重庆思影科技有限公司将于 2018 年 6 月 30 日-- 2018 年 7 月 3 日 (周六-下周二) 举办第一届动物磁共振脑影像数据处理班(详见课表安排)。
1、培训简介
近年来,世界各国都颁布了各自的脑科学计划,旨在探究大脑运作的神经机制,以推动神经、精神疾病临床、人工智能等领域的发展。运用功能、DTI 等磁共振成像技术,各国研究者已取得了广泛成就,顶级期刊上磁共振脑成像相关研究也屡见不鲜。人类磁共振研究虽占据主流,然而一些特殊工作只适合动物研究,因此,针对啮齿类、以及一些非人灵长类动物的研究得到了重视。目前,结合基因、光遗传等技术,基于动物模型的磁共振成像已在抑郁症、卒中、疼痛、老年退行性疾病等领域取得进展,为推动脑科学研究的发展起到了极大的作用。动物磁共振研究和人类具有差异,如脑结构的不同等等,因而数据分析成为了啮齿类动物磁共振脑影像研究者们的难题。
为此,思影科技拟举办动物磁共振影像数据处理培训班,欢迎致力于动物磁共振脑影像的研究者参加,希望通过此次培训,熟练掌握数据处理技能,为开展的研究项目助力。
2、培训对象
本次培训班面向的对象是一些希望利用动物磁共振脑影像进行科研的医生、研究人员等,培训班实行小班教学,授课、操作、指导及问题解决一体化,最终努力使参会学员达到能够独立进行数据处理的目的。
培训内容主要包括:Rat fMRI 数据处理、Rat 脑功能指标计算及其统计分析、Rat DTI 数据处理和基于 ROI 的脑影像分析、Rat 概率性纤维束跟踪等。
注:如方便,请于会议开始前一天到达会场(9:00 - 21:00)熟悉场地及安装软件、拷贝资料等事宜。
3、课程安排
时间
课程名
主要内容
第一天
吴国榕
6 月 30 日
上午
Rat fMRI 数据处理
l Rat fMRI 简介
l 数据整理及格式转换
l MRIcron 简介
下午
l Matlab 基本操作
l SPM 数据分析原理和流程
l Rat fMRI 数据处理操作
l 数据处理质量检查
第二天
吴国榕
7 月 1 日
上午
Rat 脑功能指标计算
及其统计分析
l 基于 GLM 的任务态分析
l ALFF、ReHo 指标计算
l ROI 绘制与数据提取
下午
l 种子点功能连接计算
l 基于 SPM、SPSS 的统计分析 (t 检验,方差分析及多重比较校正等)
晚上
l 体素水平的统计结果报告
l 可视化作图
第三天
谢桑马
7 月 2 日
上午
Rat DTI 数据处理
和基于 ROI 的脑影像分析
l 扩散磁共振成像基本原理介绍
l DTI 数据基本分析方法概述
l Linux 常用命令及相关软件介绍
l DTI 数据的预处理
下午
l 扩散张量及相关指标计算
l ROI 的提取
l ROI 的配准和空间转换
l 基于 ROI 的 DTI 相关指标分析
第四天
谢桑马
7 月 3 日
上午
Rat 概率性纤维束跟踪
l 概率性纤维束跟踪的基本原理
l 概率性纤维束跟踪的模型构建
l 概率性纤维束跟踪的实现
l 概率性纤维束跟踪的结果查看
l 概率性纤维束跟踪的量化统计
l 基于概率纤维跟踪的网络构建
下午
4、培训地点
重庆市渝中区青年路 38 号重庆国贸中心 2004#,具体见会议指南。
5、培训人数
为保证培训质量,此次培训限定人数 20 人左右,报名请从速。
6、培训费用
所有参会人员 3000/人(含资料费、培训费和午餐费,交通及住宿费自理)。
7、报名方式
请将报名回执发送至:syfmri@163.com。
8、缴费方式
银行转账或者支付宝(18580429226,户名:杨晓飞),谢绝录像,主办方提供发票。
9、联系方式
联系人:彭庭烨。电话:023-63084468/15123187262。
10、备注
请各位培训学员自带笔记本电脑(windows 64 位系统、i5、8 G 内存、50 G 剩余存储空间等基本配置);学员自己有数据的可以带 3-5 例进行现场处理;并在 6 月 20 日前进行缴费及将回执表发给彭小姐,便于培训安排。
报名回执表
单位名称
(发票抬头)
姓名
性别
QQ
电话号码
科室/专业
缴费方式
□转帐 □支付宝 (请选择在□打√)
银行信息
户名:重庆思影科技有限公司
账号:123909127710102
开户银行:招商银行重庆分行渝中支行
汇款备注
第一届动物磁共振脑影像数据处理培训班
注:请完整填写回执表后回传给我们,以便给你发送确认函,谢谢支持!
11、在线支持服务
参加培训学员将得到在线技术支持服务,伴随参加培训班的学员共同成长。
12、培训人员简介:
吴国榕,博士,西南大学心理学部副研究员。主要研究方向是基于神经影像数据的动态脑功能活动和脑连接分析算法开发。相关文章发表在 Medical
Image Analysis,Brain Stimulation 等学术期刊上。开发了 Brain GPS,NICE 和 DynamicBC (http://restfmri.net/forum/DynamicBC) 等数据分析软件。目前,主持一项国自然青年项目,参与多项国自然面上和重点项目。
谢桑马,博士,2017 年 1 月毕业于中国科学院自动化研究所。主要研究方向为扩散磁共振成像的计算理论和方法、脑影像数据分析软件开发以及扩散磁共振成像在精神疾病中的应用。扩散磁共振成像分析软件 DiffusionKit 的主要开发者,获得软件著作权一项。熟练掌握扩散磁共振成像领域的主流方法,精通相关软件的操作使用。目前,已在 PLOS ONE、Journal of
euroscience Methods、Translational Psychiatry 等国际杂志以第一作者发表 SCI 论文 3 篇,参与多项国家自然基金项目,同时担任国际期刊 IEEE Transactions on
Medical Imaging 等杂志审稿人。