可免费赠送一个名额;

5、4种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种,适用于所有培训班。

联系咨询:

张利英 010-59341771 ,18618295767,QQ号:2814500767,邮箱:zhangly@bcc.ac.cn

员丽丽 010-59341773, 18701529461 ,  邮箱:yuanll@bcc.ac.cn

网址:http://www.bioc.org.cn/China/

编辑: 小蒋   

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