实用生物信息技术及应用讲习班

作者:   2013-07-05
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  • 会议时间: 2013-08-05至 2013-08-09
  • 会议地点: 北京
  • 电话:010-59341771
  • 传真:
  • 联系人:张利英
  • Email: zhangly@bcc.ac.cn
  • 联系地址:北京市海淀区永丰产业基地丰贤中路7号
  • 会议网址:http://www.bioc.org.cn/China/

为推广生物信息技术在分子生物学研究和开发中的应用,北京市计算中心生物部将于2013年8/5-8/9日举办《实用生物信息技术及应用》讲习班,特邀北京大学生命科学学院罗静初教授为本讲习班主讲教师。欢迎全国生命科学、基础医学、农林科学等领域大专院校、科研机构、公司企业从事分子生物学、生物化学、遗传学、基因组学等研究、开发和教学的第一线研发人员和青年教师、博士后和高年级研究生参加。本讲习班以上机实习为主、课堂讲授为辅,解决问题为主、掌握工具为辅,介绍如何利用丰富的网络生物信息资源和免费生物信息软件,解决研究课题中的实际问题。特别欢迎学员带着自己课题研究中的具体问题参加讲习班,边学边用。

课程内容:


1、网络生物信息资源;NCBI免费书籍Bookshelf;EBI网络生物信息教程Training Online;NCBI文献检索和管理系统MyNCB;基于结构的生物大分子月报Molecule of the Month;基于功能的蛋白质分子精选Protein Spotlight

2、常用生物信息数据库简介;核酸序列数据库GenBank和RefSeq;蛋白质序列数据库UniProt;蛋白质结构数据库PDB和蛋白质结构分类数据库;蛋白质家族、蛋白质结构域、蛋白质相互作用数据库;基因组浏览器和基因组注释系统Ensembl使用实例;小鼠、斑马鱼、拟南芥等模式生物基因组数据库;植物转录因子、叶片衰老等专用数据库

3、蛋白质序列数据库Swiss-Prot序列条目详解;Swiss-Prot数据库序列条目中的一般注释信息;Swiss-Prot数据库序列条目中的序列注释信息;Swiss-Prot数据库序列条目中的交叉链接

4、数据库检索和数据库搜索;UniProt数据库高级检索策略及应用实例;SRS综合数据库检索系统应用实例;NCBI数据库相似性搜索系统Blast详解;基于Windows和Linux的本地Blast安装和使用

5、常用生物信息分析平台和软件工具;基于浏览器的大型生物信息分析平台WebLab详解和使用;系统发育软件MEGA及其在分子进化中的应用实例;分子模拟软件Swiss-PDBViewer及其在蛋白质结构分析中的应用;基于Linux的大型生物信息软件包EMBOSS简介;基于Java的桌面分析软件包Jemboss简介

6、生物信息技术应用实例;河豚鱼基因组序列片段及多药耐药基因MDR序列分析;豌豆叶绿体内膜蛋白PPF-1及其编码基因核酸和蛋白质序列分析;斑头雁血红蛋白序列、结构和功能关系及分子演化;癌胚抗原结构分析和蛋白质结构同源模;富含半胱氨酸蛋白质和多肽分子序列和结构特征;植物特异转录因子SBP家族起源和演化

详见http://abc.cbi.pku.edu.cn,请自带Windows系统笔记本电脑。

主讲教师:

北京大学生物信息中心罗静初教授,博士生导师,欧洲分子生物学网络组织中国节点负责人,Briefings in Bioinformatics和BMC Bioinformatics等杂志编委。1970年毕业于北京大学生物系,1987.11-1989.5 赴美国马里兰大学从事蛋白质分子模型和计算机在分子生物学中应用研究,1991-99先后5次赴英国帝国癌症研究所从事蛋白质分子模型和数据库构建等研究。1996年起主持863、973、NSFC、科技部、教育部、北京市科委等项目,主要从事比较基因组和植物转录调控生物信息学研究、生物信息软件平台开发和生物信息数据库构建;已发表学术论文50多篇,主持翻译《生物信息学概论》、合作编写《生物信息学》、《分子生物学前沿技术》等著作。曾多次组织国际、国内生物信息讨论会、讲习班。自2000年起,为北京大学生命科学学院和中国农业科学院研究生院开设“实用生物信息技术”研究生课程。

时间地点:

2013年8/5(星期一)- 8/9(星期五) ,上午8:30-11:30,下午1:30-4:30,晚上小组讨论。

北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼北京市计算中心培训室

住宿安排:

为保证学习效率,本培训班限定60人,讲习班为全体学员统一预订神州商旅酒店永丰店,费用自理(双人标准间优惠价119元/天/人,单人大床间优惠价238元/天/人)。宾馆离上课地点约3.5公里,每天两次专车接送。

收费标准:

注册费:3000元/人,包括学费、资料费、午餐费等。此培训班不享受优惠政策。

付费方式:现金、支票、银行转账、银行汇款

单位全称:北京市计算中心

账    号:0200151819100023937

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

(请在汇款明细中注明“生物计算事业部——学员姓名”)

联系方式:

张利英 电话:010-59341771  手机:18618295767  邮箱:zhangly@bcc.ac.cn  QQ:2814500767

员丽丽 电话:010-59341773

手机:18701529461  邮箱:yuanll@bcc.ac.cn

编辑: 小蒋   

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