第八期基于 TCGA 及 SEER 等癌症公共数据库的信息挖掘和科研设计会议

作者:   2018-06-07
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身处大数据时代,对于从事肿瘤研究的临床医生或基础科研人员,有没有一种可以既不做实验又不查病史,直接调用公共数据撰写发表 SCI 论文的方法呢? TCGA 和 SEER 等癌症公共数据库即提供了这样一种可能。TCGA(癌症基因组图谱)数据库包括常见癌症的基因组、转录组、蛋白组、表观遗传组数据和与其关联的临床数据,为挖掘有意义的组学变化和发现肿瘤发生、发展、转移等生物学机制提供了海量数据。美国的 SEER(癌症监测、流行病学和结果)数据库是较为典型的临床医学数据库,由美国国立癌症研究所(National Cancer Institute,NCI)于 1973 年所建立,其后每年定期更新,是北美最具代表性的大型肿瘤登记注册数据库之一,收集了各个癌种的临床病理信息和预后数据,并向全世界免费开放,为临床医师的循证实践及临床研究提供了宝贵的第一手资料。据不完全统计,全世界基于 TCGA 和 SEER 数据挖掘产生的文章已经超过 2000 篇,其中不乏最顶尖的学术期刊文章,这一数目还在不断增长中。传统的临床医生和科研工作者缺乏相关知识基础来处理这些癌症大数据,因而在面对这些极有价值的组学和临床数据时,往往心有余而力不足。本课程将从临床应用视角介绍 TCGA、SEER 及其他癌症公共数据库的基本情况、数据库结构、获取方式及基本统计方法等,深度解析近年来国内外基于 TCGA 和 SEER 数据的经典分析案例,重点对癌症公共数据库的数据挖掘和课题设计进行讨论,最后也将探讨在此基础上的基金申请、SCI 论文撰写策略。会议详情有关事宜通知如下:
一、时间地点:                  2018 年 7 月 6 日---7 月 8 日    广州                                                                  (时间安排:第一天报到 ,授课两天)
二、学习目标:     本次会议提供了一次系统掌握 TCGA 和 SEER 等癌症公共数据库数据结构、挖掘方法及分析流程的机会,目的在于助力有志于利用这些公共数据库的临床医生以及转化研究的科研人员,帮助研究者去更好地挖掘利用这些免费的公共数据。本次会议不侧重于深入的生物信息学分析讲授,拟解决的问题包括:
1、如何基于 TCGA 及 SEER 等癌症公共数据库设计课题;
2、TCGA 及 SEER 数据库的数据下载;
3、获取数据后如何分析;
4、如何在此基础上撰写 SCI 论文及申请科研基金。
三、授课方式:
1、上机操作;
2、专题小组研讨与案例讲解分析结合;    
3、课程讲座;      (主题明确,针对性强。专题小组研讨与案例讲解分析结合。)
报名方式:请各单位接此通知后,尽快确定参会人员,认真填写报名回执并传真至:0371-86073066 或发 E-mail 至: szkxwyt@126.com ,会务组收到回执后将通知相关报到事宜。
联系方式:联系人:武桐 15838346159(同微信)      
E_mail:szkxwyt@126.com
qq;821087538
课程大纲
第一天上午:TCGA 数据库入门
1.TCGA 数据库基本概念介绍及数据获取
2. 高通量组学研究基础知识
3. 几篇基于 TCGA 数据库发表文章的深度解析
4. 上机操作实战:
TCGA 数据获取
第一天下午:SEER 数据库挖掘
1.SEER 数据库入门(软件安装、数据获取、数据检索)几篇基于 SEER 数据库发表文章的深度解析
3. 上机操作实战:SEER 数据库注册、数据获得、处理和分析
第二天上午:
TCGA 和 SEER 数据深度挖掘
1. 如何利用 TCGA 进行数据挖掘及临床转化课题设计
2. 精准医学时代,如何利用公共癌症组学数据助力科研 3. 上机操作实战:基于 TCGA 和 SEER 数据挖掘和分析实战
第二天下午:标书论文撰写与实用统计方法
1. 医学基金标书撰写技巧
2. SCI 论文撰写技巧
3. 实用科研统计方法介绍
4. 上机实战:实用科研统计方法实战——以 GraphPad 软件使用为例自带笔记本电脑,安装 WINDOWS 操作系统,需要 SPSS、R、GraphPad Prism 5、SEER*Stat 以及 Office Excel 2007 以上版本等软件。

编辑: 会议君   

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